Лопастейская Я.А., Молчанова Е.В., Шаров Т.Н., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б., и др. Применение времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (maldi-tof) для идентификации возбудителей сапа и мелиоидоза..
УДК 579.841.11.083.18:543.42.062
Лопастейская Я.А.1,2, Молчанова Е.В.1 2, Шаров Т.Н.1, Кузютина Ю.А.1,2, Захарова И.Б.1,2, Викторов Д.В.1,2,
Топорков А.В.1,2
применение времяпролетной масс-спектр ометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (maldi-tof) для идентификации возбудителей сапа и мелиоидоза
1ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, 400131, Волгоград;
2ГБОУ ВПО «Волгоградский государственный медицинский университет», 400131, Волгоград, Российская Федерация
Представлены результаты разработанного методологического подхода к идентификации Burkholderia pseudomallei и
Burkholderia mallei с использованием прямого масс-спектрометрического профилирования клеточных белков. Оптимизирован протокол пробоподготовки культур возбудителей мелиоидоза и сапа с учетом особенностей соблюдения требований биологической безопасности для работ с ПБА II группы патогенности. Оценена зависимость качества масс-спектров (число индивидуальных пиков и их интенсивность) от среды культивирования микроорганизмов. Получены характеристические масс-спектры коллекционных штаммов B. pseudomallei (5) и B. mallei (5), сформирован набор референсных масс-спектров для идентификационной базы данных S.A.R.A.M.I.S.™ (Anagnostec GmbH.), с использованием которой проводилась идентификация 43 штаммов патогенных буркхольдерий. В результате продемонстрирована возможность достоверного определения таксономической принадлежности исследуемых микроорганизмов до видового уровня. Кластерный анализ полученных масс-спектров общеклеточных белков коллекционных штаммов патогенных буркхольдерий продемонстрировал группирование исследованных штаммов в соответствии с их видовой принадлежностью. Пополненная база масс-спектральных характеристик в дальнейшем позволит проводить экспресс-идентификацию изолятов, подозрительных на принадлежность к возбудителям мелиоидоза и сапа, а также станет основой для разработки схем хемотипирования штаммов буркхольдерий методом масс-спектрометрии.
