Эпидемиологическая значимость молекулярной изменчивости генома изолятов Pseudomonas aeruginosa, вызывающих хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом

Шагинян И.А. и др.

Цель. Представить данные об одном из основных механизмов молекулярной изменчивости P. aeruginosa,

вызывающей хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом.

Материалы и методы. На протяжении 10 лет исследовано 1800 мазков из зева и образцов мо-

кроты от больных муковисцидозом. Идентификацию P. aeruginosa проводили классическими мето-

дами и с помощью тест-системы API 20NE (bioMerieux, Франция). Чувствительность к антимикроб-

ным препаратам определяли диско-диффузионным методом и с помощью АТВТМ PSE 5 (bioMerieux,

Франция). Генотипирование проводили методом RAPD-ПЦР и MLST. Полногеномное секвенирова-

ние трех изолятов P. aeruginosa провели на платформе Ion PGM Torrent с наборами Ion Sequencing

Kit и чипами 316v1 (Life Technologies Thermo Fisher, США) по протоколу производителя. Первичная

аннотация была проведена с помощью онлайн программы RAST.

Результаты. При проведении мониторинга хронической инфекции легких у больных МВ выявили 3

основных варианта изменчивости возбудителей: гетерогенность популяции возбудителя, микроэво-

люция возбудителя и смена одного вида возбудителя на другой вид или на тот же вид другого гено-

типа. Показано, что изменчивость генома возбудителей обусловлена приобретением мобильных ге-

нетических элементов (плазмид); мутациями в хромосомных генах, ответственных за устойчивость к

антибиотикам, обеспечивающих жизнеспособность и выживаемость возбудителя при персистенции

в организме больного; изменениями в профаговых регионах возбудителя.

Выводы. Эпидемиологическая значимость обнаруженных молекулярных механизмов изменчивости

заключается, прежде всего, в способности штаммов к формированию эпидемически значимых кло-

нов и необходимости в связи с этим разработки противоэпидемических мероприятий, направлен-

ных на ограничение их формирования и распространения.