microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss
АНАЛИЗ СИСТЕМАТИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ПРОСТЕЙШИХ ИЗ ПОЧВ ГОРНО-АЛТАЙСКОГО ВЫСОКОГОРНОГО ОЧАГА ЧУМЫ

АНАЛИЗ СИСТЕМАТИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ПРОСТЕЙШИХ ИЗ ПОЧВ ГОРНО-АЛТАЙСКОГО ВЫСОКОГОРНОГО ОЧАГА ЧУМЫ

Характеристика видового состава доминирующих представителей простейших в природных очагах чумы важна для изучения некоторых сторон экологии и механизмов персистенции

Yersiniа pestis. Для определения систематической принадлежности амеб из почв Горно-Алтайского высокогорного очага чумы нами проведен анализ нуклеотидных последователь-

ностей рибосомальных генов этих простейших, выделенных на территории очага в 2016 г. Анализируемые участки рибосомальных генов получали с использованием специфичных

праймеров методом ПЦР с последующим секвенированием ПЦР продуктов. Анализ данных фрагментарного секвенирования осуществляли выравниванием полученных нуклеотидных

последовательностей на референсные нуклеотидные последовательности простейших из базы данных NCBI GenBank.

Филогенетический анализ проводили с использованием программ Mega 7.0, Ugene 1.28.1 алгоритмом Maximum Likelihood. В результате установлена систематическая принадлежность-

простейших, выделенных из разных эпизоотичных по чуме участков почв Горного Алтая, к видам Acanthamoe bacastellanii, Dictyostelium sphаerocephalum и D. mucoroides. В совокупнос-

ти с данными о высокой численности выделенных штаммов амеб и способности Yersiniа pestis сохраняться в клетках этих простейших можно рассматривать идентифицированные виды

амеб в качестве вероятных природных резервуаров чумы. Выделенные штаммы амеб могут быть использованы в качестве модельных объектов при изучении особенностей экологии и
механизмов сохранения возбудителя чумы в почвенных биоценозах нор грызунов природных очагов чумы.

АНАЛИЗ СИСТЕМАТИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ПРОСТЕЙШИХ ИЗ ПОЧВ ГОРНО-АЛТАЙСКОГО ВЫСОКОГОРНОГО ОЧАГА ЧУМЫ

up