microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

Главные новости

slider-image

Стратегии вакцинации COVID-19: в каких случаях одна доза лучше двух?

При определенных условиях вакцинация большего числа людей одной дозой замедляет распространение вируса.    Во многих частях мира предложение вакцин COVID-19 продолжает отставать от спроса. Хотя большинство вакцин рассчитаны на две дозы, некоторые страны, например Канада, отдают предпочтение вакцинации как можно большего числа людей одной дозой, прежде чем выдавать дополнительную дозу.    В журнале Chaos исследователи из Франкфуртской школы финансов и менеджмента и Калифорнийского университета иллюстрируют условия, при которых кампания по вакцинации "prime first" (сначала первая) является наиболее эффективной для остановки распространения вируса. Кампания "prime first" не предполагает, что люди должны получить только одну дозу вакцины. Напротив, она подчеркивает необходимость как можно быстрее вакцинировать большое количество людей, а затем ввести вторую дозу. В сравнении с этим, кампания по вакцинации "prime boost" ставит во главу угла полную вакцинацию меньшего числа людей.    С иммунологической точки зрения, сценарий получения двойной дозы вакцины всегда лучше. Однако в условиях ограничения поставок преимущества вакцинации вдвое большего числа людей могут перевесить преимущества двойной дозы. Ученые смоделировали передачу COVID-19 с использованием параметров восприимчивости, воздействия, инфицирования, выздоровления, летального исхода. Каждое из этих состояний болезни ассоциируется с определенным сегментом, содержащим отдельных людей. Переходы между сегментами зависят от параметров развития заболевания, таких как трансмиссивность вируса.    Каждый сегмент далее делится на невакцинированных, частично вакцинированных и полностью вакцинированных людей. Исследователи сравнили показатели каждой вакцинной группы с другими в различных условиях. "У нас есть гигантская степень неопределенности относительно параметров COVID-19", - сказал автор исследования Ян Наглер. "Мы признаем, что не знаем точных значений, поэтому мы делаем выборку по всему пространству параметров. Мы даем хорошее представление о том, когда кампании prime first лучше с точки зрения спасения жизней, чем prime boost вакцинация".   Исследователи обнаружили, что скорость ослабления вакцины является критически важным фактором при принятии решения. Если ослабление, или снижение эффективности вакцины, слишком сильно после однократной дозы, стратегия вакцинации двойной дозой часто является лучшим вариантом. Однако стратегия вакцинации меняется, если скорость ослабления после однократной дозы становится ближе к скорости ослабления после двукратной дозы.    "Наши результаты показывают, что более точные оценки скорости ослабления иммунитета важны для принятия решения о том, являются ли протоколы " prime first" более эффективными, чем "prime boost" вакцинация", - считает Наглер.   По мере того, как научное сообщество будет собирать больше данных о вакцинации COVID-19, ученые надеются, что эта модель станет еще более информативной для экспертов в области общественного здравоохранения и политиков, которые должны принять решение за или против определенного протокола вакцинации.
slider-image

Бактериальные инфекции в пазухах пациентов с муковисцидозом имеют удивительное сходство

Совместная работа микробиологов, клиницистов и экспертов по эволюции бактерий показала, что со временем высокоадаптированные сообщества бактерий в пазухах людей с муковисцидозом (МВ) становятся более фрагментированными и подвергаются мутациям, которые разрушают их геномы.     Это открытие, бросающее вызов догмам, заставило ученых по-новому взглянуть на эволюцию микроорганизмов при хронических инфекциях. В статье, опубликованной в журнале Cell Reports, исследователи из Медицинской школы Питтсбургского университета сообщают, что размер и структура популяций Pseudomonas aeruginosa широко варьируют в синусах. Они обнаружили, что эта так называемая биогеография в месте инфекции оказывает фундаментальное влияние на эволюцию бактерий во время хронических инфекций.    "Давнее воззрение в области муковисцидоза утверждает, что инфекция каждого пациента рассказывает свою уникальную историю, и что Pseudomonas эволюционирует непредсказуемым образом", - говорит руководитель исследования Дженнифер Бомбергер. "Используя инструменты эволюционной биологии, мы показали, что эта сложная и громоздкая проблема может быть упрощена - эти бактерии следуют общим тенденциям, которые коренятся в эволюционной биологии, и изучение этих тенденций может помочь нам создать более эффективные вмешательства".    Муковисцидоз - неизлечимое генетическое заболевание, которым страдают десятки тысяч людей по всему миру и поскольку их иммунная система нарушена, пациенты с МВ также страдают от частых бактериальных и грибковых инфекций, которые сначала проникают в носовые пазухи, а затем распространяются в нижние дыхательные пути, где они сеют хаос и могут усугубить существующие проблемы с дыханием. Несмотря на то, что бактериальные инфекции ассоциируются с худшими исходами болезни у пациентов с МВ, врачи мало знают о том, как эти инфекции зарождаются.   "Пазухи - это как Дикий Запад", - говорит ведущий автор исследования Кэтрин Армбрустер. "Поразительно, как мало мы знаем об эволюции Pseudomonas в верхних дыхательных путях. Нет четкого руководства по лечению хронических инфекций пазух при муковисцидозе. Даже если эти инфекции синусов, вероятно, заносят бактерии в легкие, неясно, взаимодействуют ли эти две популяции и как".    Вдохновленные исследованиями древних взаимоотношений между бактериями и их хозяевами - насекомыми, ученые использовали передовые исследования генома и современные методы визуализации для анализа популяций P. aeruginosa, взятых из пазух пациентов с МВ. Их анализ показал, что эволюция P. aeruginosa проходит в два этапа. На патоадаптивной стадии бактерии образуют большое сообщество, в котором большинство сохраняющихся мутаций приносят адаптивную пользу. Но со временем, в ходе хронических инфекций, популяции бактерий могут накапливать не очень полезные мутации и фрагментироваться. Эволюция на этой стадии напоминает то, что происходит в бактериях, живущих симбиотически внутри насекомых, где генетический дрейф играет большую роль в этих небольших популяциях, и геномы бактерий начинают разрушаться.    Это понимание может сыграть важную роль в переосмыслении терапевтических подходов к лечению хронических бактериальных инфекций: вместо того чтобы ориентироваться на мутации "отвлекающего маневра", исследователи предлагают обратить внимание на мутации, вызванные сильнейшим эволюционным давлением, и на модели геномной адаптации и эрозии. "Геномы могут дать нам более полную картину истории бактериальных линий, бумов и спадов, через которые прошла популяция", - говорит Армбрустер. "Возможно, пациенты с муковисцидозом не так уж и непохожи друг на друга в том, как развиваются их инфекции".   "Существует идея, что ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции", - добавляет она. "Но мы также можем перефразировать это утверждение: ничто в эволюции не имеет смысла, кроме как в свете размера и структуры популяции".Catherine R. Armbruster et al. Адаптация и геномная эрозия во фрагментированных популяциях Pseudomonas aeruginosa в синусах людей с муковисцидозом (аннотация).   Известно, что Pseudomonas aeruginosa адаптируется к дыхательным путям людей с муковисцидозом (МВ), но как меняется биогеография очага инфекции и связанные с ней эволюционные процессы по мере развития пожизненной инфекции, остается неясным. В данном исследовании мы проверяем гипотезу о том, что ранние адаптации, способствующие агрегации, влияют на эволюционно-генетические траектории, изучая продольный анализ P. aeruginosa из пазух носа шести взрослых людей с МВ. Линии с высокой степенью адаптации к хозяину несли в себе генотипы мутаторов, демонстрирующие признаки ранней деградации генома, связанной с недавним ослаблением хозяина.    Используя передовой метод визуализации (MiPACT-HCR [microbial identification after passive clarity technique-идентификация микроорганизмов после пассивного метода определения четкости]), мы обнаружили, что структура популяции зависит от деградации генома, причем наиболее адаптированные к хозяину штаммы P. aeruginosa с деградированным геномом (мутаторы) обитают в небольших, редких агрегатах. Мы предполагаем, что после первоначальной адаптивной эволюции в более крупных популяциях в условиях сильного отбора на агрегацию, P. aeruginosa сохраняется в небольших, фрагментированных популяциях, которые испытывают более сильное влияние генетического дрейфа. Такие условия обогащают мутаторов и способствуют дегенеративной эволюции генома.    Наши результаты подчеркивают важность биогеографии очагов инфекции для эволюции патогена.
slider-image

NIH утверждает, что грантодатель не сообщил об эксперименте в Ухани, в ходе которого был создан вирус летучей мыши, вызывающий заболевание мышей

EcoHealth Alliance нарушил условия гранта, говорится в письме республиканцам из Палаты представителей.    Продолжающиеся споры о том, что считать вирусологическими исследованиями, которые слишком опасны для проведения, и финансировало ли правительство США исследования в Китае, которые нарушили политику, запрещающую финансирование таких рискованных исследований, приняли новый оборот. В очередной раз отрицая, что они помогли создать вирус, который вызвал пандемию COVID-19, Национальные институты здравоохранения США (NIH) в письме, направленном вчера республиканцам в Конгрессе, заявили, что эксперименты, которые они финансировали через базирующуюся в США некоммерческую организацию в 2018 и 2019 годах в Уханьском институте вирусологии (WIV) в Китае, привели к "неожиданному результату" - созданию коронавируса, который был более заразен для мышей.    NIH утверждает, что организация, владеющая материнским грантом, EcoHealth Alliance, не смогла немедленно сообщить агентству об этом результате, как того требовалось. Недавно опубликованный отчет о ходе выполнения гранта также показывает, что EcoHealth и WIV проводили эксперименты по изменению вируса, вызывающего ближневосточный респираторный синдром (MERS), что вызывает дополнительные вопросы.   NIH отметил в своем письме, что когда агентство рассмотрело первоначальное предложение EcoHealth по гранту, оно определило, что предложенные эксперименты - разработанные для определения того, могут ли определенные коронавирусы летучих мышей заразить человека - не соответствуют определению так называемых экспериментов по усилению функции (GOF), которые могут сделать патогены более опасными для человека.    Это письмо подстегивает критиков NIH, которые говорят, что руководители агентства не были откровенны с Конгрессом по поводу работы, которую NIH поддерживал в Китае, многие из которых считают, что WIV мог создать SARS-CoV-2, вирус, вызвавший нынешнюю пандемию. В то же время, в недавно опубликованном анализе NIH подчеркивает, что любые вирусы, изучаемые в WIV в рамках гранта, были слишком эволюционно далеки от SARS-CoV-2, чтобы трансформироваться в него.    NIH направил письмо от 20 октября представителю Джеймсу Комеру (R-KY), члену комитета по надзору Палаты представителей, вместе с окончательным отчетом о ходе выполнения гранта EcoHealth Alliance, который NIH финансировал, а затем отменил по указанию тогдашнего президента Дональда Трампа (позже он был восстановлен, но с условиями, которые, по словам EcoHealth, он не смог выполнить). В отчете описываются исследования, проведенные в WIV с июня 2018 года по июнь 2019 года на недавно выделенных коронавирусах летучих мышей, циркулирующих в дикой природе в Китае. В некоторых из них изучалось, могут ли их белки спайков, которые вирусы используют для присоединения к клеткам и инфицирования, при экспрессии в ранее известном коронавирусе летучих мышей под названием WIV1 связываться с клеточным рецептором ангиотензин-конвертирующего фермента 2 человека в мышиной модели.    В "ограниченном эксперименте" мыши, инфицированные одной из этих химер, SHC014 WIV1, "заболели сильнее, чем мыши, инфицированные коронавирусом летучей мыши WIV1". Как иногда случается в науке, это был неожиданный результат... в отличие от того, что исследователи собирались сделать", - говорится в письме главного заместителя директора NIH Лоуренса Табака.    До того, как работа над химерами была профинансирована, NIH определил, что она не является GOF-исследованием, включающим то, что NIH называет "усиленными патогенами с пандемическим потенциалом", поскольку ни новые коронавирусы летучих мышей, ни WIV1 не были известны как вирусы, способные заразить человека, говорится в письме. Однако в письме говорится, что условия гранта предусматривали, что если эксперименты с вирусами дадут определенные результаты, например, "увеличение роста [вируса] на один лог", то компания EcoHealth должна "немедленно" проинформировать NIH, и что NIH проведет "вторичную проверку" исследования, чтобы выяснить, следует ли его переоценить или ввести новые меры биобезопасности.    Но "Ecohealth не сообщила об этом открытии сразу, как того требовали условия гранта", - говорится в письме. В письме говорится, что у EcoHealth теперь есть 5 дней, чтобы представить все неопубликованные данные по проекту.    EcoHealth одобрил заявление NIH о том, что не они создавали SARS-CoV-2, но также оспорил письмо агентства в своем заявлении: "Как заявляет NIH, наука однозначно утверждает: ни один из коронавирусов, исследованных EcoHealth Alliance, не имеет достаточно близкого сходства с вирусом, вызывающим COVID-19, чтобы сыграть какую-либо роль в его появлении. EcoHealth Alliance работает с NIH, чтобы оперативно устранить то, что мы считаем неправильным представлением о требованиях к отчетности по гранту и о том, что показали данные нашего исследования. Эти данные были представлены сразу же, как только мы узнали об этом, в нашем отчете за четвертый год исследования в апреле 2018 года. NIH проанализировал эти данные и не указал на необходимость вторичного пересмотра нашего исследования, более того, финансирование на 5-й год было разрешено без задержек. Мы также работаем над тем, чтобы ответить на любые вопросы NIH относительно исследований по этому гранту R01, которые в настоящее время не ведутся".    Критики NIH, утверждающие, что агентство лгало о работе, которую оно финансировало в WIV, набросились на это письмо. Микробиолог из Университета Ратгерса Ричард Эбрайт, известный критик исследований GOF, прокомментировал письмо в твиттере: "NIH исправляет лживые утверждения директора NIH [Фрэнсиса] Коллинза и директора NIAID [Национального института аллергии и инфекционных заболеваний] [Энтони] Фаучи о том, что NIH не финансировал исследования по усилению функций вирусов в Ухани".   Вирусологи, изучившие грант EcoHealth, разошлись во мнениях относительно того, соответствуют ли эксперименты с химерами американскому определению исследования GOF, вызывающего обеспокоенность, согласно статье, опубликованной в прошлом месяце в The Intercept. Эта медиа-организация, которая подала иск в соответствии с законами об открытых источниках информации, чтобы заставить NIH опубликовать окончательный отчет о проделанной работе, отметила, что в отчете также подробно описаны химерные эксперименты с вирусом MERS, который инфицирует человека; в отчете EcoHealth описывается изменение связывающих свойств белка спайка вируса MERS. Один вирусолог сказал изданию The Intercept, что эксперимент был "своего рода безумием" и "определенно усиливающим функцию вируса" исследованием.   Вместе с письмом в Конгресс NIH приложил и разместил в Интернете новый анализ, в котором утверждается, что вирусы, изученные в WIV в рамках гранта, имеют не более 96%-97% сиквенсов общих с SARS-CoV-2, что отделяет эти вирусы "десятилетиями" эволюции. "Естественно встречающиеся коронавирусы летучих мышей, изученные в рамках гранта NIH, генетически далеки от SARS-CoV-2 и не могли стать причиной пандемии COVID-19. Любые утверждения об обратном являются заведомо ложными", - говорится в заявлении агентства.
slider-image

Вирусные инфекции могут способствовать развитию нейродегенерации

Некоторые вирусные заболевания могут способствовать нейродегенерации.     Об этом сообщают исследователи в журнале Nature Communications. Их оценка основана на лабораторных экспериментах, в которых они смогли показать, что определенные вирусные молекулы способствуют межклеточному распространению белковых агрегатов, которые являются отличительными признаками таких заболеваний мозга, как болезнь Альцгеймера. Эти выводы могут дать представление о том, как острые или хронические вирусные инфекции могут способствовать нейродегенерации.   Агрегаты неправильно сформированных белков, которые возникают при так называемых прионных заболеваниях, таких как болезнь Крейтцфельдта-Якоба, обладают способностью переходить из одной клетки в другую, где они передают свою аномальную форму белкам того же вида. В результате болезнь распространяется по всему мозгу. Аналогичное явление обсуждается в отношении болезней Альцгеймера и Паркинсона, при которых также наблюдаются агрегаты неправильно сформированных белков. Передача агрегатов может включать прямой контакт между клетками, выход "голых" агрегатов во внеклеточное пространство или упаковку в везикулы - крошечные пузырьки, окруженные липидной оболочкой, которые выделяются для связи между клетками.   "Точные механизмы передачи неизвестны", - говорит руководитель исследования Ина Ворберг. "Однако очевидно, что агрегатный обмен как при прямом контакте клеток, так и через везикулы зависит от лиганд-рецепторных взаимодействий. Это связано с тем, что в обоих сценариях мембраны должны контактировать и сливаться. Этому способствует наличие лигандов, которые связываются с рецепторами на поверхности клетки и затем вызывают слияние двух мембран".    Основываясь на этом предположении, сотрудники Ворберг провели обширную серию исследований с различными клеточными культурами. При этом они изучали межклеточный перенос либо прионов, либо агрегатов белков тау, как это происходит при прионных заболеваниях, болезни Альцгеймера и других "тауопатиях". Имитируя процессы, происходящие в результате вирусной инфекции, исследователи заставляли клетки вырабатывать вирусные белки, которые способствуют связыванию клеток-мишеней и слиянию мембран.    В качестве основных обьектов были выбраны два белка: SARS-CoV-2 спайковый белок S и гликопротеин вируса везикулярного стоматита VSV-G, который присутствует в патогене, заражающем крупный рогатый скот и других животных. Причем клетки экспрессировали рецепторы для этих вирусных белков, а именно рецепторы семейства LDL, которые действуют как стыковочные порты для VSV-G, и человеческий ACE2, рецептор для белка шипа. "Мы смогли показать, что вирусные белки включаются как в клеточную мембрану, так и во внеклеточные везикулы. Их присутствие увеличивало распространение белковых агрегатов между клетками, как при прямом контакте клеток, так и через внеклеточные везикулы". "Вирусные лиганды опосредовали эффективный перенос агрегатов в клетки-реципиенты, где они индуцировали образование новых агрегатов. Лиганды действуют как ключи, которые отпирают клетки-реципиенты и таким образом доставляют опасный груз", -    говорит Ворберг. "Конечно, наши клеточные модели не воспроизводят многие аспекты работы мозга с его очень специализированными типами клеток. Однако, независимо от типа клеток, продуцирующих патологические агрегаты, присутствие вирусных лигандов явно увеличивало распространение неправильно сформированных белков в другие клетки. В целом, наши данные свидетельствуют о том, что вирусные лиганд-рецепторные взаимодействия в принципе могут влиять на передачу патологических белков. Это новое открытие".    "Мозг пациентов, страдающих от нейродегенеративных заболеваний, иногда содержит некоторые вирусы. Предполагается, что они вызывают воспаление или оказывают токсическое действие, тем самым ускоряя нейродегенерацию. Однако вирусные белки могут действовать и по-другому: они могут усиливать межклеточное распространение белковых агрегатов, уже происходящее при нейродегенеративных заболеваниях, таких как болезнь Альцгеймера", - говорит Ворберг.    "Конечно, это требует дальнейших исследований нейротропных вирусов. Очевидно, что влияние вирусных инфекций на нейродегенеративные заболевания заслуживает глубокого изучения".Shu Liu et al. Высокоэффективное межклеточное распространение неправильного фолдинга белков, опосредованное вирусными лиганд-рецепторными взаимодействиями (аннотация).   Белковые агрегаты, связанные с нейродегенеративными заболеваниями, обладают способностью передаваться непораженным клеткам, тем самым шаблонизируя собственную аберрантную конформацию на растворимые гомотипические белки. Протеопатические агрегаты могут высвобождаться во внеклеточное пространство, секретироваться вместе с внеклеточными везикулами (EV) или обмениваться при прямом контакте между клетками. Степень вклада каждого из этих путей в прионоподобное распространение неправильного фолдинга белков неясна.    Обмен клеточным грузом как при прямом контакте с клеткой, так и через EV зависит от взаимодействия рецептор-лиганд. Мы предположили, что включение этих взаимодействий посредством вирусных лигандов усиливает межклеточную передачу протеопатических агрегатов. Используя различные клеточные модели, распространяющие прионы или патогенные агрегаты тау, мы продемонстрировали, что гликопротеин вируса везикулярного стоматита и SARS-CoV-2 S-спайковый белок увеличивают индукцию агрегатов при контакте с клетками или декорированными лигандами EV. Таким образом, взаимодействие рецептор-лиганд является важным фактором, определяющим распространение межклеточных агрегатов.     Наши данные позволяют предположить, что вирусные инфекции способствуют распространению протеопатических агрегатов, облегчая межклеточный перенос грузов.

Популярные новости

Стратегии вакцинации COVID-19: в каких случаях одна доза лучше двух?

При определенных условиях вакцинация большего числа людей одной дозой замедляет распространение вируса.

   Во многих частях мира предложение вакцин COVID-19 продолжает отставать от спроса. Хотя большинство вакцин рассчитаны на две дозы, некоторые страны, например Канада, отдают предпочтение вакцинации как можно большего числа людей одной дозой, прежде чем выдавать дополнительную дозу.

   В журнале Chaos исследователи из Франкфуртской школы финансов и менеджмента и Калифорнийского университета иллюстрируют условия, при которых кампания по вакцинации "prime first" (сначала первая) является наиболее эффективной для остановки распространения вируса. Кампания "prime first" не предполагает, что люди должны получить только одну дозу вакцины. Напротив, она подчеркивает необходимость как можно быстрее вакцинировать большое количество людей, а затем ввести вторую дозу. В сравнении с этим, кампания по вакцинации "prime boost" ставит во главу угла полную вакцинацию меньшего числа людей.

   С иммунологической точки зрения, сценарий получения двойной дозы вакцины всегда лучше. Однако в условиях ограничения поставок преимущества вакцинации вдвое большего числа людей могут перевесить преимущества двойной дозы. Ученые смоделировали передачу COVID-19 с использованием параметров восприимчивости, воздействия, инфицирования, выздоровления, летального исхода. Каждое из этих состояний болезни ассоциируется с определенным сегментом, содержащим отдельных людей. Переходы между сегментами зависят от параметров развития заболевания, таких как трансмиссивность вируса.

   Каждый сегмент далее делится на невакцинированных, частично вакцинированных и полностью вакцинированных людей. Исследователи сравнили показатели каждой вакцинной группы с другими в различных условиях. "У нас есть гигантская степень неопределенности относительно параметров COVID-19", - сказал автор исследования Ян Наглер. "Мы признаем, что не знаем точных значений, поэтому мы делаем выборку по всему пространству параметров. Мы даем хорошее представление о том, когда кампании prime first лучше с точки зрения спасения жизней, чем prime boost вакцинация".

   Исследователи обнаружили, что скорость ослабления вакцины является критически важным фактором при принятии решения. Если ослабление, или снижение эффективности вакцины, слишком сильно после однократной дозы, стратегия вакцинации двойной дозой часто является лучшим вариантом. Однако стратегия вакцинации меняется, если скорость ослабления после однократной дозы становится ближе к скорости ослабления после двукратной дозы.

   "Наши результаты показывают, что более точные оценки скорости ослабления иммунитета важны для принятия решения о том, являются ли протоколы " prime first" более эффективными, чем "prime boost" вакцинация", - считает Наглер.

   По мере того, как научное сообщество будет собирать больше данных о вакцинации COVID-19, ученые надеются, что эта модель станет еще более информативной для экспертов в области общественного здравоохранения и политиков, которые должны принять решение за или против определенного протокола вакцинации.

Бактериальные инфекции в пазухах пациентов с муковисцидозом имеют удивительное сходство

Совместная работа микробиологов, клиницистов и экспертов по эволюции бактерий показала, что со временем высокоадаптированные сообщества бактерий в пазухах людей с муковисцидозом (МВ) становятся более фрагментированными и подвергаются мутациям, которые разрушают их геномы. 

   Это открытие, бросающее вызов догмам, заставило ученых по-новому взглянуть на эволюцию микроорганизмов при хронических инфекциях. В статье, опубликованной в журнале Cell Reports, исследователи из Медицинской школы Питтсбургского университета сообщают, что размер и структура популяций Pseudomonas aeruginosa широко варьируют в синусах. Они обнаружили, что эта так называемая биогеография в месте инфекции оказывает фундаментальное влияние на эволюцию бактерий во время хронических инфекций.

   "Давнее воззрение в области муковисцидоза утверждает, что инфекция каждого пациента рассказывает свою уникальную историю, и что Pseudomonas эволюционирует непредсказуемым образом", - говорит руководитель исследования Дженнифер Бомбергер. "Используя инструменты эволюционной биологии, мы показали, что эта сложная и громоздкая проблема может быть упрощена - эти бактерии следуют общим тенденциям, которые коренятся в эволюционной биологии, и изучение этих тенденций может помочь нам создать более эффективные вмешательства".

   Муковисцидоз - неизлечимое генетическое заболевание, которым страдают десятки тысяч людей по всему миру и поскольку их иммунная система нарушена, пациенты с МВ также страдают от частых бактериальных и грибковых инфекций, которые сначала проникают в носовые пазухи, а затем распространяются в нижние дыхательные пути, где они сеют хаос и могут усугубить существующие проблемы с дыханием. Несмотря на то, что бактериальные инфекции ассоциируются с худшими исходами болезни у пациентов с МВ, врачи мало знают о том, как эти инфекции зарождаются.

   "Пазухи - это как Дикий Запад", - говорит ведущий автор исследования Кэтрин Армбрустер. "Поразительно, как мало мы знаем об эволюции Pseudomonas в верхних дыхательных путях. Нет четкого руководства по лечению хронических инфекций пазух при муковисцидозе. Даже если эти инфекции синусов, вероятно, заносят бактерии в легкие, неясно, взаимодействуют ли эти две популяции и как".

   Вдохновленные исследованиями древних взаимоотношений между бактериями и их хозяевами - насекомыми, ученые использовали передовые исследования генома и современные методы визуализации для анализа популяций P. aeruginosa, взятых из пазух пациентов с МВ. Их анализ показал, что эволюция P. aeruginosa проходит в два этапа. На патоадаптивной стадии бактерии образуют большое сообщество, в котором большинство сохраняющихся мутаций приносят адаптивную пользу. Но со временем, в ходе хронических инфекций, популяции бактерий могут накапливать не очень полезные мутации и фрагментироваться. Эволюция на этой стадии напоминает то, что происходит в бактериях, живущих симбиотически внутри насекомых, где генетический дрейф играет большую роль в этих небольших популяциях, и геномы бактерий начинают разрушаться.

   Это понимание может сыграть важную роль в переосмыслении терапевтических подходов к лечению хронических бактериальных инфекций: вместо того чтобы ориентироваться на мутации "отвлекающего маневра", исследователи предлагают обратить внимание на мутации, вызванные сильнейшим эволюционным давлением, и на модели геномной адаптации и эрозии. "Геномы могут дать нам более полную картину истории бактериальных линий, бумов и спадов, через которые прошла популяция", - говорит Армбрустер. 

"Возможно, пациенты с муковисцидозом не так уж и непохожи друг на друга в том, как развиваются их инфекции".

   "Существует идея, что ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции", - добавляет она. "Но мы также можем перефразировать это утверждение: ничто в эволюции не имеет смысла, кроме как в свете размера и структуры популяции".

Catherine R. Armbruster et al. Адаптация и геномная эрозия во фрагментированных популяциях Pseudomonas aeruginosa в синусах людей с муковисцидозом (аннотация).

   Известно, что Pseudomonas aeruginosa адаптируется к дыхательным путям людей с муковисцидозом (МВ), но как меняется биогеография очага инфекции и связанные с ней эволюционные процессы по мере развития пожизненной инфекции, остается неясным. В данном исследовании мы проверяем гипотезу о том, что ранние адаптации, способствующие агрегации, влияют на эволюционно-генетические траектории, изучая продольный анализ P. aeruginosa из пазух носа шести взрослых людей с МВ. Линии с высокой степенью адаптации к хозяину несли в себе генотипы мутаторов, демонстрирующие признаки ранней деградации генома, связанной с недавним ослаблением хозяина.

   Используя передовой метод визуализации (MiPACT-HCR [microbial identification after passive clarity technique-идентификация микроорганизмов после пассивного метода определения четкости]), мы обнаружили, что структура популяции зависит от деградации генома, причем наиболее адаптированные к хозяину штаммы P. aeruginosa с деградированным геномом (мутаторы) обитают в небольших, редких агрегатах. Мы предполагаем, что после первоначальной адаптивной эволюции в более крупных популяциях в условиях сильного отбора на агрегацию, P. aeruginosa сохраняется в небольших, фрагментированных популяциях, которые испытывают более сильное влияние генетического дрейфа. Такие условия обогащают мутаторов и способствуют дегенеративной эволюции генома. 

   Наши результаты подчеркивают важность биогеографии очагов инфекции для эволюции патогена.


NIH утверждает, что грантодатель не сообщил об эксперименте в Ухани, в ходе которого был создан вирус летучей мыши, вызывающий заболевание мышей

EcoHealth Alliance нарушил условия гранта, говорится в письме республиканцам из Палаты представителей.

   Продолжающиеся споры о том, что считать вирусологическими исследованиями, которые слишком опасны для проведения, и финансировало ли правительство США исследования в Китае, которые нарушили политику, запрещающую финансирование таких рискованных исследований, приняли новый оборот. В очередной раз отрицая, что они помогли создать вирус, который вызвал пандемию COVID-19, Национальные институты здравоохранения США (NIH) в письме, направленном вчера республиканцам в Конгрессе, заявили, что эксперименты, которые они финансировали через базирующуюся в США некоммерческую организацию в 2018 и 2019 годах в Уханьском институте вирусологии (WIV) в Китае, привели к "неожиданному результату" - созданию коронавируса, который был более заразен для мышей.

   NIH утверждает, что организация, владеющая материнским грантом, EcoHealth Alliance, не смогла немедленно сообщить агентству об этом результате, как того требовалось. Недавно опубликованный отчет о ходе выполнения гранта также показывает, что EcoHealth и WIV проводили эксперименты по изменению вируса, вызывающего ближневосточный респираторный синдром (MERS), что вызывает дополнительные вопросы.

   NIH отметил в своем письме, что когда агентство рассмотрело первоначальное предложение EcoHealth по гранту, оно определило, что предложенные эксперименты - разработанные для определения того, могут ли определенные коронавирусы летучих мышей заразить человека - не соответствуют определению так называемых экспериментов по усилению функции (GOF), которые могут сделать патогены более опасными для человека.

   Это письмо подстегивает критиков NIH, которые говорят, что руководители агентства не были откровенны с Конгрессом по поводу работы, которую NIH поддерживал в Китае, многие из которых считают, что WIV мог создать SARS-CoV-2, вирус, вызвавший нынешнюю пандемию. В то же время, в недавно опубликованном анализе NIH подчеркивает, что любые вирусы, изучаемые в WIV в рамках гранта, были слишком эволюционно далеки от SARS-CoV-2, чтобы трансформироваться в него.

   NIH направил письмо от 20 октября представителю Джеймсу Комеру (R-KY), члену комитета по надзору Палаты представителей, вместе с окончательным отчетом о ходе выполнения гранта EcoHealth Alliance, который NIH финансировал, а затем отменил по указанию тогдашнего президента Дональда Трампа (позже он был восстановлен, но с условиями, которые, по словам EcoHealth, он не смог выполнить). В отчете описываются исследования, проведенные в WIV с июня 2018 года по июнь 2019 года на недавно выделенных коронавирусах летучих мышей, циркулирующих в дикой природе в Китае. В некоторых из них изучалось, могут ли их белки спайков, которые вирусы используют для присоединения к клеткам и инфицирования, при экспрессии в ранее известном коронавирусе летучих мышей под названием WIV1 связываться с клеточным рецептором ангиотензин-конвертирующего фермента 2 человека в мышиной модели.

   В "ограниченном эксперименте" мыши, инфицированные одной из этих химер, SHC014 WIV1, "заболели сильнее, чем мыши, инфицированные коронавирусом летучей мыши WIV1". Как иногда случается в науке, это был неожиданный результат... в отличие от того, что исследователи собирались сделать", - говорится в письме главного заместителя директора NIH Лоуренса Табака.

   До того, как работа над химерами была профинансирована, NIH определил, что она не является GOF-исследованием, включающим то, что NIH называет "усиленными патогенами с пандемическим потенциалом", поскольку ни новые коронавирусы летучих мышей, ни WIV1 не были известны как вирусы, способные заразить человека, говорится в письме. Однако в письме говорится, что условия гранта предусматривали, что если эксперименты с вирусами дадут определенные результаты, например, "увеличение роста [вируса] на один лог", то компания EcoHealth должна "немедленно" проинформировать NIH, и что NIH проведет "вторичную проверку" исследования, чтобы выяснить, следует ли его переоценить или ввести новые меры биобезопасности.

   Но "Ecohealth не сообщила об этом открытии сразу, как того требовали условия гранта", - говорится в письме. В письме говорится, что у EcoHealth теперь есть 5 дней, чтобы представить все неопубликованные данные по проекту.

   EcoHealth одобрил заявление NIH о том, что не они создавали SARS-CoV-2, но также оспорил письмо агентства в своем заявлении: "Как заявляет NIH, наука однозначно утверждает: ни один из коронавирусов, исследованных EcoHealth Alliance, не имеет достаточно близкого сходства с вирусом, вызывающим COVID-19, чтобы сыграть какую-либо роль в его появлении. EcoHealth Alliance работает с NIH, чтобы оперативно устранить то, что мы считаем неправильным представлением о требованиях к отчетности по гранту и о том, что показали данные нашего исследования. Эти данные были представлены сразу же, как только мы узнали об этом, в нашем отчете за четвертый год исследования в апреле 2018 года. NIH проанализировал эти данные и не указал на необходимость вторичного пересмотра нашего исследования, более того, финансирование на 5-й год было разрешено без задержек. Мы также работаем над тем, чтобы ответить на любые вопросы NIH относительно исследований по этому гранту R01, которые в настоящее время не ведутся".

   Критики NIH, утверждающие, что агентство лгало о работе, которую оно финансировало в WIV, набросились на это письмо. Микробиолог из Университета Ратгерса Ричард Эбрайт, известный критик исследований GOF, прокомментировал письмо в твиттере: "NIH исправляет лживые утверждения директора NIH [Фрэнсиса] Коллинза и директора NIAID [Национального института аллергии и инфекционных заболеваний] [Энтони] Фаучи о том, что NIH не финансировал исследования по усилению функций вирусов в Ухани".

  Вирусологи, изучившие грант EcoHealth, разошлись во мнениях относительно того, соответствуют ли эксперименты с химерами американскому определению исследования GOF, вызывающего обеспокоенность, согласно статье, опубликованной в прошлом месяце в The Intercept. Эта медиа-организация, которая подала иск в соответствии с законами об открытых источниках информации, чтобы заставить NIH опубликовать окончательный отчет о проделанной работе, отметила, что в отчете также подробно описаны химерные эксперименты с вирусом MERS, который инфицирует человека; в отчете EcoHealth описывается изменение связывающих свойств белка спайка вируса MERS. Один вирусолог сказал изданию The Intercept, что 

эксперимент был "своего рода безумием" и "определенно усиливающим функцию вируса" исследованием.

   Вместе с письмом в Конгресс NIH приложил и разместил в Интернете новый анализ, в котором утверждается, что вирусы, изученные в WIV в рамках гранта, имеют не более 96%-97% сиквенсов общих с SARS-CoV-2, что отделяет эти вирусы "десятилетиями" эволюции. "Естественно встречающиеся коронавирусы летучих мышей, изученные в рамках гранта NIH, генетически далеки от SARS-CoV-2 и не могли стать причиной пандемии COVID-19. Любые утверждения об обратном являются заведомо ложными", - говорится в заявлении агентства.

Вирусные инфекции могут способствовать развитию нейродегенерации

Некоторые вирусные заболевания могут способствовать нейродегенерации. 

   Об этом сообщают исследователи в журнале Nature Communications. Их оценка основана на лабораторных экспериментах, в которых они смогли показать, что определенные вирусные молекулы способствуют межклеточному распространению белковых агрегатов, которые являются отличительными признаками таких заболеваний мозга, как болезнь Альцгеймера. Эти выводы могут дать представление о том, как острые или хронические вирусные инфекции могут способствовать нейродегенерации.

   Агрегаты неправильно сформированных белков, которые возникают при так называемых прионных заболеваниях, таких как болезнь Крейтцфельдта-Якоба, обладают способностью переходить из одной клетки в другую, где они передают свою аномальную форму белкам того же вида. В результате болезнь распространяется по всему мозгу. Аналогичное явление обсуждается в отношении болезней Альцгеймера и Паркинсона, при которых также наблюдаются агрегаты неправильно сформированных белков. Передача агрегатов может включать прямой контакт между клетками, выход "голых" агрегатов во внеклеточное пространство или упаковку в везикулы - крошечные пузырьки, окруженные липидной оболочкой, которые выделяются для связи между клетками.

   "Точные механизмы передачи неизвестны", - говорит руководитель исследования Ина Ворберг. "Однако очевидно, что агрегатный обмен как при прямом контакте клеток, так и через везикулы зависит от лиганд-рецепторных взаимодействий. Это связано с тем, что в обоих сценариях мембраны должны контактировать и сливаться. Этому способствует наличие лигандов, которые связываются с рецепторами на поверхности клетки и затем вызывают слияние двух мембран".

   Основываясь на этом предположении, сотрудники Ворберг провели обширную серию исследований с различными клеточными культурами. При этом они изучали межклеточный перенос либо прионов, либо агрегатов белков тау, как это происходит при прионных заболеваниях, болезни Альцгеймера и других "тауопатиях". Имитируя процессы, происходящие в результате вирусной инфекции, исследователи заставляли клетки вырабатывать вирусные белки, которые способствуют связыванию клеток-мишеней и слиянию мембран.

   В качестве основных обьектов были выбраны два белка: SARS-CoV-2 спайковый белок S и гликопротеин вируса везикулярного стоматита VSV-G, который присутствует в патогене, заражающем крупный рогатый скот и других животных. Причем клетки экспрессировали рецепторы для этих вирусных белков, а именно рецепторы семейства LDL, которые действуют как стыковочные порты для VSV-G, и человеческий ACE2, рецептор для белка шипа. "Мы смогли показать, что вирусные белки включаются как в клеточную мембрану, так и во внеклеточные везикулы. Их присутствие увеличивало распространение белковых агрегатов между клетками, как при прямом контакте клеток, так и через внеклеточные везикулы". 

"Вирусные лиганды опосредовали эффективный перенос агрегатов в клетки-реципиенты, где они индуцировали образование новых агрегатов. Лиганды действуют как ключи, которые отпирают клетки-реципиенты и таким образом доставляют опасный груз", -

   говорит Ворберг. "Конечно, наши клеточные модели не воспроизводят многие аспекты работы мозга с его очень специализированными типами клеток. Однако, независимо от типа клеток, продуцирующих патологические агрегаты, присутствие вирусных лигандов явно увеличивало распространение неправильно сформированных белков в другие клетки. В целом, наши данные свидетельствуют о том, что вирусные лиганд-рецепторные взаимодействия в принципе могут влиять на передачу патологических белков. Это новое открытие".

   "Мозг пациентов, страдающих от нейродегенеративных заболеваний, иногда содержит некоторые вирусы. Предполагается, что они вызывают воспаление или оказывают токсическое действие, тем самым ускоряя нейродегенерацию. Однако вирусные белки могут действовать и по-другому: они могут усиливать межклеточное распространение белковых агрегатов, уже происходящее при нейродегенеративных заболеваниях, таких как болезнь Альцгеймера", - говорит Ворберг. 

   "Конечно, это требует дальнейших исследований нейротропных вирусов. Очевидно, что влияние вирусных инфекций на нейродегенеративные заболевания заслуживает глубокого изучения".

Shu Liu et al. Высокоэффективное межклеточное распространение неправильного фолдинга белков, опосредованное вирусными лиганд-рецепторными взаимодействиями (аннотация).

   Белковые агрегаты, связанные с нейродегенеративными заболеваниями, обладают способностью передаваться непораженным клеткам, тем самым шаблонизируя собственную аберрантную конформацию на растворимые гомотипические белки. Протеопатические агрегаты могут высвобождаться во внеклеточное пространство, секретироваться вместе с внеклеточными везикулами (EV) или обмениваться при прямом контакте между клетками. Степень вклада каждого из этих путей в прионоподобное распространение неправильного фолдинга белков неясна.

   Обмен клеточным грузом как при прямом контакте с клеткой, так и через EV зависит от взаимодействия рецептор-лиганд. Мы предположили, что включение этих взаимодействий посредством вирусных лигандов усиливает межклеточную передачу протеопатических агрегатов. Используя различные клеточные модели, распространяющие прионы или патогенные агрегаты тау, мы продемонстрировали, что гликопротеин вируса везикулярного стоматита и SARS-CoV-2 S-спайковый белок увеличивают индукцию агрегатов при контакте с клетками или декорированными лигандами EV. Таким образом, взаимодействие рецептор-лиганд является важным фактором, определяющим распространение межклеточных агрегатов. 

   Наши данные позволяют предположить, что вирусные инфекции способствуют распространению протеопатических агрегатов, облегчая межклеточный перенос грузов.

Новости
Стратегии вакцинации COVID-19: в каких случаях одна доза лучше двух?
#эпидемиология #вакцинация #sars-cov-2 #covid-19
При определенных условиях вакцинация большего числа людей одной дозой замедляет распространение вируса.    Во многих частях мира предложение вакцин COVID-19 продолжает отставать от спроса. Хотя большинство вакцин рассчитаны на две дозы, некоторые страны, например Канада, отдают предпочтение вакцинации как можно большего числа людей одной дозой, прежде чем выдавать дополнительную дозу.    В журнале Chaos исследователи из Франкфуртской школы финансов и менеджмента и Калифорнийского университета иллюстрируют условия, при которых кампания по вакцинации "prime first" (сначала первая) является наиболее эффективной для остановки распространения вируса. Кампания "prime first" не предполагает, что люди должны получить только одну дозу вакцины. Напротив, она подчеркивает необходимость как можно быстрее вакцинировать большое количество людей, а затем ввести вторую дозу. В сравнении с этим, кампания по вакцинации "prime boost" ставит во главу угла полную вакцинацию меньшего числа людей.    С иммунологической точки зрения, сценарий получения двойной дозы вакцины всегда лучше. Однако в условиях ограничения поставок преимущества вакцинации вдвое большего числа людей могут перевесить преимущества двойной дозы. Ученые смоделировали передачу COVID-19 с использованием параметров восприимчивости, воздействия, инфицирования, выздоровления, летального исхода. Каждое из этих состояний болезни ассоциируется с определенным сегментом, содержащим отдельных людей. Переходы между сегментами зависят от параметров развития заболевания, таких как трансмиссивность вируса.    Каждый сегмент далее делится на невакцинированных, частично вакцинированных и полностью вакцинированных людей. Исследователи сравнили показатели каждой вакцинной группы с другими в различных условиях. "У нас есть гигантская степень неопределенности относительно параметров COVID-19", - сказал автор исследования Ян Наглер. "Мы признаем, что не знаем точных значений, поэтому мы делаем выборку по всему пространству параметров. Мы даем хорошее представление о том, когда кампании prime first лучше с точки зрения спасения жизней, чем prime boost вакцинация".   Исследователи обнаружили, что скорость ослабления вакцины является критически важным фактором при принятии решения. Если ослабление, или снижение эффективности вакцины, слишком сильно после однократной дозы, стратегия вакцинации двойной дозой часто является лучшим вариантом. Однако стратегия вакцинации меняется, если скорость ослабления после однократной дозы становится ближе к скорости ослабления после двукратной дозы.    "Наши результаты показывают, что более точные оценки скорости ослабления иммунитета важны для принятия решения о том, являются ли протоколы " prime first" более эффективными, чем "prime boost" вакцинация", - считает Наглер.   По мере того, как научное сообщество будет собирать больше данных о вакцинации COVID-19, ученые надеются, что эта модель станет еще более информативной для экспертов в области общественного здравоохранения и политиков, которые должны принять решение за или против определенного протокола вакцинации.
Бактериальные инфекции в пазухах пациентов с муковисцидозом имеют удивительное сходство
#генетический дрейф #мутаторы #адаптивная эволюция #деградация генома #биогеография очагов инфекции #эволюция микроорганизмов #муковисцидоз #pseudomonas aeruginosa
Совместная работа микробиологов, клиницистов и экспертов по эволюции бактерий показала, что со временем высокоадаптированные сообщества бактерий в пазухах людей с муковисцидозом (МВ) становятся более фрагментированными и подвергаются мутациям, которые разрушают их геномы.     Это открытие, бросающее вызов догмам, заставило ученых по-новому взглянуть на эволюцию микроорганизмов при хронических инфекциях. В статье, опубликованной в журнале Cell Reports, исследователи из Медицинской школы Питтсбургского университета сообщают, что размер и структура популяций Pseudomonas aeruginosa широко варьируют в синусах. Они обнаружили, что эта так называемая биогеография в месте инфекции оказывает фундаментальное влияние на эволюцию бактерий во время хронических инфекций.    "Давнее воззрение в области муковисцидоза утверждает, что инфекция каждого пациента рассказывает свою уникальную историю, и что Pseudomonas эволюционирует непредсказуемым образом", - говорит руководитель исследования Дженнифер Бомбергер. "Используя инструменты эволюционной биологии, мы показали, что эта сложная и громоздкая проблема может быть упрощена - эти бактерии следуют общим тенденциям, которые коренятся в эволюционной биологии, и изучение этих тенденций может помочь нам создать более эффективные вмешательства".    Муковисцидоз - неизлечимое генетическое заболевание, которым страдают десятки тысяч людей по всему миру и поскольку их иммунная система нарушена, пациенты с МВ также страдают от частых бактериальных и грибковых инфекций, которые сначала проникают в носовые пазухи, а затем распространяются в нижние дыхательные пути, где они сеют хаос и могут усугубить существующие проблемы с дыханием. Несмотря на то, что бактериальные инфекции ассоциируются с худшими исходами болезни у пациентов с МВ, врачи мало знают о том, как эти инфекции зарождаются.   "Пазухи - это как Дикий Запад", - говорит ведущий автор исследования Кэтрин Армбрустер. "Поразительно, как мало мы знаем об эволюции Pseudomonas в верхних дыхательных путях. Нет четкого руководства по лечению хронических инфекций пазух при муковисцидозе. Даже если эти инфекции синусов, вероятно, заносят бактерии в легкие, неясно, взаимодействуют ли эти две популяции и как".    Вдохновленные исследованиями древних взаимоотношений между бактериями и их хозяевами - насекомыми, ученые использовали передовые исследования генома и современные методы визуализации для анализа популяций P. aeruginosa, взятых из пазух пациентов с МВ. Их анализ показал, что эволюция P. aeruginosa проходит в два этапа. На патоадаптивной стадии бактерии образуют большое сообщество, в котором большинство сохраняющихся мутаций приносят адаптивную пользу. Но со временем, в ходе хронических инфекций, популяции бактерий могут накапливать не очень полезные мутации и фрагментироваться. Эволюция на этой стадии напоминает то, что происходит в бактериях, живущих симбиотически внутри насекомых, где генетический дрейф играет большую роль в этих небольших популяциях, и геномы бактерий начинают разрушаться.    Это понимание может сыграть важную роль в переосмыслении терапевтических подходов к лечению хронических бактериальных инфекций: вместо того чтобы ориентироваться на мутации "отвлекающего маневра", исследователи предлагают обратить внимание на мутации, вызванные сильнейшим эволюционным давлением, и на модели геномной адаптации и эрозии. "Геномы могут дать нам более полную картину истории бактериальных линий, бумов и спадов, через которые прошла популяция", - говорит Армбрустер. "Возможно, пациенты с муковисцидозом не так уж и непохожи друг на друга в том, как развиваются их инфекции".   "Существует идея, что ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции", - добавляет она. "Но мы также можем перефразировать это утверждение: ничто в эволюции не имеет смысла, кроме как в свете размера и структуры популяции".Catherine R. Armbruster et al. Адаптация и геномная эрозия во фрагментированных популяциях Pseudomonas aeruginosa в синусах людей с муковисцидозом (аннотация).   Известно, что Pseudomonas aeruginosa адаптируется к дыхательным путям людей с муковисцидозом (МВ), но как меняется биогеография очага инфекции и связанные с ней эволюционные процессы по мере развития пожизненной инфекции, остается неясным. В данном исследовании мы проверяем гипотезу о том, что ранние адаптации, способствующие агрегации, влияют на эволюционно-генетические траектории, изучая продольный анализ P. aeruginosa из пазух носа шести взрослых людей с МВ. Линии с высокой степенью адаптации к хозяину несли в себе генотипы мутаторов, демонстрирующие признаки ранней деградации генома, связанной с недавним ослаблением хозяина.    Используя передовой метод визуализации (MiPACT-HCR [microbial identification after passive clarity technique-идентификация микроорганизмов после пассивного метода определения четкости]), мы обнаружили, что структура популяции зависит от деградации генома, причем наиболее адаптированные к хозяину штаммы P. aeruginosa с деградированным геномом (мутаторы) обитают в небольших, редких агрегатах. Мы предполагаем, что после первоначальной адаптивной эволюции в более крупных популяциях в условиях сильного отбора на агрегацию, P. aeruginosa сохраняется в небольших, фрагментированных популяциях, которые испытывают более сильное влияние генетического дрейфа. Такие условия обогащают мутаторов и способствуют дегенеративной эволюции генома.    Наши результаты подчеркивают важность биогеографии очагов инфекции для эволюции патогена.
События
Каталог
Библиотека
up