microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Международные новости
Успешные испытания по использованию комаров против лихорадки денге
#лихорадка денге #wolbachia
Распространенный микроб может помешать насекомым распространять вирус, вызывающий лихорадку денге.    Первый из двух приступов лихорадки денге случился у Ади Утарини в 1986 году, когда она еще была студенткой медицинского института. В течение нескольких часов у нее поднялась температура до 104 градусов по Фаренгейту, и она не могла встать, потому что у нее сильно дрожали колени. Через несколько дней она попала в больницу. Такой опыт - обычное дело в родном городе Утарини - Джокьякарте {не путать с Джакартой}, Индонезия: здесь один из самых высоких уровней заболеваемости денге в стране, которая сама имеет один из самых высоких уровней заболеваемости денге в мире.    "Здесь, когда спрашиваешь людей, знают ли они кого-то, кто болел денге, они всегда могут кого-то назвать", - говорит Утарини, которая сейчас является профессором общественного здравоохранения в Университете Гаджах Мада. Благодаря ее работе ситуация может скоро измениться.    Лихорадка денге вызывается вирусом, который ежегодно заражает примерно 390 миллионов человек и убивает около 25 000; ВОЗ назвала ее одной из 10 главных угроз глобальному здравоохранению. Она распространяется через укусы комаров, в особенности вида Aedes aegypti. Утарини и ее коллеги потратили последние десять лет на то, чтобы превратить этих насекомых из магистралей распространения денге в тупики.     Они заразили комаров бактериями Wolbachia, которая предотвращает их инфицирование вирусом денге. Вольбахия распространяется очень быстро: если выпустить в окрестностях небольшое количество комаров-носителей, то через несколько месяцев почти все местные насекомые будут свободны от денге. Это похоже на то, как если бы сотрудники Утарини сделали прививку от болезни нескольким людям, и вскоре после этого все население получило бы коллективный иммунитет.    Всемирная программа борьбы с комарами (WMP), некоммерческая организация, которая стала первопроходцем в этой области, провела небольшие пилотные исследования в Австралии, которые показали, что она может работать. Утарини, которая является одним из руководителей WMP в Джокьякарте, теперь убедительно доказала, что это действительно так. Ее команда выпустила комаров-носителей Wolbachia в некоторых районах Джокьякарты в рамках рандомизированного контролируемого исследования. Результаты, которые были представлены в прошлом году и теперь опубликованы, показали, что Wolbachia быстро распространилась среди местных комаров и снизила заболеваемость денге на 77%. "Это представляет собой доказательство того, что Wolbachia является высокоэффективным средством против денге", - говорит Оливер Брэди, эксперт по денге в Лондонской школе гигиены и тропической медицины. "Метод способен произвести революцию в борьбе с комарами".    Результаты испытаний оказались настолько обнадеживающими, что исследователи выпустили комаров-переносчиков вольбахий во всей центральной части Джокьякарты - зоне площадью 32 квадратных километра, где проживает более 400 000 человек. В настоящее время они расширяют свою деятельность в наиболее густонаселенных близлежащих провинциях, стремясь защитить 4 миллиона человек к концу 2022 года. Если им это удастся, то они смогут предотвращать более 10 000 случаев заражения денге ежегодно, заявила Кэтрин Андерс из WMP. И эта группа настолько оптимистична, что осмеливается думать о еще более грандиозной цели: полностью искоренить денге в городе.    "Денге - особенно сложный вирус, - говорит Натали Дин, статистик из Университета Флориды. Он существует в четырех различных вариантах, или "серотипах". Люди, выздоровевшие от одного серотипа, все равно могут быть инфицированы тремя другими; если это произойдет, у них, скорее всего, разовьются тяжелые и потенциально смертельные симптомы. По этой причине единственная существующая вакцина против денге также сохраняет риск развития тяжелой формы денге у людей, которые никогда не были инфицированы, и рекомендуется только для людей, которые уже сталкивались с этим заболеванием.    Когда-то комар Aedes aegypti был лесным насекомым, обитавшим в Африке к югу от Сахары, где он пил кровь у самых разных животных. Но в какой-то момент одна линия эволюционировала в городской подвид, предпочитающее города лесам, а людей - другим животным. Перевезенный по всему миру на борту невольничьих кораблей, Aedes aegypti процветал. Сейчас это, пожалуй, самый эффективный охотник на людей на планете, его органы чувств остро реагируют на углекислый газ в нашем дыхании, тепло наших тел и запахи нашей кожи. Вирусы, которые он переносит, также процветают, включая вирусы, вызывающие зика, чикунгунью, желтую лихорадку и денге. (Малярия, самая смертоносная болезнь, переносимая комарами, вызывается паразитом, который распространяется другим видом комаров). "Денге - одно из немногих инфекционных заболеваний, число которых увеличивается из года в год на протяжении последних нескольких десятилетий, - говорит Брэди. Aedes aegypti можно травить инсектицидами, но к ним быстро вырабатывается устойчивость. Стоячую воду, в которой они размножаются, можно удалить, но комары всегда возвращаются. Миру нужны новые средства борьбы".    Впервые вольбахия была обнаружена в 1924 году у другого вида комаров. Сначала она казалась настолько непримечательной, что ученые игнорировали ее в течение десятилетий. Но начиная с 1980-х годов, они поняли, что она обладает необыкновенной способностью к распространению. Он передается в основном от самок насекомых к их потомству и использует множество уловок для того, чтобы инфицированные особи размножались лучше, чем неинфицированные. На сегодняшний день она присутствует в по меньшей мере в 40 % всех видов насекомых, что делает ее одним из самых успешных микробов на планете. Электронная микрофотография вольбахии в клетке насекомого (Источник: Википедия).    Скотт О'Нил, основатель WMP, потратил десятилетия, пытаясь заставить вольбахий стабильно инфицировать Aedes aegypti, и в 2006 году его команде это наконец удалось. Пять лет спустя они выпустили 300 000 своих специальных москитов в двух пригородах Кэрнса, Австралия. В течение четырех месяцев от 80 до 90% местных москитов были заражены Wolbachia. Случаи заболевания денге снизились, но трудно сказать, было ли это связано с комарами или с каким-то другим фактором. Чтобы доказать, что Wolbachia действительно может повлиять на заболеваемость денге, команде необходимо было провести рандомизированное контролируемое исследование. Это было сделано в Джокьякарте.    Индонезийское отделение WMP потратило годы на завоевание доверия общественности. Подход Wolbachia является неортодоксальным и предполагает выпуск живых комаров во дворы людей. Помимо организации встреч с населением и горячих линий WhatsApp, "мы открыли нашу энтомологическую лабораторию, чтобы люди могли сами увидеть технологию", - рассказала Утарини. К тому времени, когда исследователи начали испытания в 2017 году, их опросы показали, что начинание поддержали 88% населения. Специалисты разделили большую часть города на 24 зоны и выпустили зараженных вольбахией комаров в половине из них. Почти 10 000 добровольцев помогали распространять контейнеры с яйцами по дворам. В течение года около 95% комаров Aedes в 12 зонах, где проводился выпуск, были инфицированы вольбахией.    Начиная с января 2018 года, специалисты проверяли людей в городе, которые обращались в клиники первичной медико-санитарной помощи с температурой, и проверяли их на денге. Так продолжалось до марта 2020 года, когда пандемия привела к преждевременному завершению исследования, но, к счастью, не раньше, чем в нем набралось достаточное количество участников. Команда обнаружила, что только 2,3% лихорадящих людей, проживавших в зонах, где была выпущена Wolbachia, заболели денге, по сравнению с 9,4% в контрольных зонах. Вольбахия также, по-видимому, действовала против всех четырех серотипов денге и сократила число госпитализаций по поводу денге на 86%.    Даже в этом случае эти и без того поразительные цифры, скорее всего занижены. Комары перемещались, перенося Wolbachia в 12 контрольных зон, где их не выпускали. Люди тоже перемещаются: они могут жить в зоне выпуска вольбахии, но быть укушенными и зараженными денге в другом месте. Оба этих фактора могли бы сработать против испытания, ослабив его результаты. То, что эти результаты существуют, не говоря уже о том, что они настолько впечатляющи, вызывает удивление.  "У нас нет убедительных доказательств того, насколько эффективны большинство мероприятий по борьбе с [денге]", - говорит Гонсало Васкес-Прокопек из Университета Эмори, изучающий трансмиссивные заболевания. "Когда вы видите грузовики, распыляющие инсектициды, мы не знаем, сколько случаев заболевания денге это предотвращает".    У метода Wolbachia есть несколько ограничений. Бактерии требуются месяцы, чтобы закрепиться, поэтому ее нельзя "использовать для сдерживания вспышки сегодня", - пояснил Васкес-Прокопек. Как показали испытания в Джокьякарте, этот метод работает только тогда, когда распространенность Wolbachia достигает не менее 80%, что требует большой работы и активной общественной поддержки. А вирусы денге со временем могут выработать какой-то способ противостоять Wolbachia. Тем не менее, Wolbachia, похоже, блокирует инфекции денге различными способами. Она конкурирует с вирусами за питательные вещества, необходимые им для размножения, а также укрепляет иммунную систему комара. Это должно затруднить вирусам преодоление блокирующих факторов вольбахии.    У этого метода есть и другие преимущества. Он самораспространяющийся и самоподдерживающийся: если изначально выпустить достаточное количество инфицированных вольбахией комаров, то бактерия естественным образом станет доминировать в местной популяции и останется таковой. В отличие от инсектицидов, Wolbachia не токсична, она не убивает полезных насекомых (или даже комаров), и ее не нужно применять повторно, что делает ее очень экономически эффективной. Анализ, проведенный группой Брэди, показал, что он фактически экономит деньги благодаря предотвращению инфекций.    "Нет причин думать, что преимущества для общественного здравоохранения, которые мы наблюдаем в Джокьякарте, не будут достигнуты в других местах", - сказал Андерс. "Это доказано".     В настоящее время WMP работает в 11 странах и территориях. На сегодняшний день под защитным покровом вольбахий живут 7 миллионов человек, и цель организации - охватить не менее 75 миллионов к 2025 году и не менее полумиллиарда к 2030 году. Эти люди будут защищены не только от денге. Вольбахия, похоже, работает и против других заболеваний, которые переносит Aedes aegypti, включая вирусы Зика и желтую лихорадку.     Это может превратить комара из одного из самых опасных для человека видов в обычную кусачую неприятность.
Новая методика мониторинга эпидемии
#covid-19 #sars-cov-2 #математическое моделирование #рт-пцр #эпидемиологический мониторинг
Новый метод мониторинга эпидемий, подобных COVID-19, дает точную оценку темпов роста эпидемии в режиме реального времени, тщательно оценивая взаимосвязь между количеством вирусов в организме инфицированных людей (вирусной нагрузкой), и тем, насколько быстро растет или снижается число случаев заболевания.    "Этот новый метод, который эффективно связывает то, что мы знаем о том, как вирус размножается в организме, с динамикой распространения вируса среди населения, обеспечивает совершенно новый подход, который чиновники общественного здравоохранения, политики и эпидемиологи смогут использовать для получения актуальной информации об эпидемии в режиме реального времени", - говорит Майкл Мина, доцент кафедры эпидемиологии Гарвардской школы общественного здравоохранения и один из основных сотрудников Центра динамики инфекционных заболеваний.    Мина - старший автор статьи, описывающей этот метод и опубликованной 3 июня 2021 года в Science.   Мониторинг эпидемий необходим для реагирования общественного здравоохранения, чтобы понять, насколько эффективно работают такие меры, как маски, изоляция или вакцины, и знать, куда распределять дополнительные ресурсы в случае роста заболеваемости.    Современные подходы к мониторингу эпидемий почти полностью основаны на отслеживании количества случаев заболевания или уровня госпитализации в течение определенного времени, а также на изучении показателей положительных результатов тестов и смертности. Например, на протяжении пандемии COVID-19 ежедневные данные о случаях заболевания, подобные тем, что публикует New York Times, были крайне важны для чиновников общественного здравоохранения и исследователей, чтобы оценить, насколько хорошо штаты и округи контролируют распространение SARS-CoV-2. Тем не менее, эти данные часто могут иметь лишь ограниченное применение из-за нестабильной практики тестирования или плохой отчетности.    Например, растущая эпидемия может выглядеть так, будто она идет на спад, если возможности тестирования максимально исчерпаны или если отчетность задерживается из-за того, что ресурсы сосредоточены в другом месте. Эти "подводные камни" мониторинга сообщений о случаях заболевания во времени могут негативно повлиять на надлежащие ответные меры общественного здравоохранения.    Поскольку вспышки растут или снижаются экспоненциально, при росте числа случаев заболевания большинство людей, которые были недавно инфицированы имеют более высокую вирусную нагрузку- по данным тестов ПЦР на момент тестирования. Это связано с тем, что вирус находится в организме в максимальном количестве в самом начале после инфицирования, а затем снижается до очень низкого, но все еще обнаруживаемого в тестах ПЦР уровня в течение нескольких недель или даже месяцев после инфицирования. Когда вспышка замедляется и количество случаев снижается, среднестатистический человек, имеющий положительный результат при контрольном тестировании, был инфицирован потенциально за несколько недель до тестирования и, следовательно, имеет более низкую вирусную нагрузку на момент постановки теста.    Чтобы лучше отслеживать очаги пандемии, исследователи разработали математический метод, который тщательно оценивает взаимосвязь между вирусной нагрузкой - измеряемой по результатам ПЦР-теста величиной, называемой порогом цикла (Ct value) - и тем, насколько быстро увеличивается или уменьшается количество случаев заболевания. Использование даже относительно небольшого количества из 30 положительных образцов SARS-CoV-2, взятых при контрольном тестировании за один день, может дать точную оценку темпов роста эпидемии в режиме реального времени. В случае наличия значений Ct из нескольких временных точек, исследователи обнаружили, что они могут использовать даже очень ограниченное количество положительных результатов для реконструкции кривой эпидемии и оценки того, сколько людей было инфицировано с течением времени. Значения уровня вируса в положительных образцах ПЦР-теста, собранных в одном месте в один момент времени, могут помочь оценить темпы роста или затухания вспышки в популяции, обнаружили исследователи.    В США и во многих других странах мира значения Ct ПЦР - значения, которые показывают, сколько вируса содержится в мазке из носоглотки человека - часто отбрасываются, а результаты ПЦР-теста выдаются с простым "положительным" или "отрицательным" результатом. "Наша работа демонстрирует, насколько ценны значения Ct и почему мы должны не только отказаться от нынешней практики их отбрасывания, но и сделать их ключевыми данными для сбора в рамках ответных мер на пандемию", - отметил Мина, который ранее опубликовал информацию об использовании значений Ct ПЦР для принятия клинических решений и был лидером в разработке новых подходов к использованию тестов на COVID-19 для ограничения распространения эпидемии.    Джеймс Хэй, который руководил исследованием в лаборатории Мины, подчеркнул, что новая методика не является специфической только для COVID-19, а представляет собой метод, который будет ценен для мониторинга вспышек и эпидемий других вирусов в будущем. "Этот инструмент предназначен не только для COVID, он скорее обеспечивает новый подход к оценке эпидемических траекторий многих типов вирусов, и этот метод не опирается на потенциально необъективные подходы, такие как подсчет случаев во времени, он также не будет зависеть от сообщений о случаях заболевания или госпитализации", - отметил он. James A. Hay et al. Оценка эпидемиологической динамики на основе кросс-секционных распределений вирусной нагрузки (аннотация).   Оценка траектории развития эпидемии имеет решающее значение для разработки ответных мер общественного здравоохранения на инфекционные заболевания, однако данные о случаях, используемые для такой оценки, искажаются из-за переменчивой практики тестирования. В данном исследовании мы показали, что популяционное распределение вирусной нагрузки, наблюдаемое при рандомизированном или симптомном мониторинге, в виде значений порога цикла (Ct), полученных в результате тестирования количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией, меняется во время эпидемии.    Так, значения Ct даже из ограниченного числа случайных выборок могут дать улучшенную оценку траектории развития эпидемии. Объединение данных из нескольких таких выборок повышает точность и надежность такой оценки. Мы применили наши методы к значениям Ct, полученным в ходе эпиднадзора, проводившегося во время пандемии SARS-CoV-2 в различных условиях, и предложили альтернативные подходы для оценки траектории эпидемии в режиме реального времени для управления вспышками и реагирования на них.
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up