Компания Parseq Lab (С.Петербург) сообщила о разработке первой отечественной тест-системы для секвенирования генома SARS-Cov-2. Тест-система разработана при содействии НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ.
Объем инвестиций в проект составил 12 млн рублей. С помощью системы секвенировано 700 геномов SARS-Cov-2.
Секвенирование генома дает возможность отслеживать изменения вирусного генома и оперативно реагировать на них, выявлять опасные мутации или отслеживать повторные заражения среди переболевших COVID-19.
Тест-система носит название VariFind SARS-Cov-2 assay, имеет более высокую точность в сравнении с наиболее часто используемым протоколом секвенирования генома – ARTIC Network, к тому же ее использование позволяет уйти от зависимости зарубежных реагентов. Производитель сообщает, что тест-система дает практически полное и равномерное покрытие всего генома вируса, позволяет в два раза увеличить количество одновременно анализируемых образцов и сокращает время одного исследования. Помимо этого, отечественные реагенты совместимы c наиболее популярными платформами для секвенирования.
Исследования геномов SARS-CoV-2 проводятся на базе созданного летом 2020 года Российского консорциума по секвенированию геномов коронавирусов. Данные собираются из 36 регионов России и добавляются в международную базу данных EpiCov GISAID.