33% геномно подтвержденных реинфекций COVID-19 пропускаются при клиническом обследовании33% геномно подтвержденных реинфекций COVID-19 пропускаются при клиническом обследовании
Хотя клинические исследования и оценка порогового значения цикла позволяют отличить реинфекцию COVID-19 от обнаружения вируса от предыдущей инфекции, они не смогли выявить 33% геномно подтвержденных реинфекций, согласно недавнему исследованию.
"Когда у человека, заразившегося COVID-19 пару месяцев назад, повторный положительный тест ПЦР на COVID-19, клиницистам бывает трудно определить, отражает ли этот положительный тест повторное заражение COVID-19 или обнаружение погибшего или остаточного низкоуровневого вируса от предыдущей инфекции", - пояснила Кейтлин Дагдейл, врач отделения инфекционных заболеваний Массачусетской больницы общего профиля. "Понимание того, отражает ли повторный положительный тест "реинфекцию" COVID-19 или нет, очень важно, поскольку это помогает принимать решения о мерах предосторожности при изоляции, а также о том, стоит ли проводить еще один курс лечения COVID-19".
Дагдейл добавила, однако, что без секвенирования вирусного генома как первоначальной инфекции COVID-19, так и последующего положительного теста, клиницисты не могут с уверенностью сказать, является ли повторный тест реинфекцией. "В данной работе мы оценили способность врачей отличить реинфекцию COVID-19 от персистенции после предыдущего эпизода COVID-19, используя клинические заключения и маркер уровня обнаруженного вируса (т.е. пороговое значение цикла), по сравнению с секвенированием генома вируса", - рассказала она.
В ходе исследования все пациенты крупного медицинского центра, прошедшие тест на амплификацию нуклеиновой кислоты SARS-CoV-2 (NAAT) через 45 и более дней после первоначального положительного теста - причем оба теста были проведены в период с 14 марта по 30 декабря 2020 года - были проанализированы на предмет возможной реинфекции. Согласно исследованию, критерии включения включали наличие двух или более положительных NAAT, взятых с разницей в 45 или более дней, при этом значение порога цикла (Ct) при повторном тестировании было менее 35. Затем исследователи оценили вероятность реинфекции с помощью вирусного геномного анализа всех имеющихся образцов со значением Ct менее 35, структурированных критериев траектории Ct и рассмотрения каждого конкретного случая врачами-инфекционистами.
Среди 1569 пациентов с повторным тестированием на SARS-CoV-2 через 45 или более дней после первоначального положительного NAAT, 65 (4%) соответствовали критериям включения в когорту. Среди этих пациентов вирусные геномные анализы были успешно проведены у 14 (22%). Из них у шести была геномно подтверждена реинфекция, а у восьми - геномно подтверждено обнаружение персистирующей РНК. По полученным данным, клинические и лабораторные оценки правильно отличили реинфекцию от персистирующего обнаружения РНК у 12 (86%) человек, но пропустили две (33%) геномно поддерживаемые реинфекции по сравнению с вирусным геномным анализом.
"В целом, клиническая и циклическая оценка пороговых значений очень хорошо отличает реинфекцию COVID-19 от обнаружения персистирующего вируса от предыдущей инфекции", - отмечает Дагдейл. "Однако расширение масштабов геномного анализа для клинического использования улучшит выявление реинфекции COVID-19 с потенциальными последствиями для рекомендаций по изоляции и возможности получения лечения COVID-19".
