Геном Yersinia pestis возрастом 5000 лет (RV 2039) реконструирован из генома охотника-рыболова-собирателя (5300-5050 cal BP), захороненного в Рининюкалнсе, Латвия.
RV 2039 является первым в серии древних штаммов, которые развились вскоре после отделения Y. pestis от его предшественника Y. pseudotuberculosis ∼7 000 лет назад. Геномные и филогенетические характеристики RV 2039 соответствуют гипотезе о том, что эта очень ранняя форма Y. pestis, скорее всего, была менее трансмиссивной и, возможно, даже менее вирулентной, чем более поздние штаммы. Наши данные не подтверждают сценарий доисторической пандемии легочной чумы, как это предполагалось ранее для неолитического упадка. Географическое и временное распределение немногих доисторических случаев Y. pestis, о которых сообщалось до сих пор, больше соответствует единичным зоонозным событиям.
