Повышенная опасность летальности от варианта 202012/01 SARS-CoV-2 в исследованных сообществах (аннотация)Повышенная опасность летальности от варианта 202012/01 SARS-CoV-2 в исследованных сообществах (аннотация)
VOC 202012/01, вариант SARS-CoV-2, впервые обнаруженный в Великобритании в сентябре 2020 года, распространился на многие страны мира.
В ряде исследований было установлено, что этот новый вариант является более трансмиссивным, чем ранее существовавшие варианты SARS-CoV-2, однако не было установлено, приводит ли этот новый вариант к каким-либо изменениям в степени тяжести заболевания. Мы анализируем большую базу данных результатов тестирования сообществ на SARS-CoV-2 и смертности от КОВИД-19 в Англии, которые составляют приблизительно 47% всех тестов на SARS-CoV-2 и 7% летальности от КОВИД-19 в Англии в период с 1 сентября 2020 года по 22 января 2021 года.
Среди нескольких мутаций этого варианта делеция Spike Δ69/70 влияет на обнаружение S-гена некоторыми РТ-ПЦР тестами (например, TaqPath COVID-19 RT-PCR тест, ThermoFisher), что приводит к тому, что называется "Spike gene target failure (SGTF)" (повреждение таргетного гена шипа) или "Spike gene drop out" (выпадение гена шипа). В этом контексте SGTF успешно применяется в качестве индикатора указания распространения высокотрансмиссивной линии В.1.1.7 и мониторинга ее распространения.
Мы оцениваем, что опасность летального исхода случаев SGTF на 30% (95% CI 9-56%) выше, чем среди случаев не-SGTF после корректировок на возраст, пол, этническую принадлежность, место жительства и дату проведения теста. В абсолютном выражении этот повышенный риск летальности корреспондирует с риском летальности для мужчин в возрасте 55-69 лет, возрастающему с 0,56% до 0,73% (95% CI 0,60-0,86%) в течение 28 дней после положительного результата теста на SARS-CoV-2.
В целом мы оцениваем риск летальности, связанный с VOC 202012/01 на 35% (12-64%) выше. Наш анализ показывает, что VOC 202012/01 не только более трансмиссивный, чем ранее существовавшие варианты SARS-CoV-2, но и может вызвать более тяжелые формы заболевания.
