M. B. Кузнецова, Ю. А. Павлова, Т. И. Карпунина, В. А. Демаков. Опыт использования методов молекулярной генетики при идентификации клинических штаммов Pseudomonas aeruginosa.

УДК 579.841.11:579.253].083.18:577.21.08
M. B. Кузнецова1, 2, Ю. А. Павлова2, Т. И. Карпунина1, В. А. Демаков2
Опыт использования методо в мо леку лярной генетики при идентификации
клинических штаммо в Pseudomonas aeruginosa
1ГБОУ ВПО Пермская государственная медицинская академия им. акад. Е. А. Вагнера Минздравсоцразвития России, 2ФГБУН
Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН, Пермь

В работе представлен сравнительный анализ использования традиционных бактериологических и молекулярных методов для идентификации P. aeruginosa. Для генетической детекции применяли полимеразную цепную реакцию с родо- и видоспецифичными праймерами, а также амплификацию консервативных участков генов 16S рРНК с последующей идентификацией бактерий путем секвенирования. Установлено, что 95% (151) штаммов соответствуют виду P. aeruginosa, определенному в первичных бактериологических лабораториях и только 8 штаммов не являлись синегнойной палочкой. Большую часть из них составили близкородственные виды: 2 изолята принадлежали к этой же Pseudomonas aeruginosa group, три изолята – к Pseudomonas putida group. 2 штамма принадлежали к роду Comamonas, 1 изолят – к виду Stenotrophomonas maltophilia.
Показана эффективность культурального метода лабораторной диагностики инфекций, обусловленных P. aeruginosa, что не исключает использование молекулярно-генетических технологий в сложных, арбитражных случаях бактериологического анализа при мониторинге нозокомиальных инфекций.