ОРВИ являются одной из основных причин высокой заболеваемости и смертности во всем мире.
ОРВИ вызывают многие типы респираторных патогенов, включая вирус гриппа, респираторно-синцитиальный вирус, коронавирусы человека, риновирус, вирусы парагриппа человека. Новые патогены продолжают обнаруживаться и вызывать крупномасштабные эпидемии, поэтому обнаружение и эпиднадзор за респираторными патогенами не только позволяет своевременно ставить клинический диагноз и обеспечивает руководство для прецизионной медицины, но и позволяет всесторонне и систематически контролировать эпидемии и выявлять варианты респираторных патогенов, обеспечивая тем самым научную основу для раннего предупреждения, прогнозирования, профилактики и контроля респираторных инфекционных заболеваний.
Мазки из носа или горла являются доминирующими методами сбора образцов для выявления и мониторинга респираторных патогенов. Взятие таких мазков может вызывать сильную тошноту, рвоту и другие неприятные ощущения у пациентов. Сбор образцов должен осуществляться обученным медицинским персоналом, который должен носить средства индивидуальной защиты и подвергается риску заражения. Поэтому для выявления и мониторинга респираторных патогенов необходим альтернативный метод сбора биологических образцов, безопасный, удобный и эффективный.
Ротовая жидкость (РЖ) - это смесь секрета слюнных желез и десневого отделяемого, которая может быть использована для выявления вирусных нуклеиновых кислот, а также антител IgM и IgG. РЖ может быть собрана самостоятельно и поэтому выгодна с точки зрения безопасности, неинвазивности, удобства и эффективности. Во время пандемии COVID-19 несколько стран, таких как США, Англия и Япония, использовали образцы РЖ для выявления нуклеиновых кислот и антител к SARS-CoV-2.
В 2021 году Пекинский центр профилактики и контроля заболеваний использовал РЖ для анализа нуклеиновых кислот и антител к SARS-CoV-2 в Китае, тем самым продемонстрировав значительную ценность применения РЖ. Однако в Китае не проводилось соответствующих исследований образцов РЖ на другие респираторные патогены.
Используя систему надзора за респираторными патогенами в Пекине, мы отобрали образцы РЖ у больных ОРВИ и провели сравнение с парными мазками из горла, чтобы изучить эффективность обнаружения образцов РЖ. Данное исследование предоставляет ценную информацию для изучения возможности использования нового типа биологических образцов и улучшения профилактики и контроля важнейших инфекционных заболеваний дыхательных путей, таких как COVID-19 и грипп.
Методы:
С декабря 2020 года по декабрь 2021 года у пациентов с острыми инфекциями респираторного тракта в Пекине были собраны мазки из РЖ и горла. Была проведена мультиплексная ПЦР в реальном времени, и было проведено сравнение эффективности обнаружения двух образцов.
Результаты:
Всего было собрано 769 образцов РЖ и мазков из горла. Частота обнаружения респираторных патогенов в мазках из горла и РЖ составила 29,26% (225/769) и 20,81% (160/769) соответственно. Чувствительность и специфичность анализа РЖ по сравнению с анализом мазка из горла составили 71,11% (160/225) и 100% (544/544) соответственно. Оба анализа имели отличное соответствие (каппа = 0,78). Согласованность обнаружения варьировала между патогенами. В образцах РЖ наиболее распространенным возбудителем был вирус гриппа B, а самая высокая частота обнаружения была в группе ≤5 лет. Самый высокий уровень позитивности наблюдался в декабре 2021 года.
Выводы:
Образцы РЖ обладают отличным потенциалом для эпидемиологического надзора за респираторными патогенами и могут иметь перспективы применения в профилактике и борьбе с инфекционными заболеваниями.