Новости

   Вирус SARS-CoV-2 инициирует свою инфекцию в организме человека через взаимодействие своего белка шипа (S) с ангиотензин-преобразующим ферментом 2 (ACE2) клеток хозяина. Поэтому понимание фундаментальных механизмов связывания домена связывания белковых рецепторов SARS-CoV-2 S (RBD) с ACE2 очень востребовано при разработке методов лечения КОВИД-19.    Здесь были реализованы многоуровневые вычислительные подходы к изучению механизмов связывания белков человека ACE2 и S как SARS-CoV, так и SARS-CoV-2. Рассчитаны и детально сопоставлены электростатические характеристики, в том числе электростатический потенциал, линии электрического поля и электростатические силы SARS-CoV и SARS-CoV-2.     Результаты показали, что белки SARS-CoV и SARS-CoV-2 S привлекаются к ACE2 электростатическими силами на разных расстояниях. Однако детали, вносящие вклад в электростатические свойства, совершенно различны из-за различий между белком SARS-CoV S и белком SARS-CoV-2 S. Эти различия анализировались комплексно. По сравнению с SARS-CoV, SARS-CoV-2 связывается с ACE2, используя более надежную стратегию: линии электрического поля, распределены совершенно по-разному, что приводит к более надежному связыванию белка SARS-CoV-2. Кроме того, SARS-CoV-2 имеет более высокую плотность линий электрического поля, чем SARS-CoV, что указывает на более сильное взаимодействие между SARS-CoV-2 и ACE2, по сравнению с SARS-CoV.

Сезонные коронавирусы (OC43, 229E, NL63 и HKU1) являются эндемическими для человеческой популяции, регулярно инфицируя и реинфицируя человека, при этом обычно бессимптомно вызывая легкие респираторные инфекции.    Неизвестно, в какой степени реинфекция этими вирусами вызвана ослаблением иммунной памяти или антигенным дрейфом вирусов. Здесь мы рассматриваем влияние антигенного дрейфа на иммунное уклонение от сезонных коронавирусов. Мы приводим доказательства того, что, по крайней мере, два из этих вирусов, OC43 и 229E, проходят адаптивную эволюцию в областях белков вирусного шипа, которые находятся под воздействием гуморального иммунитета человека.    Это говорит о том, что реинфекция может быть частично вызвана положительно отобранными генетическими изменениями этих вирусов, которые позволяют им избежать распознавания иммунной системой. Не исключено, что, как и в случае сезонного гриппа, эти адаптивные изменения в антигенных областях вируса потребуют постоянного переформулирования вакцины, сделанной против них.