microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Точная идентификация видов энтеробактерий, возбудителей инфекций кровотока полногеномным секвенированием, Китай (аннотация)
Точная идентификация видов энтеробактерий, возбудителей инфекций кровотока полногеномным секвенированием, Китай (аннотация)

Автор/авторы:
share
236
backnext

Клиническое значение Enterobacter spp. остается неясным, поскольку фенотипическая идентификация видов энтеробактерий ненадежна. 

   Мы провели геномное исследование 48 случаев инфекций кровотока, вызванных энтеробактериями с использованием in silico ДНК-ДНК гибридизации для точной идентификации.

   Штаммы принадлежали к 12 видам; Enterobacter xiangfangensis (n = 21) и неназванный вид (таксоны 1, n = 8) были доминирующими. Большинство (63,5%) штаммов энтеробактерий (n = 349) с геномами из GenBank из человеческой крови были E. xiangfangensis; следующим по распространенности был таксон 1 (19,8%). 

   E. xiangfangensis и таксон 1 ассоциировались с повышенной смертностью (20,7% против 15,8%), более длительной госпитализацией (медиана 31 d против 19,5 d) и более высокой устойчивостью к азтреонаму, цефепиму, цефтриаксону, пиперациллин-тазобакату и тобрамицину. Штаммы принадлежали к 37 сиквенс-типам (STs); наиболее распространенным был ST171 (E. xiangfangensis) (n = 6). Четыре штамма ST171 принадлежали к определённому клону. 

   Точная идентификация видов имеет большее значение для эпидемиологии и инфекционного контроля, чем лечение.

Tабл. 1

Штаммы Enterobacter в геномном исследовании инфекций кровотока, вызванных Enterobacter, Китай

StrainDateSpecies, by isDDHST†CarbapenemaseBSI typesHospitalization, dDeath
PSCLAHABefore BSIAfter BSI
090034201706Enterobacter asburiaeN12+027
090058201805E. asburiae879+++2218
090031201711E. bugandensisN10+10+
090283201610E. bugandensisN16++76
090210201607E. bugandensis499+116
090029201709E. bugandensis718NDM-5++7116+
090028201708E. chuandaensisN9+111
090005201706E. cloacae1NDM-1+++2911
090016201703E. cloacae519++1724
090014201712E. cloacae922++010
090027201704E. hormaechei528++2438
090003201705E. hormaechei696++015
045002201609E. huaxiensisN1+07
090008201709E. huaxiensisN1++323
090017201702E. ludwigii12++68
045158201607E. roggenkampiiN2++37
090037201608E. roggenkampii984+++148
090032201712E. sichuanensisN11+++616+
090004201706E. xiangfangensisN3++613
090006201707E. xiangfangensisN4++128
090007201707E. xiangfangensisN5++2419
090012201711E. xiangfangensisN6+03
090018201705E. xiangfangensisN7+++1214+
090020201712E. xiangfangensisN8+++460
090057201804E. xiangfangensisN15NDM-1+++3643
090015201712E. xiangfangensis50+02
090026201704E. xiangfangensis50++1152
090035201712E. xiangfangensis127++1320
045001201801E. xiangfangensis171NDM-1+++833
090011201710E. xiangfangensis171NDM-5++714+
090022201802E. xiangfangensis171NDM-5++4020
090023201802E. xiangfangensis171NDM-5+++2619
090055201806E. xiangfangensis171NDM-5++1414
090059201805E. xiangfangensis171NDM-5+++1731
090043201612E. xiangfangensis337++114+
090013201711E. xiangfangensis418NDM-5+++2810+
090038201609E. xiangfangensis418++333
090060201806E. xiangfangensis550+++208+
090042201611E. xiangfangensis828++53
090036201605Taxon 1N13+++1322
090019201706Taxon 178++1662
090030201709Taxon 178+++015
090039201610Taxon 178++128+
090021201801Taxon 197+++528
090009201709Taxon 1104++566
090033201704Taxon 1316++103
090056201803Taxon 1568++117
090040201611Taxon 2N14+++208370

*BSI -инфекции кровотока; CLA - катетер-ассоциированные; HA - внутрибольничные; isDDH - in silico ДНК–ДНК гибридизация; P - первичная; S - вторичная; ST - сиквенс-тип

Оригинальная статья: https://wwwnc.cdc.gov/eid/arti...

Источник:CDC EID Journal, Volume 27, Number 1—January 2021
Вам также может быть интересно
Комментариев: 0
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up