Легочные инфекции вызываются различными патогенами, включая бактерии, вирусы, грибки и паразиты.
Различия в факторах окружающей среды, популяциях больных и тяжести заболевания способствуют разнообразию патогенов у разных пациентов. Появление организмов с множественной лекарственной устойчивостью и новых патогенов создает проблемы в клинической диагностике и лечении. В настоящее время для выявления легочных патогенов используются традиционные микробиологические методы (ТММ), включающие культивирование микроорганизмов, анализ на антигены и антитела и выявление нуклеиновых кислот с помощью методов полимеразной цепной реакции.
Однако эти методы часто демонстрируют низкую чувствительность при выявлении патогенов из-за таких недостатков, как длительное время выполнения и низкая степень обнаружения, что затрудняет определение клиницистами точного плана лечения. Поэтому быстрая и точная идентификация патогенов имеет решающее значение. Метагеномное секвенирование следующего поколения (mNGS) - это метод идентификации патогенов, обеспечивающий высокую чувствительность, высокую специфичность и широкий охват патогенов, что позволяет получить важную информацию о легочных инфекциях. Несмотря на некоторые ограничения, этот метод позволяет быстро и точно идентифицировать патогены для проведения эффективного лечения, улучшая прогноз пациента и демонстрируя значительный потенциал в клиническом применении.
В наше исследование было включено 188 пациентов с подозрением на легочную инфекцию, проходивших лечение с августа 2022 по декабрь 2023 года. Для диагностики возбудителей использовались традиционные микробиологические методы (ТММ) и mNGS. Для тестирования патогенов легочных инфекций использовались такие образцы, как жидкость бронхоальвеолярного лаважа, кровь, мокрота и т. д.
Статистические результаты показали, что mNGS значительно превосходили ТММ. Примечательно, что частота положительных результатов при использовании mNGS была значительно выше, чем при использовании ТММ (86,17% против 67,55%). С помощью mNGS мы выявили 96 патогенов, в том числе 59 бактерий, 18 грибов, 15 вирусов и 4 специфических патогена. В отличие от этого, с помощью ТММ было выявлено 28 видов, включая 25 бактерий и 3 грибка. Эффективность решений по антибиотикотерапии, принятых на основании результатов mNGS, составила 40,60%. Из 54 случаев с положительным эффектом лечения результаты mNGS способствовали лечению и улучшению прогноза 16 инфекций, вызванных нетипичными патогенами.
Полученные нами результаты подтвердили важную роль mNGS в диагностике легочных инфекций, что позволяет выявлять их на ранних стадиях и оперативно разрабатывать целевую противоинфекционную терапию. Мы рекомендуем использовать mNGS в клинической практике для повышения эффективности лечения и улучшения прогноза пациентов.
