Опыт использования онлайн-платформы AMRcloud для ветеринарного мониторинга антибиотикорезистентности зоонозных бактерий
Цель. Разработать подходы к комплексному анализу и представлению данных по антибиотикорезистентности
зоонозных бактерий с применением онлайн-платформы AMRcloud для минимизации антибиотикорезистентности
в медицине и ветеринарии.
Материалы и методы. Выделение изолятов E. coli, Salmonella spp., Enterococcus spp., и Campylobacter
spp. проводили от продуктивных животных, из пищевой и кормовой продукции.
Чувствительность бактерий ко всем основным классам используемых в ветеринарии антимикробных
препаратов (АМП) определяли методом микроразведений в бульоне, гены устойчивости выявляли
методом полногеномного секвенирования или при помощи ПЦР. Интеграция полученных данных
в единую систему осуществлялась с помощью платформы AMRcloud.
Результаты. В 2017–2019 гг. в ходе ветеринарного мониторинга была определена чувствительность
к АМП (количеством до 50) 854 изолятов 11 видов бактерий, выделенных из 20 типов образцов
от 6 видов животных, пищевого и кормового сырья из 22 регионов Российской Федерации.
Для 126 изолятов были определены гены антибиотикорезистентности. Полученные данные были систематизированы
и представлены в открытом проекте ФГБУ «ВГНКИ» на платформе AMRcloud по
адресу: https://amrcloud.net/ru/project/vgnki/.
Выводы. Использование AMRcloud позволило в сжатые сроки реализовать поставленные задачи.
Платформа поднимает методологию анализа данных на принципиально новый, по сравнению с традиционными
инструментами, уровень и повышает эффективность мониторинга как средства борьбы
с распространением антибиотикорезистентности.
