Мутации в геномах SARS-COV-2 биологических образцов, полученных в конце марта — начале апреля, от пациентов города Москвы

Неоднократно высказывались предположения, что мутация D614G в S-белке SARS-CoV-2 может влиять на способность передачи вируса. 

   В недавней работе [1] было отмечено, что на скорость передачи заболевания и на скорость репликации вируса оказывает влияние не одиночная мутация D614G, а ее комбинация с мутацией P323L в белке РНК-зависимой РНК-полимеразы. Мы определили последовательности полных геномов для 28 вирусов SARS-CoV-2, полученных из образцов, представляющих собой клинический материал мазок/ отделяемое ротоглотки от пациентов разных возрастов. Проанализированные изоляты принадлежат к линиям B.1 (GH) и B.1.1 (GR). Во всех геномах были обнаружены сочетания мутаций P323L в области РНК-зависимой РНК-полимеразы и D614G в гене S-белка. 

   Обнаруженные отличия могут объяснены выборкой: для полногеномного секвенирования отбирались только образцы с высокой вирусной нагрузкой, которая, могла быть обусловлена именно высокой скоростью размножения вируса в организме хозяина, что, в свою очередь, может иметь связь с наличием в геноме вируса мутаций P323L/ D614G.