Пересмотр системы научных названий вирусов привел в ярость некоторых вирусологов, но другие отнеслись к этому более благосклонно.
Скорее всего, вы никогда не слышали о вирусе Betacoronavirus pandemicum, но велика вероятность, что вы были им инфицированы в течение последних 5 лет. Он является причиной COVID-19, более известный как SARS-CoV-2. SARS-CoV-2 - один из тысяч вирусов, получивших новое видовое название в рамках масштабной реорганизации системы наименования вирусов, которая привела некоторых ученых в недоумение.
Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI), управляющий хранилищами последовательностей вирусов и других данных, объявил неделю назад, что весной 2025 года добавит в свои базы данных около 3000 новых латинизированных названий. При этом будет принята система, введенная за последние несколько лет - хотя и не привлекшая особого внимания - Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV). По мнению ICTV, эта система необходима для того, чтобы избавиться от нынешней пестрой панорамы противоречивых названий вирусов. Принятие этой системы сделает изменения общепринятыми, но некоторые ученые все еще сомневаются в необходимости пересмотра или даже говорят, что будут игнорировать новые термины.
«Длинные латинские названия, которые не имеют никакого сходства с теми, что мы используем для обозначения этих патогенов в настоящее время, кажутся просто отвлекающими факторами, которые не служат никому, кроме таксономистов, которые их придумывают», - считает Богума Титанджи, врач-ученый из Университета Эмори, изучающая вирус иммунодефицита человека 1 (ВИЧ-1). По словам Титанджи, чтение пересмотренных названий вызвало у нее «очень громкий смех», но «называть ВИЧ - Lentivirus humimdef1 - это не то, что я буду делать в ближайшее время или когда-либо».
Хотя ученые уже распределяют вирусы по семействам и родам, как они это делают для всех остальных организмов, на уровне видов порядок нарушается. Вирусы часто называют в честь заболевания, например, SARS-CoV-2; организма, который они инфицируют, например, вирус восточного конского энцефалита; или места, где они были впервые обнаружены, например, Зика, названный в честь леса в Уганде, - практика, которая может быть стигматизирующей. По мнению Мурило Зербини, президента ICTV и вирусолога растений из Федерального университета Висозы, эта система была вполне работоспособной, когда число известных вирусов исчислялось сотнями или тысячами. Но теперь, когда геномные методы позволяют выявлять тысячи новых вирусов в рамках одного исследования, необходима стандартизированная система, которая помогла бы ученым общаться между собой, говорит он.
ICTV, состоящая из вирусологов и входящая в некоммерческий Международный союз микробиологических обществ, начала обсуждение в 2016 году и в итоге остановилась на так называемой системе Линнея или биномиальной системе: латинские названия из двух частей, включающие род и вид организма. Это изменение было одобрено ICTV в 2020 году, после чего в течение 3 лет специализированные рабочие группы придумывали новые названия. По словам Зербини, это приведет вирусологию в соответствие с остальной биологией. «Мы очень надеемся, что это облегчит жизнь ученых».
Не все считают, что так и будет. Натан Грубо, эпидемиолог из Йельской школы общественного здравоохранения, говорит, что названия «глупые и напыщенные». В качестве примера он приводит Betacoronavirus pandemicum, а также Orthoflavivirus nilense, более известный как вирус Западного Нила, и «очень глупое» Orthobunyavirus squalofluvii, обозначающее вирус реки Шарк. «Это усложняет мою работу, а не облегчает ее», - добавляет он. Критики также утверждают, что другие исследователи вирусов не принимали в нем участия. «Где была заинтересованность и аргументы в пользу того, что это поможет науке?» - спрашивает Грубо, который недавно помог разработать систему классификации вирусов денге (или Orthoflavivirus denguei, в новой системе).
Зербини знаком с подобной критикой, но утверждает, что ICTV всячески поощряла участие, проводя консультации и откладывая изменения на годы, пока собирала отзывы сообщества. Никто не собирается использовать исключительно новые названия, а старые, несомненно, останутся в обиходе, добавляет он. NCBI пообещала сохранить возможность поиска по старым названиям в своих базах данных после введения новой системы.
Некоторые ученые высоко оценивают усилия ICTV. Вирусолог Стюарт Рэй из Медицинского института Джона Хопкинса говорит, что этот шаг представляется «рациональным дополнением» к существующей системе и вряд ли нарушит ход исследований. «В конце концов, по крайней мере, некоторые из этих биномиальных терминов могут получить более широкое применение, но в краткосрочной перспективе я сомневаюсь, что они будут широко использоваться, за исключением централизованных баз данных».
Некоторая путаница кажется неизбежной. Базы данных NCBI в настоящее время содержат только старые названия, в то время как в базе данных ICTV можно искать только по новым. Пока что исследователи могут загрузить электронную таблицу Excel из ICTV, чтобы увидеть старые и новые названия видов рядом друг с другом. «Я понимаю, что это не идеальное решение», - говорит Зербини, добавляя, что ICTV работает над улучшением своей функции поиска.
Он уверен, что модернизация будет того стоить. При каждом большом изменении «есть переходный период, когда люди жалуются и сопротивляются», - говорит он, отмечая, что даже название «вирус иммунодефицита человека» столкнулось с неприятием, когда в 1980-х годах оно было введено вместо «вирус СПИДа». «Я думаю, что после переходного периода люди поймут, что это гораздо лучше. ... Через несколько лет они оглянутся назад и спросят: «Почему вы так долго тянули?»».