Китайские исследователи обнародовали геномные данные, которые могут помочь выяснить происхождение пандемии COVID-19Китайские исследователи обнародовали геномные данные, которые могут помочь выяснить происхождение пандемии COVID-19
Под сильным давлением и критикой со стороны многих представителей научного сообщества китайские исследователи обнародовали ряд новых генетических данных, которые могут дать новые ключи к разгадке происхождения пандемии COVID-19.
Они также существенно пересмотрели соответствующее исследование, впервые опубликованное в Интернете 13 месяцев назад, чтобы включить в него эти данные, которые, по мнению некоторых ученых, придают больше убедительности утверждению о том, что SARS-CoV-2 мог попасть к людям от енотовидных собак или других млекопитающих, незаконно продававшихся на рынке в Ухане.
В первоначальном препринте китайских ученых утверждалось, что данные по рынку, состоящие из генетических последовательностей, найденных в 923 образцах, собранных на рынке или рядом с ним в начале 2020 года, "с большой долей вероятности" свидетельствуют о том, что коронавирус был занесен туда людьми, и не упоминалось о доказательствах, свидетельствующих о наличии восприимчивых к SARS-CoV-2 млекопитающих. В обновленном препринте признаются генетические данные животных, но теперь говорится, что собранные образцы не позволяют решить, кто занес вирус - инфицированные животные или люди, или даже зараженная пища - на рынок, где появились первые случаи заболевания COVID-19.
"Я рада, что данные были обновлены и доступны на различных платформах, и что [исследователи] разместили свою обновленную публикацию на сервере препринтов", - говорит Мария Ван Керкхове, эпидемиолог ВОЗ, которая на прошлой неделе призвала китайскую группу поделиться данными о рынке после того, как другая исследовательская группа наткнулась на некоторые из этих данных. "Я повторяю, что любые и все данные, связанные с происхождением SARS-CoV-2, должны быть доступны немедленно".
Препринт, написанный исследователями, в основном аффилированными с Китайским центром по контролю и профилактике заболеваний (CCDC), посвящен "образцам окружающей среды" - из стоков, контейнеров, столов, дверей, земли - которые авторы взяли на оптовом рынке морепродуктов Хуанань в январе - марте 2020 года. После того, как в декабре 2019 года там начали появляться случаи заболевания COVID-19, рынок был быстро закрыт китайскими властями 1 января 2020 года. Первоначально исследователи CCDC, включая соавтора препринта Джорджа Гао (который в то время возглавлял агентство), заявили, что они подозревают, что вспышку спровоцировали животные на рынке. Но позже они отрицали, что на рынке продавались нелегальные млекопитающие, утверждая, что вирус туда попал с импортной рыбой или от людей из других стран.
Препринт CCDC был опубликован в феврале 2022 года на сайте Research Square, входящим в семейство журналов Nature. В нем не обсуждались никакие сиквенсы диких животных, найденных на рынке, и делался вывод о том, что "не может быть установлен животный носитель вируса SARS-CoV-2". За пределами Китая возникли вопросы вокруг еще одной возможности: вирус был принесен на рынок инфицированным человеком из расположенного неподалеку Уханьского института вирусологии, который давно занимается изучением коронавирусов, обнаруженных у летучих мышей.
Теперь Гао и его соавторы сделали гораздо больше своих данных доступными в базах данных, включая GISAID, которую многие исследователи используют для обмена генетическими последовательностями SARS-CoV-2. В своем пересмотренном препринте, который они разместили 29 марта на сервере ChinaXiv, они отмечают, что "образцы окружающей среды показали обилие различных родов позвоночных". В некоторых из этих же образцов были обнаружены следы SARS-CoV-2. Однако "эти образцы окружающей среды не могут служить доказательством инфицирования животных", - предупреждают Гао и соавторы. "Кроме того, даже если животные были инфицированы, все равно нельзя исключить, что произошла передача вируса от человека к животному, учитывая, что время отбора проб было не менее чем через месяц после передачи вируса от человека к человеку на рынке. Таким образом, пока нельзя исключать возможность потенциального заноса вируса на рынок человеком или продуктами холодовой цепи", - заключают они.
Грег Такер-Келлогг, системный биолог из Национального университета Сингапура, который считает, что пандемию вызвали зараженные животные, говорит, что пересмотренный препринт ясно показывает, что китайские власти, настаивавшие на том, что на рынке не продаются дикие животные, "не всегда были честными", и что не было "никаких даже отдаленно адекватных усилий, о которых мы знаем", чтобы отследить этих диких животных до их источников. Даже с учетом этого обновления, добавляет он, "остается еще много важных данных, которых у нас сейчас нет".
Генетические последовательности с уханьского рынка стали объектом необычного внимания. Флоранс Дебарр, эволюционный биолог из французского национального исследовательского агентства CNRS, была удивлена, обнаружив 3 недели назад часть этих данных при прочесывании GISAID. Когда она в сотрудничестве с группой ученых из других регионов Китая проанализировала эти последовательности, они нашли доказательства того, что на рынке были млекопитающие, и передали их в ВОЗ. Впервые об этой находке стало известно 16 марта в статье в Atlantic под названием "Самое убедительное доказательство того, что животное начало пандемию".
Объяснив, что они не хотели срывать журнальную публикацию китайских исследователей, Дебарр и ее коллеги 20 марта разместили в Интернете отчет, в котором проанализировали данные, но не привели их сиквенсы. В GISAID возникла небольшая заминка, которая временно приостановила доступ, утверждая, что команда нарушила условия доступа к базе данных. Однако GISAID восстановил доступ, когда группа предоставила доказательства того, что предлагала сотрудничество с китайскими исследователями.
По мнению нескольких соавторов Дебарр, новые данные просто подкрепляют еще более убедительные доказательства рыночного происхождения, которые они опубликовали в статье в журнале Science от 26 июля 2022 года. Но Джоэл Вертхайм, эволюционный биолог из Калифорнийского университета, который был соавтором доклада от 20 марта вместе с Дебарр, говорит, что он "в восторге" от того, что данные теперь доступны общественности. "Эти данные исключительно ценны для дальнейшего понимания происхождения пандемии COVID-19", - считает Вертхайм. Лучше поздно, чем никогда".
Но он по-прежнему "озадачен" тем, как китайские авторы не видят, что их данные подтверждают животное происхождение. Майкл Воробей, эволюционный биолог, который также является соавтором анализа, предполагает, что можно найти фермы, на которых выращивались животные, продававшиеся на рынке 3 года назад, и все еще найти там доказательства SARS-CoV-2 - "возможно, даже раскопать ямы, где, как я подозреваю, было захоронено много животных в начале 2020 года, когда фермы были быстро ликвидированы", - написал он в твиттере.
Мариетджи Вентер, вирусолог из Университета Претории, возглавляющая Научно-консультативную группу ВОЗ по происхождению новых патогенов (SAGO), согласна с тем, что новые данные открывают важные возможности для изучения. "SAGO призывает Китайский центр по контролю заболеваний исследовать источник происхождения этих животных на рынках и у продавцов, которые присутствовали в то время", - написала Вентер.
Китайские исследователи завершают свой пересмотренный препринт так же, как и оригинал: "Определенно, для изучения потенциального происхождения SARS-CoV-2 необходима дополнительная работа с привлечением международной координации".
