Новости

Метагеномное секвенирование следующего поколения может стать надежным диагностическим средством для анализа причин высококонтагиозного менингита или энцефалита в клинических условиях.    «Секвенируя все ДНК и РНК в клинических образцах, мы в принципе можем диагностировать любую инфекцию», - подчеркнул Чарльз Чиу, профессор лабораторной медицины отделения инфекционных заболеваний Калифорнийского университета в Сан-Франциско, во время вебинара, организованного Американской академией неврологии. Чиу и коллеги попытались проанализировать эффективность метагеномного анализа следующего поколения (mNGS) спинномозговой жидкости для диагностики причин высококонтагиозного менингита и/или энцефалита в течение 7 лет в реальных клинических условиях по сравнению с анализами спинномозговой жидкости (ЦСЖ) или ПЦР широкого диапазона.    Исследователи проанализировали электронные медицинские карты за период с 2016 по 2023 год, выявив 4 849 результатов тестирования mNGS на образцах ЦСЖ. Дополнительный обзор карт был проведен для получения подгруппы из 968 госпитализированных пациентов (средний возраст 46,4 года) для оценки демографических данных, инфекционных/неинфекционных диагнозов, профиля ЦСЖ, включая количество клеток и дифференциальный анализ, глюкозу, белок, а также других соответствующих результатов лабораторных исследований и визуализации.    Из первоначальной выборки у 1231 пациента был положительный результат mNGS с обнаружением хотя бы одного микроорганизма, а у остальных - отрицательный. Среди обнаруженных организмов были бактерии (44%), ДНК-вирусы (26%), РНК-вирусы (16%), грибы (11%) и 3% инфекции паразитарного происхождения. Согласно полученным результатам, mNGS выявила значительно больше организмов, чем культура ЦСЖ и универсальная ПЦР вместе взятые. В целом, mNGS обнаружил хотя бы один патоген в ЦСЖ в 25% случаев, при этом было выявлено 192 различных вида. Кроме того, чувствительность mNGS составила 63%, специфичность - 99%, а точность - 90%.    «Мы пришли к выводу, что эти результаты оправдывают включение анализа спинномозговой жидкости с помощью метагеномного секвенирования нового поколения в рутинную диагностику госпитализированных пациентов с потенциальной инфекцией центральной нервной системы», - заявил Чиу.

Выделения апокринных желез подмышечной области, богатые липидами и белками, изначально не имеют запаха, но в процессе бактериального метаболизма превращаются в неприятно пахнущие вещества.     К основным пахучим веществам подмышечных желез относятся среднецепочечные летучие жирные кислоты. Чтобы выяснить можно ли избавится от неприятного запаха без помощи дезодорантов, исследовательская группа под руководством профессора Университета Осаки Сатоси Уемацу собрала образцы выделений из подмышек 20 мужчин, которые были признаны здоровыми. Исследование было опубликовано в журнале Journal of Investigative Dermatology.    Субъективная обонятельная панель разделила образцы на два типа запахов, причем 11 имели более выраженный характер. Исследователи проанализировали вещества, образующиеся в результате бактериального метаболизма, и ДНК микрофлоры кожи и обнаружили повышенное присутствие жирных кислот, вызывающих запах, в этих 11 образцах, а также распространение бактерий Staphylococcus hominis. Затем исследователи синтезировали лизин из бактериофагов инфицирующих S. hominis. В ходе экспериментов in vitro было установлено, что этот лизин действует только на S. hominis, а не на другие бактерии, обычно присутствующие на коже.    «Мы провели масштабный метагеномный анализ микрофлоры кожи с помощью суперкомпьютера и обнаружили, что S. hominis играет важную роль в развитии запаха», - рассказал Уемацу. «Идентификация лизина, который атакует S. hominis, также является результатом всестороннего геномного анализа. Запах из подмышечных впадин - одно из немногих дерматологических проявлений, основной причиной которого являются бактерии. Хотя многие пациенты страдают от подмышечных запахов, вариантов лечения немного. Мы верим, что это исследование приведет к созданию новой терапии».