Недавняя работа, опубликованная в журнале Nature Water, показала, что мониторинг сточных вод на наличие индикаторов устойчивости к противомикробным препаратам оказывается более эффективным и всеобъемлющим, чем тестирование отдельных людей.
Такой подход не только эффективнее выявляет устойчивость к противомикробным препаратам, но и обнаруживает ее связь с социально-экономическими факторами, которые часто являются ключевыми факторами распространения резистентности.
Предыдущие исследования показали, что социально-экономические показатели в совокупности объясняют большую часть дисперсии в резистомах сточных вод. Однако связь между резистомами фекалий человека и сточных вод не была хорошо охарактеризована. Авторы изучили общие и отличительные черты между микробиомами и резистомами фекалий человека и сточных вод, проанализировав 451 общедоступный метагеномный образец из 69 стран (240 образцов фекалий человека из 23 стран и 211 образцов городских сточных вод из 60 стран), представляющих различные социально-экономические статусы.
Было обнаружено, что состав резистома сточных вод и фекалий человека различается, причем в сточных водах наблюдается более высокое относительное количество генов устойчивости к антибиотикам и общее разнообразие, чем в фекалиях человека. Исследование также выявило более сильное разделение по социально-экономическому статусу в образцах сточных вод по сравнению с образцами фекалий. Различия между резистомами фекалий человека и сточных вод, выявленные в данном исследовании, являются ключевыми факторами для продвижения усилий по мониторингу сточных вод, направленных на информирование о статусе антибиотикорезистентности человеческих популяций.
Авторы использовали машинное обучение для оценки количества генов резистентности к антибиотикам в зависимости от социально-экономических факторов, выявив значительные корреляции. Статистические методы подтвердили вывод о том, что внутри страны разброс генов резистентности к антибиотикам ниже, чем между странами. В целом, результаты исследования показывают, что наблюдение за сточными водами становится мощным инструментом в борьбе с антимикробной резистентностью. Кроме того, этот метод способен повысить эффективность защиты уязвимых сообществ.
