Персонализированное картирование метаболизма препаратов микробиомом кишечника человекаПерсонализированное картирование метаболизма препаратов микробиомом кишечника человека
Bahar Javdan et al.
Department of Molecular Biology, Princeton University, Princeton, NJ 08544, USA
Основные моменты:
- Разработка предметно-ориентированных культур ex vivo для микробиома кишечника.
- Обнаружение различных взаимодействий препарата и микроорганизмов с помощью МДМ-экрана
- МДМ-экран количественно определяет метаболизм препаратов персонализированными сообществами микроорганизмов кишечника
- Функциональные геномные и метагеномные экраны выявляют метаболизирующие ферменты
Резюме
Микробиом кишечника человека содержит сотни видов бактерий с разнообразными биохимическими возможностями. Доказано, что десятки лекарств метаболизируются единичными изолятами из микробиома кишечника, однако масштабы этого явления редко исследуются в контексте сообществ микроорганизмов. В данной работе мы разрабатываем количественные экспериментальные рамки для картирования способности микробиома кишечника человека метаболизировать низкомолекулярные лекарственные средства, а именно МДМ (микробиом-деривативный-экран).
В работе рассматриваются система пакетного культивирования для устойчивого роста предметно-специфических сообществ микроорганизмов кишечника, скрининг метаболизма лекарственных препаратов ex vivo, а также целевые и нецелевые функциональные метагеномные скрининги для выявления микробиомо-кодированных генов, ответственных за конкретные метаболические события. В нашей системе выявляются новые взаимодействия между препаратами и микробиомами, которые варьируются между отдельными людьми, и демонстрируется, как микробиом кишечника может быть использован в разработке лекарственных средств и в персонализированной медицине.
