Журнал: Лабораторная служба. 2019;8(1): 65-72
С.В. АНДРЕЕВА, Н.Э. ХАЙДАРШИНА, Д.Ю. НОХРИН
Кафедра микробиологии, иммунологии и общей биологии ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет», Челябинск, Россия
РЕЗЮМЕ
Анализ динамики видовой структуры микробных сообществ в ходе течения раневой инфекции может вызывать серьезные сложности, поскольку на фоне антимикробной терапии в естественных поливидовых биопленках на поверхности ожоговых ран происходит смена видового состава возбудителей инфекции.
Цель исследования — демонстрация информативности методов описательной статистики, количественных методов микробной экологии и анализа зависимостей для изучения динамики микробных сообществ в ходе течения ожоговой болезни.
Материал и методы. В исследование были включены 57 пациентов, госпитализированных в Челябинский областной ожоговый центр, из ран которых было изолировано 595 штаммов условно-патогенных бактерий, выделенных в монокультуре или составе микробных ассоциаций. Для выявления стабильных ассоциаций и оценки зависимости локализации ожога и времени, прошедшего с момента травмы, использовали расчет индексов сходства Жаккара и канонический анализ соответствий. Динамику встречаемости микроорганизмов в ране оценивали в ходе регрессионного анализа с использованием обобщенной аддитивной модели для биномиального отклика.
Результаты. На примере анализа видового состава микробных сообществ ожоговых ран с 4-го по 30-й день ожоговой травмы установлено, что первичные контаминанты ран, характерные для нормальной микробиоты кожи (Staphylococcus saprophyticus и Staphylococcus epidermidis), сменялись на представителей микробиоты кишечника (Escherichia coli и Proteus spp.). Из ожогов области головы и туловища чаще выделяли Staphylococcus saprophyticus, Escherichia coli, Proteus spp., Klebsiella pneumoniae, в микробиоте ожогов верхних конечностей преобладал Staphylococcus epidermidis. На присутствие в ранах таких стабильно доминирующих возбудителей гнойных осложнений, как Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter baumannii, не влияли время с момента травмы и локус ожога. Выявлена высокая степень экологической общности A. baumannii — S. aureus (коэффициент Жаккара CJ =0,442; n=95; р=0,001) и S. aureus — P. aeruginosa (CJ =0,430; n=93; р=0,05). Отмечено, что смена видового состава микроорганизмов происходит в процессе антибиотикотерапии.
Выводы. Результаты проведенного исследования демонстрируют возможность использования методов описательной статистики, количественных методов микробной экологии и поиска зависимостей для изучения динамики микробного пейзажа.
