microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss
Опыт использования онлайн-платформы AMRcloud для ветеринарного мониторинга антибиотикорезистентности зоонозных бактерий

Опыт использования онлайн-платформы AMRcloud для ветеринарного мониторинга антибиотикорезистентности зоонозных бактерий

Цель. Разработать подходы к комплексному анализу и представлению данных по антибиотикорезистентности

зоонозных бактерий с применением онлайн-платформы AMRcloud для минимизации антибиотикорезистентности

в медицине и ветеринарии.

Материалы и методы. Выделение изолятов E. coli, Salmonella spp., Enterococcus spp., и Campylobacter

spp. проводили от продуктивных животных, из пищевой и кормовой продукции.

Чувствительность бактерий ко всем основным классам используемых в ветеринарии антимикробных

препаратов (АМП) определяли методом микроразведений в бульоне, гены устойчивости выявляли

методом полногеномного секвенирования или при помощи ПЦР. Интеграция полученных данных

в единую систему осуществлялась с помощью платформы AMRcloud.

Результаты. В 2017–2019 гг. в ходе ветеринарного мониторинга была определена чувствительность

к АМП (количеством до 50) 854 изолятов 11 видов бактерий, выделенных из 20 типов образцов

от 6 видов животных, пищевого и кормового сырья из 22 регионов Российской Федерации.

Для 126 изолятов были определены гены антибиотикорезистентности. Полученные данные были систематизированы

и представлены в открытом проекте ФГБУ «ВГНКИ» на платформе AMRcloud по

адресу: https://amrcloud.net/ru/project/vgnki/.

Выводы. Использование AMRcloud позволило в сжатые сроки реализовать поставленные задачи.

Платформа поднимает методологию анализа данных на принципиально новый, по сравнению с традиционными

инструментами, уровень и повышает эффективность мониторинга как средства борьбы

с распространением антибиотикорезистентности.

Опыт использования онлайн-платформы AMRcloud для ветеринарного мониторинга антибиотикорезистентности зоонозных бактерий

up