Секвенатор GenoLab M
Генолаб М - высокопроизводительная система для секвенирования нуклеиновых кислот.
Гибкая система - разные режимы запусков.
Эффективная система - возможно два независимых запуска одновременно.
Совместимая система - можно секвенировать любые библиотеки, совместимые с платформой Illumina.
Универсальная система - секвенирование и анализ данных для многих отраслей.
Настольный высокопроизводительный NGS-секвенатор для различных применений. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.
Genolab M - это секвенатор ДНК нового поколения, основанный на современных технологиях. С помощью этого устройства можно быстро и точно получить информацию о молекулярной структуре ДНК, а также об образцах, содержащих белки и другие молекулы. Одной из главных особенностей Genolab M является высокая производительность - он способен обработать большое количество фрагментов ДНК за короткое время. Для получения последовательности ДНК используются различные методы, включая химические реакции и электрофорез.
Genolab M отличается от других секвенаторов тем, что он позволяет определить как короткие, так и длинные последовательности ДНК, включая модификации и мутации. Это особенно важно для проведения клинических исследований и диагностики отдельных случаев. Секвенатор Genolab M используется в множестве задач биологии и геномной медицине. Он позволяет получать информацию о молекулярной структуре клеток и других образцов, а также проводить детекцию мутаций и других ошибок.
Одной из самых важных особенностей Genolab M является программа обработки информации, которая позволяет автоматизировать процесс получения и анализа данных. Это устройство также обладает широким спектром возможностей, включая возможность работы с небольшими объемами материалов и проведения сложных технических задач. Секвенатор Genolab M основан на современных технологиях и обеспечивает высокую точность и конфиденциальность данных. Стоимость устройства может быть даже менее высокой, чем у первых известных секвенаторов, что делает его доступным для широкой группы ученых и медицинских специалистов.
В основе работы прибора лежит принцип секвенирования путём синтеза:
- Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования.
- Связанные с ячейкой библиотеки амплифицируются в моноклональных кластерах.
- Далее библиотеки секвенируются за счет обратимой терминации и флуоресцентно меченых нуклеотидов.
SURF-seqTM - технология секвенирования с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).
Секвенирование осуществляется с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы).
Каждая ячейка может быть загружена независимо от второй, поэтому две дорожки на картридже могут работать параллельно с разными образцами или типами секвенирования, что позволяет сократить время работы прибора и расширить сферы его применения в рамках одного эксперимента.
GenoLab M является настольной системой высокопроизводительного секвенирования. Она ориентирована в первую очередь на полногеномное, полноэкзомное и транскиптомное секвенирование. Инновационные достижения в области химии секвенирования, дизайн проточной ячейки высокой плотности и алгоритмов идентификации оснований обеспечивают пользователям существенную гибкость, стабильное качество данных и ускоренное получение высококачественных данных.
Основные применения высокопроизводительного NGS-секвенатора GenoLab M:
- секвенирование экзома;
- секвенирование полных геномов;
- таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
- секвенирование транскриптомов;
- метагеномное секвенирование;
- анализ степени метилирования ДНК;
- анализ ДНК-белковых взаимодействий;
- секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
- НИПТ, ПГТ-А.
Платформа не уступает по заявленным характеристикам популярной платформе Illumina NextSeq 2000
Характеристики NGS-секвенатора GenoLab M:
- количество рабочих ячеек секвенатора, шт. – 2;
- возможность запуска двух ячеек независимо (запуск второй ячейки во время текущего запуска первой ячейки);
- возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
- количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования – 4;
- максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн – 500;
- максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб – 300;
- поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
- максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов – 150;
- максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов – 300;
- максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч – 72;
- поддержка библиотек TruSeq и Nextera;
- средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) – 80% оснований с точностью прочтения 99,9%;
требования к сети – 220 В; 50/60 Гц;
- габаритные размеры (Ш×Г×В), мм – 1200×685×595;
- вес, кг – 280.
Рабочие параметры GenoLab M:
- 2 проточных ячейки на цикл (поддержка работы в режиме запуска одной или двух независимых ячеек)
- 500M прочтений на запуск (2 проточные ячейки FCM), *1000M (2 проточные ячейки FCH)
- 25-150 Гб данных/запуск (FCM), 50 – 300 Гб (FCH)
- длина прочтения: SE75, SE150, PE75, PE100, PE150
- общее время секвенирования: 12-48 ч
- качество данных: ≥80% > Q30
- точность: ≥ 99%
Комплектация секвенатора GenoLab M:
- секвенатор;
- стартовый набор для инсталляции и обучения;
- набор для секвенирования (на выбор в зависимости от задач пользователя);
- источник бесперебойного питания;
- управляющий ПК (Операционная система — Windows 10 Pro, CPU：Xeon SR 4216, Память: 192 DDR4; Hard Disk 1: 1 TB SSD; Hard Disk 2：10 TB HDD);
- монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
- гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).
В комплект поставки опционально входит специализированное программное обеспечение Oncobox для анализа и интерпретации NGS данных (на 10, 24, 48 или 96 образцов) при онкодиагностике и онкологических исследованиях. Отчет Oncobox включает в себя анализ геномных (ДНК) и транскриптомных (РНК) данных, полученных из образца опухоли, содержит рейтинг эффективности таргетных и иммунотерапевтических препаратов для конкретного пациента.
