microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss
Адаптация метода количественной ПЦР для выявления представителей микобиоты зерновых культур.

Адаптация метода количественной ПЦР для выявления представителей микобиоты зерновых культур.

Адаптация метода количественной ПЦР для выявления представителей
микобиоты зерновых культур
А. С. Орина#, О. П. Гаврилова, Т. Ю. Гагкаева
ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт защиты растений», Санкт-Петербург, Пушкин, Российская Федерация
# Для корреспонденции: Александра Станиславовна Орина, e-mail: orina-alex@yandex.ru
Ключевые слова: грибы, Fusarium, Alternaria, Bipolaris sorokiniana, микотоксины, количественная ПЦР.
DOI: 10.18527/2500-2236-2018-5-1-71-77
Получена 15 октября 2018 г. Принята к печати 7 ноября 2018 г. Опубликована 22 декабря 2018 г.


АННОТАЦИЯ
Проведена сравнительная оценка содержания ДНК грибов и микотоксинов в зерне 31 сорта пшеницы, овса и ячменя. Метод количественной ПЦР был адаптирован для выявления ДНК грибов, часто встречающихся в микобиоте зерновых культур: Alternaria spp., Bipolaris sorokiniana (B. sorokiniana), Fusarium graminearum (F. graminearum), F. culmorum и F. sporotrichioides.
Количественное выявление в зерне ДНК гриба B. sorokiniana проведено впервые.
ДНК грибов Alternaria выявлена во всех образцах в диапазоне от 184×10-4 до 11160×10-4 пг/нг общей ДНК, но в зерне овса, по сравнению с зерном ячменя и пшеницы, ее количества были больше в 5 и 9 раз соответственно. ДНК B. sorokiniana выявлена во всех образцах зерна ячменя и овса, а также в 56% образцов пшеницы. В зерне ячменя содержание ДНК B. sorokiniana в среднем было существенно выше (402×10-4 пг/нг), чем в зерне овса (51×10-4 пг/нг) и пшеницы (10×10-4 пг/нг). Присутствие ДНК гриба F. graminearum установлено в зерне всех анализированных образцов в диапазоне от 14×10-4 до 1110×10-4 пг/нг, ДНК F. culmorum выявлена в 70% образцов овса и в 100% образцов ячменя и пшеницы в количестве от 8×10-4 до 90×10-4 пг/нг.
Микотоксин дезоксиниваленол (ДОН), продуцируемый грибами F. graminearum и F. culmorum, выявлен в зерне всех образцов в диапазоне от 77 до 4133 мкг/кг. ДНК F. sporotrichioides, продуцирующего Т-2 токсин, обнаружена в 70% образцов овса и 50% образцов ячменя в количестве от 5×10-4 до 47×10-4 пг/нг и не выявлена в зерне пшеницы. Количество T-2 токсина, обнаруженного в 45% образцов, не превышало 89 мкг/кг.
Установлена достоверная положительная связь между количествами ДНК F. graminearum и ДОН в зерне. Коэффициент
корреляции Пирсона (r) составил 0.49 (p <0.05). Также выявлена положительная связь (r = 0.72, p <0.01) между количествами ДНК Alternaria spp. и F. sporotrichioides, что предполагает сходство условий для развития этих грибов на зерновом субстрате.

adaptatsiya-metoda-kolichestvennoy-ptsr-dlya-vyyavleniya(1).pdf

up