Новости

Kenneth P. Smith et al. Beth Israel Deaconess Medical Center, Department of Pathology; Harvard Medical School, Boston MA АннотацияИспользование искусственного интеллекта (ИИ) для интерпретации данных стало частью нашей повседневной жизни, и эти алгоритмы ИИ становятся частью нашей повседневной лабораторной практики. Многие инструменты ИИ начинают демонстрировать свою реальную или потенциальную полезность в лабораторной практике клинической микробиологии. В этом введении в применение ИИ в диагностическом тестировании клинической микробиологии, авторы знакомят с ИИ и машинным обучением тех, кто знаком с повседневной практикой клинической микробиологии. Обсуждается роль ИИ для анализа изображений, включая окраску по Граму, исследование яйцеклеток и паразитов, а также цифровое считывание с чашек культур бактерий. Обсуждается также роль ИИ в продвинутом анализе матричной лазерной десорбции-ионизации/время полета масс-спектрометрии (MALDI-TOF) и данных масс-спектрального спектра и данных о последовательности генома целых микробов. В будущем компьютеры и ученые клинических лабораторий будут более тесно сотрудничать для обеспечения оптимальной эффективности и качества лабораторной практики в области клинической микробиологии, и это тесное сотрудничество между человеком и машинами, как ожидается, улучшит уход за пациентами.

Edoardo Pasolli Department of Agricultural Sciences, University of Naples Federico II, Portici, Italy АннотацияМолочнокислые бактерии (LAB) являются фундаментальными в производстве ферментированных продуктов питания, а некоторые штаммы рассматриваются как пробиотики. Большое количество живых LAB используется в ферментированных продуктах, но пока неизвестно, в какой степени LAB, которые мы принимаем, становятся частью микробиома кишечника. Анализ 9445 метагеномов, взятых из человеческих образцов, показывает, что распространенность и обилие видов ЛАБ в образцах стула, как правило, низкая и связана с возрастом, образом жизни и географией, причем наиболее распространенными являются Streptococcus thermophilus и Lactococcus lactis. Кроме того, мы выявили различия между пищевыми и кишечными микробами, рассматривая 666 метагеномно-собранных геномов (MAGs), недавно реконструированных из ферментированных пищевых микробиомов, а также MAGs у 154 723 человека и 193 078 эталонных геномов. Наш широкомасштабный анализ генома в целом показывает, что тесно связанные LAB штаммы встречаются как в пищевой среде, так и в кишечной среде, и предоставляет беспрецедентные доказательства того, что ферментированные продукты питания действительно могут рассматриваться в качестве возможного источника LAB для микробиома кишечника.