У коронавирусов, вызывающих SARS и SARS-COV-2, шипы могут переходить в "активную" и "неактивную" позицию. Новые исследования показывают, как эти молекулярные движения могут сделать вирус КОВИД-19 более инфекционным по сравнению с SARS.
Махмуд Моради и его коллеги из лаборатории Университета Арканзаса, обнаружили одну причину, которая, вероятно, делает SARS-CoV-2, гораздо более контагиозным, чем SARS-CoV-1, который вызвал вспышку SARS в 2003 году. Моради представил результаты исследования 25 февраля, на 65-м ежегодном заседании Биофизического общества.
Для проникновения в клетку белки шипов должны быть репозиционированы. Ученым известно положение "неактивных" и "активных" состояний белков спайка как SARS-CoV-1, так и вируса -2, но Моради и его коллеги хотели изучить, как спайки перемещаются из одного положения в другое и динамику этих движений. Они обратились к молекулярному моделированию, проведенному в Техасском вычислительном центре и Питтсбургском суперкомпьютерном центре.
"В этих симуляциях мы обнаружили, что SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 имеют совершенно разные способы изменения своей формы и на разных временных шкалах", - говорит Моради. "SARS-CoV-1 движется быстрее, он быстро активируется и деактивируется и у него не так много времени, чтобы прикрепиться к человеческой клетке, потому что он не стабилен. SARS-CoV-2, с другой стороны, стабилен и всегда готов к атаке", - добавил он.
Существует область на конце белка шипа, которая в основном игнорируется в исследованиях, говорит Моради, но этот фрагмент важен для стабильности белка. Мутации в этой области могут повлиять на трансмиссивность, говорит он, и на них стоит обратить внимание. Другим следствием их работы является то, что "мы могли бы разработать терапевтические средства, которые изменяют динамику и делают неактивное состояние более стабильным, тем самым способствуя деактивации SARS-CoV-2".
По словам Моради, в случае появления нового коронавируса или мутации SARS-CoV-2 очень важно проводить такие симуляции, чтобы можно было предсказать, может ли новый вирус или его вариант быть более трансмиссивным. Сейчас ученые начали исследовать новый вариант SARS-CoV-2 B.1.1.7, чтобы выявить отличия в его движениях.
