В поиске источника пандемии COVID-19 появились новые зацепки.
Исследователи выявили полдюжины видов животных, которые могли передавать людям SARS-CoV-2, путем повторного анализа геномов, собранных на рынке животных в Ухане (Китай). Исследование установило присутствие животных и вируса на рынке, но не подтвердило, были ли сами животные заражены вирусом.
Многие из первых случаев заболевания COVID-19 были связаны с городским оптовым рынком Хуанань, поэтому он стал одним из основных мест в поисках истоков пандемии. Исследование, опубликованное на прошлой неделе в журнале Cell, является последним в серии анализов образцов с рынка. Исследователи утверждают, что их повторный анализ придает больше веса тому факту, что рынок был местом первого распространения вируса, когда животные, инфицированные вирусом, заразили людей, вызвав пандемию. Это исследование дополняет предварительный анализ данных Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний (China CDC), который та же группа опубликовала в марте 2023 года. Однако выводы авторов отличаются от первого рецензируемого анализа данных, опубликованного в журнале Nature в апреле прошлого года, в котором другая исследовательская группа также выявила несколько животных и вирус, но пришла к выводу, что роль рынка в возникновении пандемии пока неясна.
Поиски причин возникновения пандемии вызывают множество споров. Большинство исследователей считают, что вирус распространился от летучих мышей, которые заразили людей, скорее всего, через промежуточное животное, как это случалось с другими патогенами, появившимися у людей. Однако отсутствие убедительных доказательств существования промежуточного хозяина заставило некоторых исследователей утверждать, что вирус мог вырваться на свободу - преднамеренно или случайно - из Уханьского института вирусологии.
Геномные данные, использованные в анализах Cell, Nature и других изданий, были собраны исследователями Китайского CDC вскоре после того, как рынок был закрыт 1 января 2020 года. В течение нескольких недель сотрудники Китайского CDC многократно посещали рынок, чтобы взять мазки с прилавков, мусорных баков, туалетов, сточных вод, бродячих животных и брошенных замороженных продуктов животного происхождения. Образцы содержали множество ДНК и РНК из разных источников, которые исследователям предстояло упорядочить и изучить. «Это один из самых важных массивов данных о ранней стадии пандемии и о происхождении SARS-CoV-2», - говорит Флоранс Дебарре, эволюционный биолог из французского национального исследовательского агентства CNRS и соавтор статьи в Cell.
Когда в апреле прошлого года исследователи из Китайского CDC опубликовали результаты своего анализа в журнале Nature, они сообщили, что образцы, содержащие SARS-CoV-2, были получены от диких животных на рынке, в первую очередь енотовидных собак (Nyctereutes procyonoides), которые восприимчивы к SARS-CoV-2 и могут распространять вирус среди других животных. Но исследователи отметили, что нет возможности установить, были ли эти животные заражены SARS-CoV-2. Даже если они были инфицированы, они могли заразиться от человека, который принес вирус на рынок, что оставляет возможность того, что рынок не был местом возникновения пандемии.
В последнем исследовании использовались более сложные генетические методы для определения видов, представленных в образцах, включая несколько животных, которые, по мнению авторов, являются возможными промежуточными хозяевами SARS-CoV-2. К наиболее вероятным хозяевам относятся енотовидные собаки и пальмовая циветта (Paguma larvata), которые также могут быть восприимчивы к вирусу. Среди других возможных хозяев - бамбуковые крысы (Rhizomys pruinosus), амурский еж (Erinaceus amurensis) и малайский дикобраз (Hystrix brachyura), но пока неясно, могут ли эти животные заразиться SARS-CoV-2 и распространить инфекцию. По мнению специалистов, носителями вируса могут быть также сурок Ривза (Muntiacus reevesi) и гималайский сурок (Marmota himalayana), но вероятность этого меньше, чем у других видов.
По мнению Гиги Гронвалл, специалиста по биобезопасности из Университета Джона Хопкинса, совместное присутствие вирусного и животного генетического материала «убедительно свидетельствует» о том, что животные были заражены. «Я была поражена тем, как много там было животных», - говорит она. Летучие мыши, от которых, вероятно, произошел прародитель SARS-CoV-2, не были обнаружены в генетических данных. Отсутствие ДНК летучих мышей неудивительно, говорит Элис Хьюз, биолог по охране природы из Университета Гонконга, которая изучает летучих мышей и торговлю дикими животными. Хотя летучих мышей обычно едят в южном Китае, они не продаются на рынках этой страны.
Авторы исследования также утверждают, что вирусное разнообразие, присутствующее на рынке, позволяет предположить, что именно он был местом возникновения пандемии. В частности, по их словам, наличие двух линий SARS-CoV-2, известных как A и B, циркулировавших на рынке, говорит о том, что вирус дважды переходил от животных к людям. Исследователи заключают, что, хотя возможно, что инфицированные люди принесли вирус на рынок в двух отдельных случаях, это гораздо менее вероятный сценарий, чем двойной переход вируса от животных, тем более что, согласно их анализу, очень мало людей были инфицированы на тот момент, и маловероятно, что один человек занес обе линии. «Это действительно просто соответствует продолжающейся инфекции в популяциях животных, которая многократно переходила на людей», - утверждает Гронвалл.
Последнее исследование также предполагает, что енотовидные собаки с рынка в Хуанане, вероятно, были более близкими родственниками диких енотовидных собак, собранных на других рынках в той же провинции, и не столь близкими родственниками сельскохозяйственных животных, встречающихся в северных провинциях Китая, что позволяет предположить, что они могли происходить из центрального или южного Китая. Ближайшие известные родственники SARS-CoV-2 были выделены от летучих мышей в южном Китае, Лаосе и других странах Юго-Восточной Азии.
По мнению соавтора исследования Джошуа Леви, прикладного математика из Исследовательского института Скриппса, следующим шагом должно стать изучение диких животных. По его словам, в работе содержится полезная информация о том, как предотвратить распространение вируса в будущем: например, отследить владельцев торговых точек и проверить животных на наличие вирусов, близких к SARS-CoV-2, а также провести исследования восприимчивости диких млекопитающих, обнаруженных на рынке, к SARS-CoV-2, и выяснить, могут ли эти животные передавать вирус.
И конечно, полученные результаты свидетельствуют о том, что торговля дикими животными должна лучше регулироваться, чтобы свести к минимуму риск распространения патогенов.
