Высокопроизводительная система для секвенирования нуклеиновых кислот Геноскан 3700

Ключевые особенности секвенатора нуклеиновых кислот «Геноскан» (по ТУ 26.51.53-004-95224908-2020). Геноскан 3700 представляет собой настольную систему для высокопроизводительного секвенирования, ориентированную на широкий спектр задач. Позволяет выполнять секвенирование небольших геномов и таргетное секвенирование как маленьких панелей, так и целых экзомов. Оптимален для онкопанелей, метагеномного секвенирования, микробиологии, полноэкзомного секвенирования. Секвенатор Геноскан 3700 поддерживает пять типов проточных ячеек, от самых маленьких позволяющих получить 50 млн прочтений, до самых ёмких ячеек на 500 млн. Высокое разнообразие предлагаемых реагентов позволяет выбирать режим чтений от 50 до 600 циклов в зависимости от конкретной задачи. Благодаря инновационным достижениям в области химии секвенирования, дизайну проточной ячейки высокой плотности и алгоритмам идентификации оснований, пользователи получают значительную гибкость, стабильное качество данных и ускоренное получение высококачественных результатов. В основе работы прибора лежит принцип секвенирования путём синтеза. Готовятся библиотеки с адаптерами комплементарными поверхности ячейки для секвенирования. На первом этапе библиотеки связываются с ячейкой и амплифицируются в моноклональных кластерах (мостиковая амлификация). В секвенаторе используется четыре нуклеотида с индивидуальным флуоресцентными метками, которые добавляются на каждом цикле секвенирования. Нуклеотиды обратимо терминированы (3'-конец заблокирован), что позволяет пришивать за один цикл строго по одной букве. Сигнал от пришитых нуклеотидов детектируется, происходит снятие флуоресцентной метки и снятие терминации. Далее ПО прибора переводит полученный световой сигнал в basecall файлы и далее в формат fastQ, который подвергается биоинформатической обработке.