Молекулярное типирование уропатогенных штаммов Escherichia сoli, выделенных у пациентов
с использованием метода REP-ПЦР.
DOI: 10.17691/stm2017.9.3.09
УДК 576.8.097.21:616.9–074
Поступила 14.12.2016 г.
Hakime Shokoohi Amiri, MSc Student1;
Reza Ranjbar, PhD, Professor, Head2;
Noshin Sohrabi, PhD, Assistant Professor, Department of Biology1;
Faham Khamesipour, DVM, MPH, PhD, Researcher3, 4
1Payame Noor University, Tehran, Iran;
2Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran;
3Health policy Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran;
4Cellular and Molecular Research Center, Sabzevar University of Medical Sciences, Sabzevar, Iran
Цель исследования — определить взаимосвязь между генетическими паттернами и штаммами Escherichia coli (E. coli) и
оценить генетическое многообразие штаммов E. coli, выделенных у пациентов, поступивших в стационар Бакияталлах (Тегеран), с использованием метода полимеразной цепной реакции, основанного на амплификации повторяющихся последовательностей (REP-ПЦР).
Материалы и методы. Исследовано 100 штаммов E. coli в образцах от пациентов с инфекциями мочевыводящих путей.
Штаммы E. coli обнаружили и выделили стандартными бактериологическими способами и извлекли их ДНК. Для типирования выделенных штаммов использовали метод REP-ПЦР с применением праймера REP1R.
Результаты. Из 100 штаммов E. coli 98 оказались типируемыми и 2 — нетипируемыми. Анализ дендрограммы показал, что в ходе REP-ПЦР выделяется 7 REP-групп (R1–R7) дифференцированных штаммов с 70-процентной идентичностью. Наибольшее количество штаммов было обнаружено в группе R4 (22 штамма) и наименьшее — в группе R3 (7 штаммов).
Заключение. В Иране метод REP-ПЦР ранее не использовался для изучения уропатогенных штаммов E. Coli. В нашем исследовании данный метод проявил высокую дифференциальную точность. Обнаружено, что штаммы E. coli состоят из различных клонов, что свидетельствует о генетическом разнообразии бактерий у обследованных пациентов.
