Новости

Субвариант XBB.1.5 Омикрона (Kraken) эволюционировал и стал самым передаваемым субвариантом SARS-CoV-2, быстро вытесняя другие варианты, хотя, по мнению экспертов, его окончательное влияние на пандемию пока неясно.    На долю XBB.1.5 сейчас приходится почти 28% новых случаев заболевания COVID-19 в США, по сравнению с 4% всего 4 недели назад, согласно данным CDC. Белый дом и ВОЗ отметили, что этот субвариант удивил многих своей скоростью распространения. "Это самый трансмиссивный субвариант, который был обнаружен на сегодняшний день... и мы обеспокоены его превосходством в росте", - сказала на пресс-конференции на этой неделе Мария Ван Керкхове, технический руководитель по COVID-19 в ВОЗ, отметив, что субвариант был обнаружен в 29 странах.    На северо-востоке США на этот субвариант приходится более 71% новых случаев заражения, по данным Центра по контролю и профилактике заболеваний США. "Полученные данные свидетельствуют о том, что XBB.1.5 быстро распространяется, потому что ему удалось найти эволюционно благоприятную позицию, которая позволяет ему одновременно защищаться от иммунной системы и эффективно инфицировать наши клетки", - сообщил Джонатан З. Ли, доцент медицины в Гарвардской медицинской школе. "Набор мутаций в XBB.1.5 создает вариант, который, безусловно, является самым иммуноопасным вариантом, который мы видели".    XBB "является первым документированным примером того, как вариант SARS-CoV-2 повышает свою приспособленность за счет рекомбинации, а не одиночных мутаций", - говорится в препринте исследования, опубликованном в декабре. Он является рекомбинантом двух сублиний BA.2, BJ.1 и BM.1.1.1, и "содержит как замены, связанные с иммунным ускользанием, так и замены, повышающие инфекционность", присутствующие в двух субвариантах-предшественниках, сообщают авторы. По словам Ли, другое исследование, опубликованное в препринте 5 января, предполагает, что этот подвариант "нашел новую мутацию, которая позволяет ему восстановить свойства связывания ACE2, что, вероятно, позволяет ему более эффективно заражать и передавать инфекцию", добавив, что он "оказывается устойчивым" к эвушельду и бебтеловимабу, но не к противовирусным препаратам паксловиду, ремдезивиру и молнупиравиру.    "Он обладает свойствами иммунного ускользания, присущими другим новым субвариантам Омикрона - я иногда называю их "Scrabble variants" - но, кроме того, мутации в 486 аминокислотной позиции, похоже, подтверждают улучшенное взаимодействие с рецептором ACE2, и это может объяснять повышенную трансмиссивность", - отметил Питер Дж. Хотез, декан Национальной школы тропической медицины. (Scrabble - настольная игра, в которой от двух до четырёх играющих соревнуются в образовании слов с использованием буквенных деревянных плиток на доске, разбитой на 225 квадратов. В русскоязычной среде известна также под названиями «Эрудит» или «Словодел» - прим.пер.).    По данным CDC, наиболее распространенным циркулирующим субвариантом в настоящее время является BQ.1.1, составляющий примерно 34% новых случаев, за ним следует XBB.1.5 - 27,6%, BQ.1 - 21,4% и XBB - 4,9%. "Мы до конца не уверены, но важно отметить, что в то время как процент случаев, вызванных XBB.1.5, растет, общее число случаев COVID-19 увеличивается медленнее", - заявил Эндрю С. Пекош, заместитель декана кафедры молекулярной микробиологии и иммунологии Университета Джона Хопкинса. "Это может означать, что XBB.1.5 обладает повышенной способностью к распространению, но это не масштабное увеличение", - сказал он. "Если бы это было масштабное увеличение, мы бы увидели, что общее количество случаев возрастает гораздо более высокими темпами".    Керкхове считает, что пока нет никаких признаков того, что тяжесть заболевания, вызванного XBB.1.5, выше по сравнению с другими субвариантами. "Но мы очень внимательно следим за этим в ходе экспериментальных исследований в лабораториях [и] также в реальных условиях", - сказала она. Пекош говорит, что SARS-CoV-2 продолжает делать "то же самое, что и вирусы, подобные гриппу", набирая мутации, которые в конечном итоге позволяют новым вариантам доминировать, но коронавирус делает это гораздо чаще. Несмотря на это, он ожидает, что количество тяжелых форм заболеваний и смертей не будет увеличиваться с появлением нового подварианта.    "Группа XBB вариантов Омикрона имеет большое количество мутаций, которые делают его менее узнаваемым для иммунитета, вызванного вакцинацией или инфекцией", - сказал Пекош. "Однако бивалентные бустеры должны по-прежнему обеспечивать защиту от тяжелых заболеваний, хотя [они] не будут так хорошо останавливать инфекции. Она все еще [также] должна быть восприимчива к противовирусному препарату паксловид.

46-летний мужчина с муковисцидозом и трансплантацией легких за два года до этого поступил в стационар с болью в груди и кровохарканьем.     Недавно пациенту был поставлен диагноз COVID-19, а КТ грудной клетки выявила множественные округлые помутнения с центральной кавитацией. Поскольку визуализация не соответствовала легочной форме COVID-19 и не было выявлено явного риска развития туберкулеза, была проведена бронхоскопия с трансбронхиальной биопсией. Ткани и бронхиоальвеолярная лаважная жидкость были собраны и переданы в микробиологическую лабораторию для анализа.     Вирусная этиология, включая грипп A/B, парагрипп 1-3, аденовирус, RSV и метапневмовирус, была исключена с помощью молекулярных исследований. Галактоманнан в БАЛ был отрицательным, как и культуры грибов и микобактерий, а также ПЦР на Mycobacterium tuberculosis. Окрашивание биоптата по Грокотту было отрицательным, но отмечались организующаяся пневмония и мононуклеарный инфильтрат. У пациента в анамнезе была рецидивирующая инфекция Pseudomonas aeruginosa с множественной лекарственной резистентностью, и он получал эмпирическое лечение цефтазидимом/авибактамом. Лабораторная идентификация    Окраска по Граму тканей и БАЛ в целом была ничем не примечательна. Гистопатологический анализ трансбронхиальной ткани выявил изменения, свидетельствующие об организующейся пневмонии с мононуклеарным инфильтратом (изображение 2, слева). Бактериальный рост преобладающего микроорганизма как из БАЛ, так и из биопсийной ткани наблюдался через 48 часов на кровяном и шоколадном агарах, но отсутствовал на агаре МакКонки. Через 96 часов колонии микроорганизмов стали мукоидными, слегка розовыми и объединенными (изображение 1, справа). Окрашивание роста по Граму выявило короткие, плохо окрашивающиеся грамположительные коккобациллы, имеющие вид бисеринок. Из-за неполного окрашивания по Граму этого изолята была предпринята попытка модифицированного окрашивания, которая оказалась положительной (изображение 1, слева). Организм был как каталазо-, так и уреазоположительным. Впоследствии изолят был идентифицирован с помощью MALDI-TOF MS как Rhodococcus equi, и пациент был выписан, принимая имипенем и линезолид. Изображение 1. Слева - модифицированное окрашивание кислотоустойчивых бактерий, выявляющее мелкие коккобациллы (черные стрелки). Справа - характерные мукоидные колонии изолята лососевого цвета на кровяном агаре после 96 часов инкубации. Изображение 2. Слева - трансбронхиальная биопсия, выявляющая участки агрегации гистиоцитов и мононуклеарный инфильтрат (10-кратное увеличение). По центру - репрезентативное изображение разросшихся гистиоцитов с маленькими, бледно окрашенными круглыми формами на фоне нейтрофилов (увеличение 40X). Справа - репрезентативное изображение гистиоцитов, заполненных кокковидными и коккобациллярными формами (увеличение 40X). Обсуждение    Rhodococcus equi является зоонозным патогеном, который в первую очередь вызывает инфекции среди иммунокомпрометированных хозяев. Нечасто выделяемый клинически, этот микроорганизм является частым патогеном у лошадей, вызывая пневмонию с образованием абсцессов, часто с распространением на периферические участки из-за высокой нагрузки на организм. Организм выделяется с фекалиями инфицированных животных, что приводит к загрязнению почвы на фермах и других сельскохозяйственных угодьях, где организм либо аэрозолируется и вдыхается, либо приобретается путем прямой инокуляции.    Хотя заражение человека классически связывают с контактом с лошадьми или окружающей средой, растет количество литературных данных, свидетельствующих о том, что многие пациенты с микробиологически доказанными случаями инфекции R. equi не подвергались такому воздействию окружающей среды. Этот пациент относится к последней категории, у него не было контакта с домашним скотом.    R. equi является представителем аэробных актиномицетов. Как и у Nocardia sp., клеточная стенка R. equi содержит миколовые кислоты, которые приводят к положительной реакции при окрашивании модифицированным кислотоустойчивым красителем. Организм является факультативным, внутриклеточным патогеном, живущим в макрофагах и гистиоцитах, что приводит к гранулематозному воспалению и в конечном итоге к некрозу.    Иммуносупрессия (включая ВИЧ-инфекцию или иммуносупрессивную терапию) является основным фактором риска заражения R. equi, поскольку большинство клинических случаев зарегистрировано именно в этих условиях. У иммунокомпрометированных хозяев спектр проявлений R. equi разнообразен, но чаще всего (около 80%) включает поражение легких с полостной пневмонией верхней доли. С инфекцией R. equi может быть связана характерная малакоплакия (инфильтрация пенистых гистоцитов с внутриклеточными бактериями и базофильными включениями, называемыми тельцами Михаэлиса-Гутмана). В случае данного пациента эти структуры отсутствовали, несмотря на наблюдаемую агрегацию гистоцитов и мононуклеарный инфильтрат (изображение 2, центр, слева).    R. equi пневмония среди реципиентов трансплантатов солидных органов, как у пациента в данном случае, ассоциируется с низкой общей заболеваемостью и летальностью, но требует длительных режимов антибиотикотерапии. Тестирование на чувствительность оправдано для руководства терапией R. equi из-за непредсказуемых моделей резистентности среди изолятов. Изолят этого пациента оказался чувствительным к амоксициллину/клавуланату, цефтриаксону, имипенему, ципрофлоксацину, моксифлоксацину, кларитромицину, амикацину, тобрамицину, миноциклину, триметоприму/сульфаметоксазолу, ванкомицину, линезолиду и рифампину. Пациент был выписан, принимая имипенем/линезолид. Во время последующего наблюдения клиническое состояние пациента улучшилось, симптомы прошли, но рентгенологические отклонения сохранились, поэтому он продолжал получать пероральную терапию моксифлоксацином и миноциклином.