Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (MDR-TB) является растущей проблемой общественного здравоохранения.
Недавно Всемирная организация здравоохранения одобрила новые схемы лечения MDR-TB, основанные на использовании новых и усовершенствованных антибиотиков (бедаквилин, претоманид и линезолид с моксифлоксацином или без него [BPaL/M]). Большая часть глобального бремени MDR-TB обусловлена передачей от пациента к пациенту лекарственно-устойчивых Mycobacterium tuberculosis, а поскольку BPaL/M используется для лечения MDR-TB, устойчивость к этим препаратам, возникающая у пациентов с MDR-TB, может распространиться.
С другой стороны, экспериментальные исследования показали, что резистентность даже к одному препарату может снизить конкурентную приспособленность M. tuberculosis по сравнению с чувствительными к препарату штаммами (в отсутствие препарата), а поскольку большинство штаммов M. tuberculosis, приобретающих резистентность к BPaL/M, уже устойчивы ко многим препаратам первого и второго ряда, такие штаммы могут стать менее трансмиссивными из-за кумулятивного снижения конкурентной приспособленности. Тем не менее, вклад передачи инфекции от пациента к пациенту в растущее бремя резистентности к BPaL/M не был определен.
В данном исследовании мы проанализировали геномы 13-летней общенациональной коллекции из 6926 клинических изолятов M. tuberculosis из Грузии, известного очага MDR-TB. Мы выявили 60 штаммов M. tuberculosis, устойчивых как минимум к изониазиду и рифампицину (т.е. двум наиболее важным препаратам первого ряда), а также к фторхинолонам и одному из других соединений BPaL/M. Лекарственная резистентность определялась на основании данных полногеномного секвенирования, а не фенотипического тестирования. Исключив смешанные инфекции, мы обнаружили, что 16 из 58 (28 %) штаммов с высокой лекарственной резистентностью принадлежат к одному из четырех геномных кластеров. Внутри каждого из этих кластеров все штаммы имели идентичный мутационный профиль, что свидетельствует о передаче инфекции от пациента к пациенту.
Чтобы определить, происходит ли передача штаммов с высокой лекарственной резистентностью и в других клинических условиях, мы проанализировали еще 81 576 геномов M. tuberculosis из глобальных источников. Мы выявили еще 454 штамма с высокой лекарственной резистентностью в 26 странах. Исключив смешанные инфекции, мы обнаружили, что среди 420 штаммов 117 (28%) из 10 стран Америки, Европы, Африки и Азии встречались в 1 из 41 геномного кластера. Кроме того, мы выявили 9 штаммов с высокой лекарственной резистентностью из 4 стран, которые несли мутации устойчивости ко всем соединениям BPaL/M, что позволяет классифицировать их как «полностью лекарственно-резистентные».
Наши результаты показывают, что, несмотря на недавнее внедрение BPaL/M, резистентность к этим новым противотуберкулезным препаратам уже развилась по меньшей мере в 27 странах на четырех континентах. Более того, четверть этих случаев связана с передачей инфекции от пациента к пациенту. Полученные нами данные требуют улучшения диагностических возможностей, инфекционного контроля и эпиднадзора, без чего долговечность применения BPaL/M находится под угрозой.
