microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Международные новости
Почему Омикрон так контагиозен?
#эпидемиологические модели #варианты sars-cov-2
Новый вариант коронавируса может лучше, чем другие варианты, избегать иммунной защиты человека - но эта способность может быть различной в разных странах.    Ученые пытаются смоделировать глобальную траекторию Омикрона, которая зависит от двух факторов. Первый - его контагиозность, второй - его способность ускользать от иммунной системы человека. По словам Марка Липсича, эпидемиолога из Гарвардской школы общественного здравоохранения, "выяснение того, в какой степени передаваемость и уклонение от иммунитета способствуют распространению этого варианта, позволит нам предсказать, сколько людей может заразить Омикрон и как быстро".    Передаваемость отражает способность вируса реплицироваться в клетках человека и распространяться от человека к человеку. "Она зависит от всевозможных биологических процессов", - объясняет Джеффри Шаман, специалист по моделированию инфекционных заболеваний в Школе общественного здравоохранения при Колумбийском университете. "Связывается ли он легче с рецепторами в легких людей? Выделяете ли вы его более эффективно и большее его количество, чтобы заразить больше людей?". Уклонение от иммунной системы, с другой стороны, - это способность вируса избегать антител, которые в противном случае пометили бы его для уничтожения организмом, а также способность уклоняться от различных клеток иммунной системы.    Ключевой шаг в оценке распространения вируса - начать с одного инфицированного человека и оценить, сколько других людей заразятся вирусом от этого человека. В условиях продолжающейся пандемии ученые пытаются зафиксировать эту оценку с помощью величины, называемой эффективным числом репродукции, или Rt. Переменная "t" представляет собой число вторичных инфекций и зависит от влияния иммунитета других людей, сезонных погодных условий, мероприятий в области общественного здравоохранения и других ограничений на передачу вируса. Rt "может меняться от минуты к минуте в зависимости от реальных условий", - говорит Липсич. "Мы используем его, чтобы определить, насколько быстро растет или сокращается вспышка". Значение R2, например, означает, что один человек заразит двух других, в то время как значение R5 означает, что человек распространит вирус среди пяти человек, увеличивая число инфицированных гораздо быстрее.    Появились оценки Rt для Омикрона. 9 декабря Национальный институт инфекционных заболеваний Южной Африки (NICD) сообщил, что к началу ноября Rt в этой стране стабилизировался на уровне ниже единицы, что означает, что количество случаев заболевания фактически снизилось в период, когда Дельта была доминирующим вариантом и сталкивалась с широко распространенным иммунитетом среди населения. Но затем в середине ноября Rt неожиданно вырос. Теперь он превышает 2 на большей части страны и превышает 2,5 в густонаселенной провинции Гаутенг, а также в провинциях Квазулу-Натал и Мпумаланга.    Ученые NICD рассчитали это значение, используя лабораторно подтвержденные случаи и данные о госпитализации. По словам Карла Пирсона, специалиста по математическому моделированию из Лондонской школы гигиены и тропической медицины, тесно сотрудничающего с южноафриканскими исследователями, Rt в данном случае включает и другие варианты, помимо Омикрона, но внезапный рост указывает на то, что новый вариант создает много новых инфекций.    Ученые из Агентства по безопасности здоровья Соединенного Королевства сообщили, что Rt для самого Омикрона составляет 3,7. Это тревожно высокое число, представленное в техническом брифинге, опубликованном 10 декабря, частично основано на данных о том, что число случаев заражения Омикроном в Великобритании удваивается каждые три дня. При таких темпах Омикрон представляет собой гораздо большую угрозу с точки зрения количества случаев, чем Дельта, написал Тревор Бедфорд, специалист по моделированию инфекционных заболеваний из Онкологического центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле, в серии подробных комментариев в Твиттере.    Пока неизвестно, подчеркнул Бедфорд, насколько быстрое распространение Омикрона обусловлено его врожденной способностью к передаче инфекции, а не его способностью обходить иммунную защиту. Если популяция в целом невосприимчива к другим вариантам, считает он, то Омикрон будет быстро распространяться, даже если он не обладает изначально превосходящей способностью к передаче, поскольку иммунные системы людей будут подавлять конкурирующие варианты.    Доказательства того, что Омикрон действительно уклоняется от иммунного ответа человека, поступают из разных источников. Одним из признаков является то, что он повторно заражает людей, которые уже переболели этим вирусом. Группа под руководством Джулиет Пуллиам, эпидемиолога, возглавляющего Центр передового опыта DST-NRF по эпидемиологическому моделированию и анализу в Университете Стелленбош, Южная Африка, сообщила 2 декабря, что в этой стране произошло более 35 000 случаев повторного инфицирования SARS-COV-2 среди 2,8 миллиона человек, у которых в течение последних трех месяцев были выявлены положительные результаты анализа на SARS-COV-2. Другое исследование, проведенное группой под руководством Алекса Сигала, вирусолога из Африканского научно-исследовательского института здравоохранения в Дурбане, ЮАР, показало, что нейтрализующие антитела в образцах крови людей, привитых вакциной Pfizer-BioNTech, были примерно в 40 раз менее эффективны против Омикрона, чем против других вариантов.    Но предвещают ли лабораторные эксперименты Сигала снижение защиты от вакцин в реальной жизни, пока неясно, говорит Сара Коби, эпидемиолог и эволюционный биолог из Чикагского университета. Потому что "иммунное бегство - это гораздо больше, чем нейтрализация антител". Вакцины также активируют специализированные иммунные клетки, которые уничтожают инфицированные клетки, поэтому Омикрон должен будет избегать и их. "Иммунное уклонение нельзя точно измерить в лаборатории", - говорит Коби.    В течение ближайших недель ученые оценят, как соотносятся показатели Rt Омикрона в местах с различной историей инфекций и уровнем вакцинации. Шаман говорит, что неясно, насколько то, что наблюдалось в Южной Африке, применимо к другим местам. Например, в США никогда не было волны инфекций, вызванных вариантом Бета, в то время как в Южной Африке она была, и воздействие различных вариантов может изменить иммунные реакции населения США. "Мы сразу перешли от предкового варианта Альфа к Дельта", - говорит он. "И эти вещи могут изменить то, насколько большая часть населения теперь восприимчива к новому варианту. Нам остается только наблюдать, как все это оформится со временем".
Омикрон распространяется в бронхах в 70 раз быстрее, чем Дельта
#варианты sars-cov-2
Недавно полученные предварительные данные свидетельствуют о том, что вариант Омикрон может поражать и инфицировать ткани в дыхательных путях с иной скоростью, чем вариант Дельта и другие предшественники.    Фактически, по мнению некоторых экспертов, вариант Омикрон может быть обязан своей повышенной трансмиссивностью тому, что он способен инфицировать ткани бронхов в гораздо большей степени, чем легкие.     Результаты исследования, которое еще не прошло экспертную оценку, были опубликованы в среду (15 декабря) в пресс-релизе Гонконгского университета. В препринте сообщается, что новый вариант SARS-CoV-2 размножается быстрее в культуре бронхиальной ткани человека, но медленнее в легочной ткани, чем вариант Дельта, что потенциально объясняет, почему он так быстро распространяется от человека к человеку. Было показано, что Омикрон реплицировался в бронхиальной ткани в течение 24 часов примерно в 70 раз интенсивнее чем вариант Дельта. Однако Омикрон реплицировался в легочной ткани более чем в 10 раз медленнее, чем исходный вариант коронавируса.     Трудно экстраполировать клинические последствия такого рода лабораторных исследований, но ученые предполагают, что быстрая репликация в бронхах может объяснить, почему вариант Омикрон кажется таким высоко контагиозным - он распространяется более чем в два раза быстрее, чем Дельта. Более глубокое проникновение других вариантов в легкие может объяснить предварительные сообщения о том, что случаи заболевания, вызванные Омикроном, как правило, протекают более мягко, чем случаи, вызванные другими вариантами - хотя существуют противоречивые данные по этому вопросу, а также альтернативные объяснения. Этот вывод "не был для меня удивительным", - говорит педиатр и эксперт по инфекционным заболеваниям Бет Тилен из Университета Миннесоты. "Быстрота, с которой Омикрон превзошел Дельту в Южной Африке говорит о том, что у него есть преимущество".      По словам Тилен, идея о том, что инфекция в верхних дыхательных путях может привести к большей передаваемости заболевания, вполне логична. По ее словам, когда люди кашляют и чихают, аэрозоли, которые они выбрасывают, будут полны Омикроном - в большей степени, чем если бы инфекция находилась преимущественно в нижних отделах легких. То, что вирус, находящийся в верхних дыхательных путях, связан с повышенной трансмиссивностью, но менее тяжелым заболеванием, также отражает то, что ученые знают о различных штаммах гриппа, хотя Тилен предупреждает, что сравнение гриппа с SARS-CoV-2 является некорректным.    Если вспомнить грипп A H5N1 ("птичий грипп"), который попал в заголовки газет в середине 2000-х годов, "мы склонны считать его высокопатогенным, но не особо передающимся", - отмечает микробиолог и эксперт по инфекционным заболеваниям Университета Новой Англии Меган Мэй. "Это объясняется тем, что он предпочитает реплицироваться в тканях нижней части легких и не способен реплицироваться в верхних дыхательных путях - легкие разрушаются, что приводит к тяжелым формам заболевания, но лишь немногие вирусы выдыхаются/вдыхаются другими людьми".    По словам пульмонолога Университетской больницы North Shore Хью Кассиера, это также позволяет предположить, что вирус, который оказывает меньшее воздействие на легкие, может привести к менее тяжелому заболеванию. "Глядя на эти данные и узнав опыт Южной Африки, я думаю, что эти данные, вероятно, подтвердятся", - говорит Кассиер. В частности, сделанный в препринте вывод о том, что уровень легочных инфекций при Омикроне был в десять раз ниже, чем при оригинальном SARS-CoV-2, "совпадает с данными из Южной Африки, где госпитализации не так сильно растут, как инфекции, или как это было при Дельте, как и уровень летальности", - говорит он.    Однако, хотя в ходе исследования была обнаружена разница в скорости инфицирования легких между оригинальным SARS-CoV-2 и Омикроном, Мэй отмечает, что не было статистически значимой разницы между скоростью репликации Омикрона и Дельты в легочной ткани ни через 24, ни через 48 часов. "Это говорит о том, что скорость репликации вируса в легочной ткани не может быть причиной всех различий в тяжести заболевания", - говорит она.   Одним из ограничений исследования является то, что образцы тканей легких и бронхов являются несовершенными моделями того, что может произойти при встрече с вирусом в естественных условиях. Ни одна из моделей не учитывает иммунный ответ, который может защитить от вируса, вызвать опасный цитокиновый шторм или и то, и другое, а также не учитывает роль вакцин. Тилен говорит, что работа по-прежнему информативна, просто есть дополнительные факторы, которые необходимо учитывать.   "Метод исследования с использованием культуры легочной ткани представляется разумной моделью ex vivo для анализа вирусной репликации", - говорит иммунолог Университета Колорадо Эйми Бернард. Но она добавляет, что вопросы, не затронутые в сообщении, включая размер выборки и количество повторных экспериментов, не позволяют ей слишком доверять выводам исследования. "Если число [экспериментов] 100, это может быть значимо. Если их количество 1 или 2, это может ввести в заблуждение".   Хотя данные, опубликованные на этой неделе южноафриканской медицинской страховой компанией Discovery Health, указывают на более низкий уровень госпитализации во время нынешней волны Омикрона, чем во время предыдущих вспышек, они могут не отражать полной картины, поскольку вариант Омикрон распространился среди более интенсивно вакцинированного населения, чем первоначальный вариант SARS-CoV-2 и Дельта. Эти и другие факторы, зависящие от контекста, затрудняют получение четкого представления о том, как Омикрон конкурирует с другими вариантами. "Сложность заключается в том, что вакцины являются реальным потенциальным запутывающим фактором", - говорит Тилен, добавляя, что "мы знаем, что вакцины предотвращают тяжелые заболевания и смерть".   Одним из способов подтверждения гипотез исследователей Университета Гонконга о клинических исходах, по словам Кассиера, будет анализ биомаркеров воспаления в образцах крови пациентов с коронавирусом. Он ожидает, что среди пациентов с вариантом Омикрон их будет меньше, что говорит о более слабом воспалительном иммунном ответе.   Даже если случаи заболевания, вызванные Омикроном, обычно протекают в относительно легкой форме, повышенная трансмиссивность этого варианта делает его очень опасным. Как отмечает в пресс-релизе ведущий автор исследования, исследователь общественного здравоохранения Гонконгского университета Майкл Чан Чи-вай, "заражая гораздо больше людей, вирус может вызвать более тяжелые заболевания и смерть, даже если сам вирус может быть менее патогенным", что означает, что "совокупная опасность варианта Омикрон, вероятно, очень велика".   Еще один препринт, опубликованный во вторник (14 декабря) исследователями из Гарвардского университета и Massachusetts General Hospital, показал, что сильно мутировавший белок спайка Омикрона проникает в эмбриональные клетки почек человека и инфицирует их лучше, чем предыдущие варианты. Иммунолог и соавтор препринта Вильфредо Гарсия-Белтран сообщил, что "вероятно, будет доказано", что Омикрон может инфицировать людей при меньшей дозе, чем другие варианты, "учитывая, что мы рассматриваем вариант с более эффективным проникновением в клетки человека".   Однако результаты исследования гонконгской группы могут указывать на то, что Омикрон просто побеждает иммунную систему благодаря своей численности, полагает Кассиер, реплицируясь до такой степени, что иммунная система не может ее контролировать. "Если ваша крепость окружена, вы можете отбиться от 10 000 солдат, но не от 100 000 солдат или 1 миллиона", - говорит он.
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up