Исследование эпигеномного ландшафта выявляет молекулярные подтипы и EBV-ассоциированное регуляторное перепрограммирование эпигенома при назофарингеальной карциномеИсследование эпигеномного ландшафта выявляет молекулярные подтипы и EBV-ассоциированное регуляторное перепрограммирование эпигенома при назофарингеальной карциноме
Вездесущий вирус Эпштейна-Барр (EBV) обнаруживается в различных лимфоцитарных злокачественных опухолях, включая лимфому Буркитта, лимфому Ходжкина, NK-клеточные лимфомы, Т-клеточные лимфомы, диффузные крупноклеточные В-лимфомы, а также эпителиальные опухоли, такие как назофарингеальная карцинома и рак желудка, из которых около 10% ассоциированы с EBV.
О критическом участии генетики хозяина в развитии EBV-ассоциированных злокачественных новообразований свидетельствуют неравномерное географическое распределение, различные этнические показатели заболеваемости, герминальные однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) в регионах основного комплекса гистосовместимости, связанных с иммунным распознаванием вирусов, и повторяющиеся геномные изменения, которые часто ассоциируются с EBV-ассоциированным раком.
Исследователи Университета Гонконга обнаружили новый подтип вируса Эпштейна-Барр (EBV)-позитивной назофарингеальной карциномы (НФК) и EBV-ассоциированную иммуносупрессию в микроокружении опухоли. Эти результаты позволили по-новому взглянуть на традиционную модель патогенеза НФК и выделить EBV-специфические коммуникации в микроокружении опухоли в качестве потенциальной терапевтической мишени при НФК. Исследование было опубликовано в журнале eBioMedicine.
Глубокое понимание патогенеза НФК, в частности роли EBV, имеет решающее значение для продвижения клинической диагностики и лечения этого смертельно опасного заболевания и является активной темой исследований в данной области. Исследовательская группа использовала передовой биоинформационный анализ для всесторонней расшифровки эпигенетики опухолей, исследованных у пациентов с НФК. Полученные ранее данные подчеркивают важность эпигенетики в патогенезе НФК. Однако, учитывая многофакторный характер патогенеза микроокружении опухоли, эпигенетические дисрегуляции, связанные с EBV, их функциональное воздействие и взаимодействие с геномными изменениями в НФК остаются неясными.
Считается, что EBV+НФК подвергается массовой дисрегуляции в результате глобального гиперметилирования ДНК - явления, означающего масштабное увеличение метильных групп на последовательностях ДНК в раковых клетках. Эти метильные группы функционируют как "выключатель", инактивируя опухолевые супрессоры, которые защищают клетки от превращения в опухоль, и тем самым способствуют развитию опухоли. Более того, глобальное гиперметилирование ДНК редко наблюдается в типах рака, не связанных с EBV, и является критическим шагом в патогенезе НФК.
Авторы обнаружили, что, в отличие от общепринятого мнения, 20% случаев НФК характеризуются глобальным гипометилированием ДНК, что означает масштабное уменьшение метильных групп на последовательностях ДНК в раковых клетках. Исследование также показало, что EBV может перепрограммировать межклеточные коммуникации между раковыми клетками и иммунными клетками и, следовательно, защищать раковые клетки от уничтожения иммунной системой.
Является ли глобальное гипометилирование ДНК в процессе патогенеза НФК альтернативным механизмом развития рака у некоторой группы пациентов и каков его потенциал в прогнозировании выживаемости пациентов, клинических особенностей и ответа на терапию, очень важно для понимания НФК и обеспечения персонализированного лечения. Поскольку иммуносупрессивные связи между клетками связаны с EBV, эти связи высокоспецифичны для опухолей и могут быть потенциальными терапевтическими мишенями и биомаркерами при НФК. Сейчас ученые разрабатывают экспериментальную базу для изучения клинического воздействие подтипов НФК.
