Предварительный анализ позволил более детально изучить геномные данные, собранные на рынке в Ухане.
В попытках понять, с чего началась пандемия COVID-19, появились новые сведения. Исследователи повторно проанализировали данные, собранные на рынке в Ухане в первые дни пандемии, и обнаружили, что животные там имели вирусные инфекции - хотя они не смогли подтвердить, что именно стало причиной инфицирования. «Вывод убедительный - животные были заражены», - комментирует Спирос Литрас, эволюционный вирусолог из Токийского университета. Результаты, не прошедшие рецензирование, были представлены на конференции «Подготовка к следующей пандемии: эволюция, патогенез и вирусология коронавирусов», которая состоялась 3 декабря в Авадзи (Япония).
Многие из первых выявленных случаев заболевания COVID-19 были связаны с уханьским оптовым рынком Хуанань. В одних исследованиях предполагалось, что люди принесли вирус на рынок, где передали его другим, а в других - что рынок стал местом первых случаев распространения вируса, когда животные, инфицированные вирусом, заразили людей. Хотя эти более ранние исследования установили присутствие на рынке животных, восприимчивых к вирусу, вызывающему COVID-19, и самого вируса, они не смогли подтвердить, что животные были инфицированы.
«Недостающим звеном во всей этой истории было животное», - поясняет Эдвард Холмс, вирусолог из Сиднейского университета (Австралия). «Если вы сможете доказать, что на рынке есть зараженные животные, то история будет законченной», - говорит он, имея в виду именно животных, зараженных прародителем вируса SARS-CoV-2. Последний анализ позволяет предположить, что инфицированные животные находились на рынке в то же время, когда там появились первые случаи заболеваний COVID-19. «Это еще одно косвенное доказательство, которое указывает на связь возникновения пандемии SARS-CoV-2 с рынком Хуанань», - отмечает Кристиан Дростен, вирусолог из Университетской клиники Шарите в Берлине.
Большинство исследователей сходятся во мнении, что SARS-CoV-2 произошел от животных. Однако, поскольку прародитель вируса не был найден в организме животного, некоторые продолжают утверждать, что вирус мог вырваться на свободу - случайно или намеренно - из Уханьского института вирусологии. В подробном отчете, опубликованном в прошлой этой недели специальным комитетом Палаты представителей США, в котором большинство составляют республиканцы, делается вывод, что пандемия «скорее всего, возникла в лаборатории в Ухане».
Вскоре после закрытия рынка Хуанань 1 января 2020 года группа исследователей из Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний в Пекине посетила рынок и взяла мазки с прилавков, стен, мусорных баков, канализационных колодцев и продуктов животного происхождения, хранившихся в морозильных камерах. Они секвенировали ДНК и РНК из этих мазков и поместили полученные данные в геномную базу данных.
Анжела Расмуссен, вирусолог из Университета Саскачевана (Канада), решила более тщательно изучить эти данные на предмет потенциальных животных-посредников. Она изучила геномные данные животных, найденных на рынке, которые восприимчивы к SARS-CoV-2. Среди них были американская норка (Neogale vison), горностай (Mustela erminea), масковая пальмовая циветта (Paguma larvata), енотовидная собака (Nyctereutes procyonoides), красная лисица (Vulpes vulpes) и большой барсук (Arctonyx collaris).
Когда животное заражается вирусом, его клетки создают копии генов, которые производят белки, необходимые для борьбы с инфекцией. Исследования человеческих клеток и тканей выявили специфическую картину повышенного копирования генов, которое происходит в ответ на заражение вирусом SARS-CoV-2 или другими близкородственными вирусами, встречающимися у летучих мышей. Расмуссен обнаружила ту же закономерность в профилях РНК людей, побывавших на рынке, и двух видов восприимчивых животных, которые там находились: енотовидных собак и больших барсуков.
По мнению Стэнли Перлмана, вирусолога из Университета Айовы, анализ находит доказательства того, что иммунная система некоторых животных была активирована, что подтверждает теорию о том, что они были инфицированы. Но «это не заменяет обнаружения вируса у инфицированного животного». Кей Сато, вирусолог из Токийского университета, сообщил, что надеется изучить ткани енотовидных собак, зараженных SARS-CoV-2 и другими родственными вирусами, чтобы получить более четкое представление о том, какие гены копируются у этих животных в ответ на заражение коронавирусом.
