Молекулярная эпидемиология в настоящее время (на английском)

Молекулярная эпидемиология, мотивированная поиском вариантов профилактики или вмешательства, направлена на выявление хозяина и микробных факторов, определяющих передачу, проявление и прогрессирование инфекционного заболевания.

Генотипирование культивируемых штаммов бактерий осуществляется либо методами дактилоскопирования, либо последовательным исследованием переменных геномных участков. Типирование генов с помощью мультилокусных последовательностей и аллельного профилирования ядра генома стали стандартными методами типирования штаммов бактерий, которые могут быть дополнены секвенированием всего генома с целью изучения всех отдельных нуклеотидных вариантов и/или состава аксессуарного генома. Также разрабатываются новые протоколы исследования хозяина и микробиома на основе интеллектуальных технологий секвенирования третьего поколения для эффективного наблюдения, быстрой диагностики и отслеживания инфекционных заболеваний в режиме реального времени.