При анализе тысяч пациентов обнаружен ген, ассоциированный с длинным COVID

Авторы/авторы:
При анализе тысяч пациентов обнаружен ген, ассоциированный с длинным COVID
Частицы SARS-CoV-2 (зеленые) на инфицированной клетке почки (красные). Фото: Steve Gschmeissner/Science Photo Library
27 июля 2023
36
0

Первый геномный поиск факторов риска "длинного" COVID может проложить путь к более масштабным исследованиям.

   В первом генетическом исследовании, направленном на поиск генетических факторов риска возникновения длительного течения COVID, обнаружена последовательность ДНК вблизи гена FOXP4, который активен в легких и некоторых иммунных клетках. В исследовании, опубликованном в виде препринта 1 июля, использовались данные, собранные у 6450 человек с длительным течением COVID в 16 странах. Исследователи надеются, что этот анализ будет только началом: необходимо собрать огромное количество данных, чтобы разобраться в таком сложном заболевании, как длинный COVID, которое ассоциируется с более чем 200 симптомами, включая сильную утомляемость, невралгические боли, трудности с концентрацией внимания и памятью.

   "Очень важно, что такие исследования проводятся", - считает Крис Понтинг, изучающий медицинскую биоинформатику в Эдинбургском университете (Великобритания). "По мере увеличения числа случаев это исследование будет набирать обороты и увеличивать свою значимость". По словам Стефани Лонге, иммунолога из Университета Жана Монне в Сент-Этьене, Франция, подобные исследования являются первыми шагами на пути к получению новых знаний о причинах длинного COVID. "Есть несколько ключевых тем, которые очень важны для пациентов, включая лечение и профилактику", - говорит она. "Когда причины, возможно, многофакторные, [будут] четко поняты, это поможет лечить пациентов, которые будут более предрасположены к развитию длительного COVID, и, возможно, предотвратить его".

   В течение более трех лет в рамках глобальной инициативы по генетике носителей COVID-19 ведется поиск последовательностей ДНК, которые ассоциируются с риском развития тяжелой формы COVID-19. В ходе продолжающихся поисков были обнаружены гены, участвующие в работе иммунной системы и позволяющие вирусу SARS-CoV-2 проникать в клетки. По словам Хуго Зеберга, генетика из Каролинского института в Стокгольме и ведущего автора препринта, исследование COVID является продолжением этой работы. Для изучения этого заболевания группа специалистов собрала данные 24 исследований, в которых приняли участие в общей сложности около 6500 человек с диагнозом "длинный COVID", а также более миллиона других участников, выступавших в качестве контроля.

   В ходе анализа, объединившего данные 11 таких исследований, ученые обнаружили определенный участок генома, который ассоциируется с примерно 1,6-кратным повышением вероятности развития длительного COVID. Этот участок ДНК находится рядом с геном FOXP4, который активен в легких и других органах. Вариант, связанный с длинным COVID, также ассоциируется с повышенной экспрессией FOXP4 в клетках легких.

   В предыдущих исследованиях этот же ген был связан с повышенным риском развития тяжелой формы COVID-19, а Зеберг и его коллеги обнаружили, что он также ассоциируется с раком легких. Хотя наличие тяжелого COVID-19 повышает риск развития длительного COVID, авторы обнаружили, что вклад этого варианта ДНК в риск развития длительного COVID слишком велик, чтобы его можно было объяснить только его связью с тяжелым COVID-19. "Этот вариант оказывает гораздо более сильное влияние на длительный COVID, чем на тяжесть", - утверждает Зеберг.

   Чжуншань Ченг, биоинформатик из Детской исследовательской больницы Святого Иуды в Мемфисе, считает, что повторение этого результата в других исследованиях поможет укрепить полученные выводы. Он отмечает, что многие данные, использованные в анализе длинного COVID, были также использованы в исследовании, выявившем связь между FOX4P и тяжелым COVID-19. Свежие данные помогут исключить возможность влияния других факторов, например, рака легких, на очевидную связь с FOX4P. Несмотря на это, исследование является прорывом, считает Ченг, и будущие работы, вероятно, пополнят список известных генетических факторов риска длительного COVID.

   "Это будет не просто один, а целый ряд уязвимых факторов, влияющих на то, почему люди не восстановились после COVID", - говорит Понтинг. Он и его коллеги предложили провести исследование, в которое должны были войти ДНК 15 000 человек с длительным течением COVID. Но грантодатели отклонили это предложение, поскольку, по их мнению, это заболевание слишком сложное, чтобы его можно было изучить таким образом, как предлагала команда Понтинга. "Я с этим не согласен", - говорит он. Это очень сложное, но в то же время очень важное заболевание, которое необходимо изучить. Медицинские и социально-экономические затраты, связанные с длительным течением COVID, огромны".

Источник:

Nature 619, 445 (2023)

Комментариев: 0
Узнайте о новостях и событиях микробиологии

Первыми получайте новости и информацию о событиях