Новости

Наличие коронавируса 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2) в мокроте и слюне было недавно доказано, что позволяет предположить, что выделение вирусной РНК длится до окончания симптомов.    Последние данные транскриптомного анализа показывают, что слизистая оболочка полости рта содержит высокие уровни ангиотензин-конвертирующего фермента 2 (ACE2) и трансмембранной протеазы, серин 2 (TMPRSS2), что подчеркивает ее роль как обоюдоострого меча для входа SARS-CoV-2 в организм или межличностной передачи. В данном исследовании мы изучили структуру микробиоты полости рта и воспалительный профиль 26 пациентов с тяжелой формой COVID-19 и 15 контрольных пациентов с помощью автоматического направленного секвенирования 16S рРНК V2 и мультиплексного иммуноанализа, соответственно.    У пациентов с COVID-19 наблюдалось значительное снижение видового разнообразия, наряду с заметным различием в бета-разнообразии. Такие виды, как Prevotella salivae и Veillonella infantium, были характерны для пациентов с COVID-19, в то время как Neisseria perflava и Rothia mucilaginosa преобладали в контроле. Интересно, что эти две группы оральных видов противоположно кластеризовались в бактериальной сети, определяя две различные группы взаимодействия видов (SIGs). Связанные с COVID-19 провоспалительные цитокины были обнаружены как в образцах ротовой полости, так и в сыворотке крови, наряду со специфическим бактериальным консорциумом, способным противостоять им. Мы ввели новый параметр, названный CytoCOV, способный предсказать восприимчивость к COVID-19 для выбранного субъекта при 71% достоверности с площадью под кривой (AUC), равной 0,995.    Это пилотное исследование показало отличительный состав микробиоты полости рта у лиц с COVID-19, с определенной структурной сетью в связи с секретируемыми цитокинами. Наши результаты могут быть использованы в клиниках для борьбы с COVID-19, используя бактериальные консорциумы в качестве биомаркеров или для уменьшения местного воспаления.

Бетон является самым используемым строительным материалом в мире и биологически экстремальной средой, микробиом которой состоит из бактерий, которые, вероятно, происходят из материалов-предшественников бетона, аэрозолей и осадков окружающей среды.    Эти микроорганизмы, хотя они и попадают из различных материалов, подвергаются высыханию, нагреванию, голоданию, высокой солености и очень высокому pH. Микроорганизмы, которые выживают и даже процветают в этих условиях, потенциально могут либо разрушать бетон, либо способствовать его восстановлению.    Микробам внутри бетона, из которого построены здания или дороги, уделяется мало внимания, несмотря на их повсеместное распространение и способность взаимодействовать с бетоном. Поскольку бетон представляет собой композитный материал, имеющий свои собственные микробные сообщества, мы предположили, что микробные сообщества бетона отражают сообщества компонентов бетона и что эти сообщества изменяются по мере старения бетона.    В данной работе мы использовали исследование 16S-ампликонов, чтобы показать, как микробные сообщества изменяются в течение 2 лет выветривания на открытом воздухе в двух комплектах бетонных цилиндров, один из которых подвержен разрушающей бетон щелочно-кремнеземистой реакции (ASR), а в другом риск ASR снижен. После идентификации и удаления таксонов, которые, вероятно, были лабораторными или реагентными контаминантами, мы обнаружили, что исходные материалы, особенно крупный заполнитель (гравий), были вероятным источником от ∼50 до 60% бактерий, наблюдаемых в первых цилиндрах из каждого комплекта.    В целом, разнообразие сообществ уменьшалось в течение 2 лет, с временным увеличением разнообразия в более теплые летние месяцы. Мы обнаружили, что большая часть микробиома бетона состояла из Proteobacteria, Firmicutes и Actinobacteria, хотя состав сообщества менялся сезонно и в течение нескольких лет, и на него, вероятно, влияли экологические осадки. Хотя в целом состав сообществ двух комплектов существенно не отличался, несколько таксонов, включая Arcobacter, Modestobacter, Salinicoccus, Rheinheimera, Lawsonella и Bryobacter, оказались ассоциированными с ASR.    Таким образом, понимание того, какие микроорганизмы выживают в бетоне, в каких условиях и как долго, имеет потенциальные последствия для биовосстановления бетона. Кроме того, методологические схемы анализа микробных сообществ бетона могут быть применены к бетону различных конструкций или с различными типами повреждений для выявления видов биоиндикаторов, которые могут быть использованы для мониторинга состояния конструкций и прогнозирования срока службы.