microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Международные новости
Т-клетки приобретают и сохраняют толерантность к бактериям кишечника
#иммуная регуляция кишечника #регуляторные т-клетки #дисбиоз #воспалительные заболевания кишечника
Иммунная система кишечника высоко адаптирована к поддержанию толерантности к комменсальной микробиоте и самоантигенам, одновременно защищаясь от вторжения патогенов.    Понимание того, как разнообразная сеть местных клеток устанавливает гомеостаз и поддерживает его в сложной иммунной среде кишечника, имеет решающее значение для выяснения того, как толерантность может быть восстановлена после дисфункции, например, при воспалительных заболеваниях. Регуляторные  Т клетки (Tregs) - это субпопуляция лимфоцитов, которые контролируют, как иммунная система реагирует на патогенные и комменсальные бактерии. Они играют определенную роль в предотвращении аутоиммунных заболеваний, но нарушаются при воспалительных заболеваниях кишечника, таких как язвенный колит.    Хотя клеточные и молекулярные взаимодействия, которые контролируют развитие и функцию Tregs, были идентифицированы, меньше известно об их клеточном соседствах и пространственном распределении. Если бы это было лучше понятно, можно было бы разработать терапию для восстановления этой толерантности у пациентов с воспалением кишечника. В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature, изучается иммунный ландшафт, влияющий на функцию Tregs. Для этого исследователи из Университета Оксфорда изучили, как Tregs в кишечнике приобретают и поддерживают толерантность к бактерии Helicobacter hepaticus. Используя живую визуализацию in vivo, фотоактивацию, направленное секвенирование РНК единичных клеток и пространственную транскриптомику, ученые проследили естественную историю Tregs, реагирующих на Helicobacter hepaticus, в пространстве и времени в условиях толерантности и воспаления.    Хотя Tregs могут стимулироваться H.hepaticus в любом месте кишечника, исследователи обнаружили, что lamina propria, тонкий слой ткани, который выстилает кишечник, является основной областью, где Tregs способствуют толерантности к этому патобионту. Этот вывод опровергает существующую парадигму, согласно которой активация происходит в основном в небольших лимфоидных скоплениях, расположенных в толстой и прямой кишке. Продукция цитокина IL-10 клетками Tregs была необходима для долгосрочной толерантности к бактериям. Tregs стабильно поддерживали эту толерантность после ее приобретения, но толерантность могла быть нарушена, когда кишечник воспалялся. Во время воспаления субпопуляция дендритных клеток, экспрессирующих CD103 и SIRPα, становилась доминирующей и взаимодействовало с Tregs, нарушая, по-видимому, гомеостаз в ткани.    Исследователи также выявили различные взаимодействия между макрофагами и Tregs в кишечнике, которые, по-видимому, определяют толерантность к H.hepaticus. В частности, они определили пары лигандов и рецепторов на клетках Tregs и макрофагах, которые, вероятно, управляют этим взаимодействием. В совокупности это исследование позволяет по-новому взглянуть на то, где (lamina propria) и как (распределение дендритных клеток, специфическое взаимодействие с макрофагами) может формироваться и поддерживаться толерантность к появлению новых микроорганизмов в кишечнике.    Результаты исследования могут быть использованы для разработки более эффективных методов лечения пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника и других органов. Они также могут способствовать разработке новых методов лечения, направленных на Т-клетки (Т-клеточная терапия), и могут помочь в разработке стратегий пероральной вакцинации, которая должна работать в кишечной нише.    Эмили Торнтон, соавтор исследования, отмечает: "Эта работа посвящена кишечнику, но эффекторные Tregs играют ключевую роль в поддержании толерантности во всем организме и способствуют восстановлению тканей. Хотя взаимодействия, которые мы здесь рассмотрели, важны для толерантности в кишечнике, цель состоит в том, чтобы использовать эти процессы для восстановления толерантности при воспалительных заболеваниях в более широком смысле. Наши результаты раскрывают пространственный механизм толерантности в lamina propria и демонстрируют, как знание локальных взаимодействий может способствовать созданию следующего поколения толерантно-индуцирующих терапий. Эта работа также содержит атлас кишечных микрониш в гомеостатических и воспалительных условиях, что позволит другим группам использовать этот общедоступный ресурс для ответа на свои научные вопросы без необходимости проведения дополнительных экспериментов".
Открытие антибиотиков, избирательно убивающих метаболически неактивные бактерии
#новые антибиотики #машинное обучение #исскуственный интелект #бактериальный метаболизм #бактериальная резистентность
При повторном лечении инфекции врачи рискуют, что бактерии станут резистентными к антибиотикам. Но почему инфекция может вернуться после правильного лечения антибиотиками?     Одна из хорошо задокументированных возможностей заключается в том, что бактерии становятся метаболически инертными, избегая обнаружения традиционными антибиотиками, которые реагируют только на метаболическую активность. Когда опасность миновала, бактерии возвращаются к жизни, и инфекция развивается вновь. " Резистентность развивается с течением времени, и повторные инфекции вызваны этой спячкой", - поясняет Джеймс Дж. Коллинз, руководитель недавней работы, опубликованной в журнале Cell Chemical Biology, которая демонстрирует, как машинное обучение может помочь в отборе соединений, смертельных для спящих бактерий.    Существует необходимость в открытии и разработке нетоксичных антибиотиков, эффективных против метаболически неактивных бактерий, которые лежат в основе хронических инфекций и способствуют развитию резистентности к антибиотикам. Традиционный поиск антибиотиков исторически предпочитал соединения, эффективные против активно метаболизирующих клеток, что не позволяет предсказать эффективность в метаболически неактивных контекстах.   Коллинз недавно попал в заголовки газет благодаря использованию искусственного интеллекта (ИИ) для открытия нового класса антибиотиков, что является частью большой миссии группы по использованию ИИ для значительного расширения существующих антибиотиков. Исследователи из лаборатории Коллинза использовали ИИ для ускорения процесса поиска антибиотических свойств в уже известных лекарственных соединениях. При наличии миллионов молекул этот процесс может занять годы, но исследователи смогли выявить соединение под названием семапимод за пару дней благодаря способности ИИ проводить высокопроизводительный скрининг.    Семапимод - это противовоспалительный препарат, обычно используемый для лечения болезни Крона. Исследователи обнаружили, что он также эффективен против против стационарно-фазовых E. coli и A. baumannii. Открытием стала способность семапимода разрушать мембраны грамотрицательных бактерий, которые известны своей высокой резистентностью к антибиотикам из-за более толстой и менее проницаемой внешней мембраны. "Одним из способов выяснения механизма действия семапимода было то, что его структура была очень большой и напоминала нам о других веществах, нацеленных на внешнюю мембрану", - объясняет Коллинз. Используя микробиологические анализы, биохимические измерения и микроскопию единичных клеток, авторы показали, что семапимод избирательно разрушает и пермеабилизирует внешнюю мембрану бактерий, связывая липополисахариды. Таким образом, нарушая один из компонентов внешней мембраны, семапимод делает грамотрицательные бактерии чувствительными к лекарствам, которые обычно активны только против грамположительных бактерий.    Эта работа иллюстрирует ценность использования нетрадиционных методов скрининга и моделей глубинного обучения для выявления нетоксичных антибактериальных соединений. Коллинз вспоминает цитату из одной давней статьи: "Для грамположительных инфекций нам нужны лучшие антибиотики, но для грамотрицательных инфекций нам нужны любые антибиотики".
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up