microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Международные новости
C. difficile активизируется, сотрудничая с энтерококками и другими микроорганизмами кишечника
#условно-патогенные бактерии #мутуализм #кишечный микробиом #энтерококки #токсины c.difficile #c. difficile
Clostridioides difficile склонна "сотрудничать" с микроорганизмами в желудочно-кишечном тракте, такими как патогенные энтерококки, которые могут помочь бактерии процветать, говорится в исследовании, опубликованном в журнале Nature.    "Меня лично всегда восхищала C. difficile как патоген", - говорит Джозеф П. Закулар, автор исследования и доцент кафедры патологии и лабораторной медицины в Медицинской школе Перельмана при Пенсильванском университете. "Очевидно, что это действительно большая проблема общественного здравоохранения, она вызывает много заболеваний у детей и взрослых, и это большая проблема у пожилых пациентов.    В качестве движущего фактора своего интереса к тому, как C. difficile реагирует в различных кишечных трактах, Закулар назвал свое образование в области микробной экологии. "Меня всегда интересовали микробные сообщества и то, как они взаимодействуют друг с другом", - рассказывает Закулар. "Микробиом каждого человека очень разный ... мы предположили, что контекст экосистемы, в которую проникает C. diff, может играть определенную роль во время инфекции, и именно это побудило нас заняться этим вопросом".    В своем исследовании Закулар и коллеги изучили образцы кала 54 педиатрических пациентов с инфекцией C. difficile. "Мы искали организмы с помощью анализа микробиома, которые были бы связаны с этой инфекцией", - сообщил Закулар. "И одна из вещей, которую мы обнаружили, заключалась в том, что эта оппортунистическая, патогенная группа бактерий, рода Enterococcus, была ассоциирована с инфекцией C. difficile, и это было показано ранее в литературе. Используя анализ микробиома пациентов, мы обнаружили действительно сильную сигнатуру энтерококка, и нам захотелось узнать, имеет ли это значение?".    После изучения этого в лабораторных условиях исследователи обнаружили, что энтерококки увеличивают количество токсина, вырабатываемого C. difficile, и провели метаболическое моделирование, чтобы выяснить, как взаимодействуют эти два организма. "В результате всех этих анализов мы обнаружили, что энтерококки перестраивают метаболизм C. difficile, предоставляя C. difficile аминокислоты, а также ограничивая другие метаболические сигналы, которые позволяют C. difficile быть более патогенной, но при этом более приспособленной", - сказал Закулар. "Они обеспечивают C. diff питательными веществами, но в то же время лишают ее других метаболических сигналов, что заставляет ее быть и приспособленной, и патогенной".    Закулар отметил, что они были удивлены способностью энтерококков "ремоделировать кишечник во время инфекции". "Вы считаете само собой разумеющимся, что экосистема [кишечника] всегда одна и та же, но мы обнаружили, что доминирование этого условно-патогенного патогена полностью перестраивает эту среду, и это может быть воспринято патогеном и действительно перестраивает его поведение и патогенез", - говорит Закулар. "Это два патогена, которые сотрудничают в кишечнике, и это невероятно увлекательно", - добавил он. "Это открывает совершенно новый взгляд на C. difficile".
Исследователи выявили 35 генов, которые высоко экспрессируются у пациентов с длительной болезнью Лайма
#мрнк #биомаркеры воспаления #генная диагностика #транскриптомика #болезнь Лайма
Исследователи определили 35 генов, которые особенно сильно экспрессируются у людей с длительным течением болезни Лайма.     Эти гены потенциально могут быть использованы в качестве биомаркеров для диагностики пациентов. Результаты, опубликованные 15 ноября в журнале Cell Reports, могут также привести к новым терапевтическим мишеням. Исследование является одним из первых, использующих транскриптомику в качестве анализа крови для измерения уровня РНК у пациентов с длительной болезнью Лайма.    Хотя большинство пациентов диагностируются и лечатся антибиотиками на самых ранних стадиях болезни Лайма, около 20 % пациентов развивают долгосрочные осложнения, которые могут включать артрит, неврологические симптомы, и/или проблемы с сердцем. "Мы хотели понять, есть ли конкретный иммунный ответ, который может быть обнаружен в крови пациентов с долгосрочной болезнью Лайма для разработки лучшей диагностики для этого изнурительного заболевания. Все еще остается критическая неудовлетворенная потребность, так как это заболевание так часто остается недиагностированным или неправильно диагностированным. Также еще недостаточно понятны молекулярные механизмы длительной болезни Лайма", - рассказал Ави Мааян, старший автор статьи.    В рамках исследования, было проведено секвенирование РНК с использованием образцов крови 152 пациентов с симптомами болезни Лайма после лечения, чтобы оценить их иммунный ответ. В сочетании с данными секвенирования РНК от 72 пациентов с острой болезнью Лайма и 44 неинфицированных контролей, исследователи наблюдали различия в экспрессии генов и обнаружили, что большинство из после лечения болезни Лайма пациентов имели отличительные воспалительные сигнатуры по сравнению с группой острой болезни Лайма. Кроме того, анализируя дифференциально экспрессированные гены в этом исследовании вместе с генами, которые дифференциально экспрессируются в связи с другими инфекциями (из других опубликованных данных), авторы определили подгруппу генов, которые были высоко экспрессированы, что не было установлено ранее для Лайма-ассоциированной воспалительной реакции.    Используя машинное обучение, исследователи еще больше сократили группу генов, чтобы установить совокупность биомаркеров мРНК, способных отличать здоровых пациентов от пациентов с острой формы заболевания или прошедших лечение. Генная панель, которая измеряет экспрессию генов, которые исследователи определили, может быть использована для дифференциальной диагностики болезни Лайма.    "Мы не должны недооценивать значение использования омических технологий, включая транскриптомику, для измерения уровня РНК для выявления наличия многих сложных заболеваний, таких как болезнь Лайма. Диагностика болезни Лайма может представлять собой значительный прогресс для потенциально лучшего управления этим заболеванием", - отметил Мааян. Далее исследователи планируют повторить исследование, используя данные транскриптомики единичных клеток, и применить подход машинного обучения к другим сложным заболеваниям, которые трудно диагностировать, а также разработать диагностическую генную панель и протестировать ее на образцах пациентов.
Картинка 1
Аннотация
Микробный сенсинг контролирует иммунные реакции хозяина (аннотация)
#бактериальные системы секреции #межбактериальная коммуникация #кворум сенсинг #иммунная система #аутоиммунные заболевания #молекулярные паттерны ассоциированные с микробами (mamps) #патоген-ассоциированные молекулярные паттерны (pamps) #патогенные микроорганизмы #комменсалы
Картинка 1
Преданность Луи Пастера истине изменила наши представления о здоровье и заболеваниях
#пастер #история микробиологии
Картинка 1
Аннотация
Новая терапевтическая проблема: гены резистентности к антибиотикам при распространенных хронических заболеваниях (аннотация)
#трансплантация фекальной микробиоты #резистом #пробиотики #воспалительные заболевания кишечника #хронические заболевания почек #цирроз печени #сердечно-сосудистые заболевания #кишечный микробиом #диабет 2го типа #диабет #горизонтальный перенос генов #хронические заболевания #гены резистентности #бактериальная резистентность
Картинка 1
Вакцинация против гриппа необходима детям с тяжелой формой эпилепсии из-за высокого риска судорог после заражения гриппом
#эпилепсия #грипп #вакцинация
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up