Кузнецова М.В., Максимова А.В., Карпунина Т.И. ОПЫТ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ Rep- И RAPD-ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ДЛЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЙ ХАРАКТЕРИСТИКИ НОЗОКОМИАЛЬНЫХ ИЗОЛЯТОВ PSEUDOMONAS AERUGINOSA.
УДК 579.841.11.083.18
Кузнецова М.В.1, 2, Максимова А.В.1, Карпунина Т.И.2
ОПЫТ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ Rep- И RAPD-ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ ДЛЯ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕС КОЙ ХАРА КТЕРИСТИ КИ НОЗО КОМИАЛЬНЫХ ИЗОЛЯТОВ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA
1Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения РАН, Пермь; 2ГБОУ ВПО «Пермская
государственная медицинская академия им. акад. Е.А. Вагнера» Минздрава России
В работе представлена сравнительная оценка диагностической значимости методов Rep- и RAPD-полимеразной цепной
реакции (ПЦР) при генотипировании клинических изолятов Pseudomonas aeruginosa. Штаммы выделены из стационаров различных лечебно-профилактических учреждений (ЛПУ) взрослой (8 ЛПУ; n = 145) и педиатрической (5 ЛПУ; n = 151) сети. Результаты исследования показали различную разграничивающую способность трех реакций: индекс дискриминации Симпсона составил 0,993, 0,875 и 0,639 для RAPD-, ERIC- и ВОХ-ПЦР соответственно. RAPD-ПЦР позволяет выявлять индивидуальные особенности штаммов. Из двух вариантов Rep-ПЦР показано преимущество ERIC-ПЦР, причем только с одним праймером ERIC2. BOX-ПЦР имеет наименьшую дискриминирующую способность при типировании изолятов P. aeruginosa, устанавливая только видовые особенности. Клинические штаммы P. aeruginosa распределились на 24 геномогруппы, 52 изолята имели индивидуальные генотипы. Оценивая результаты генотипирования, можно говорить о сходстве тенденций распространенности штаммов P. aeruginosa среди госпитализированных взрослых и подростков и своеобразии выявления в неонатальной клинике. Очевидно, что стационары разного профиля, включая отделения реанимации и интенсивной терапии, представляют специфическую экологическую среду, существенно различающуюся по уровню эндо- и экзогенного инфицирования
