microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Новости
Фаговая терапия: прошлое, настоящее и будущее
#фаговая терапия #бактериофаги
Если ничего не менять, то к 2050 году ожидается, что ежегодно 10 миллионов человек будут умирать от заболеваний, резистентных к лекарственным препаратам.    Посыл ясен: необходимо найти альтернативные методы лечения или столкнуться с реальностью, в которой когда-то излечимые инфекции становятся причиной смерти, которую можно было предотвратить.   Фаговая терапия предполагает использование фагов для лечения бактериальных инфекций. Фаги встречаются повсюду - от почвы до нашего кишечника, их существует тысячи различных видов. В отличие от многих антибиотиков, которые уничтожают вредные бактерии, одновременно разрушая микробиоту (что приводит к возникновению новых проблем), каждый фаг эволюционировал для более узкой направленности на штаммы или виды бактерий. Такая специфичность делает фаговую терапию привлекательной альтернативой для лечения инфекций, особенно вызванных бактериями с множественной лекарственной резистентностью (MDR).   Тем не менее, фаговая терапия в основном существует на задворках медицины, особенно в западных странах, таких как США, где она иногда одобряется для сострадательного применения (т.е. используется в чрезвычайных обстоятельствах, когда другие разрешенные методы лечения недоступны). Почему? И что должно произойти, чтобы фаговая терапия стала общепринятой? Ответы на эти вопросы кроются в скептическом отношении к истории, нормативным и производственным препятствиям и физиологическим особенностям самих фагов.Взлет и падение фаговой терапии на Западе   Фаговая терапия не является чем-то новым - ее истоки берут начало более 100 лет назад. Французско-канадскому микробиологу Феликсу д'Эрелле приписывают открытие и присвоение имени бактериофагам (хотя ведутся споры о том, кто был официальным первооткрывателем фага - д'Эрелле или британский микробиолог Фредерик Творт). В любом случае, использование д'Эрелле фагов для борьбы с бактериальными инфекциями дало толчок международным усилиям, в основном сосредоточенным в бывшем Советском Союзе, по проверке эффективности фаговой терапии для лечения брюшного тифа и холеры.    Первые исследования были многообещающими, хотя эксперименты часто были неправильно спланированы по современным стандартам (например, в них отсутствовали плацебо или контрольные группы). Результаты публиковались в неанглоязычных журналах, что делало их практически недоступными для западных ученых. Тем не менее, фаговая терапия не обошла стороной и США. В 1940-х годах несколько американских фармацевтических компаний выпускали фаговые препараты для лечения различных инфекций, включая инфекции верхних дыхательных путей и абсцессы.   Однако фаговая терапия в конце концов вышла из практики на Западе по нескольким причинам. Во-первых, ученые скептически относились к тому, насколько хорошо она работает. Неправильное хранение или очистка фагов, вероятно, сыграли свою роль. Например, ранние коммерческие препараты включали "консерванты", такие как фенол, который денатурировал и инактивировал фаги. Ученые также не понимали, что фаги являются высокоспецифичными для бактерий, против которых они направлены - фаговые препараты часто использовались для лечения бактериальных инфекций, которые не были восприимчивы к терапевтическому фагу (фагам).   Социальные факторы также были важны. После Второй мировой войны исследования и применение фаговой терапии продолжились в странах Восточной Европы, где они продолжаются и по сей день. Действительно, фаговая терапия до сих пор является обычной медицинской практикой в Грузии, Польше и России. Однако война заставила ученых в Западной Европе и США избегать фаговой терапии, учитывая ее тесную связь с бывшим Советским Союзом. Открытие пенициллина стало последним гвоздем в крышку гроба фаговой терапии - появление антибиотиков произвело революцию в лечении бактериальных инфекций и стало золотым стандартом во многих странах мира.Возрождение фаговой терапии   Однако за последнее десятилетие фаговая терапия пережила ренессанс в США, отчасти подстегиваемая растущей угрозой AMR. Стеффани Стратди, заместитель декана факультета глобальных наук о здоровье, соучредитель и содиректор Центра инновационного применения фагов и терапии (IPATH - первый специализированный центр фаговой терапии в Северной Америке) при Калифорнийском университете в Сан-Диего (UCSD), находится в авангарде развития фаговой терапии.   Приобщение Стратди к фаговой терапии обусловлено личным опытом. В 2015 году ее муж, доктор Том Паттерсон, профессор психиатрии в Медицинской школе UCSD, во время отпуска в Египте заразился смертельной инфекцией, вызванной MDR Acinetobacter baumannii. Никакие антибиотики не могли справиться с его инфекцией. Врачи в основном говорили: "Мы больше ничего не можем сделать"... И мы видели, как он угасал на наших глазах", - вспоминает Стратди.   Поскольку время поджимало, она прочесала Интернет в поисках чего-нибудь - чего угодно, - что могло бы спасти Паттерсона. Статья о фаговой терапии заинтересовала ее, и она предложила эту идею врачам Паттерсона, которые с одобрения Управления по контролю за продуктами и лекарствами США (FDA) согласились попробовать.    Для поиска фагов, способных убить штамм A. baumannii Паттерсона, команда прибегла к помощи исследователей из Центра фаговых технологий при Техасском университете A&M, а также ученых из ВМС США. Охота на фагов, которая включала в себя прочесывание уже существующих библиотек фагов (т.е. коллекций фагов, ранее выделенных из различных источников) и выделение новых фагов из сточных вод, отходов животноводства и даже трюмов кораблей ВМС, увенчалась успехом. После внутривенного введения фагового коктейля Паттерсону почти сразу стало лучше. Он полностью выздоровел и через 9 месяцев после поступления в больницу вернулся домой. Четыре года спустя Паттерсон и Стратди опубликовали книгу "Идеальный хищник", в которой описали эту историю.   Благодаря громкому делу Паттерсона исследования фаговой терапии оказались в центре внимания. За последние несколько лет в США и странах Западной Европы появляется все больше тематических исследований, подчеркивающих эффективность фаговой терапии для лечения различных MDR-инфекций, от легочных инфекций у больных муковисцидозом до инфекций мочевыводящих путей.Проблемы развития фаговой терапии   Тем не менее, хотя фаговая терапия больше не находится на задворках медицины в США, она не находится и на переднем крае. "Одна из главных причин, почему фаговая терапия сейчас не является основной на Западе, заключается в том, что клинические испытания не показали ее эффективность", - объясняет Стратди. Она отметила, что клинические испытания составляют основу разработки терапевтических препаратов в США - неофициальных доказательств и/или изучения конкретных случаев недостаточно.   Существует 2 типа фагов: литические и умеренные. Строго литические фаги инфицируют клетку-хозяина и вызывают ее разрушение, тем самым убивая бактерию. Умеренные, или лизогенные, фаги не убивают свою бактериальную жертву сразу - они интегрируют свой геном (который может содержать гены AMR или токсинов) в клетку хозяина. В конечном итоге фаг может лизировать клетку, но это мало что дает для немедленного предотвращения бактериальной инфекции и может способствовать распространению AMR и других генов вирулентности. Поэтому очень важно, чтобы для фаговой терапии использовались строго литические фаги. Литические фаги реплицируются внутри бактерий и лизируют клетку-хозяина сразу после сборки. В лизогенном цикле фаги интегрируют свой геном в геном клетки-хозяина.    Учитывая это, процесс выявления фагов для лечения инфекции может быть длительным. Он часто включает в себя тестирование фагов из существующих библиотек, чтобы найти те, которые убивают бактериальный изолят пациента. "Это все равно что [иметь] миллион ключей и пытаться разобраться в миллионе замков, чтобы понять, какой ключ подходит к замку", - объясняет Стратди. В одном из исследований сообщалось, что с момента запроса на фаговую терапию до фактического введения препарата пациенту проходит от 28 до 386 дней.   Однако в настоящее время разрабатываются препараты с более широким целевым диапазоном. Например, компания Locus Biosciences, занимающаяся разработкой фаговых биотерапевтических препаратов, производит фаговые коктейли для каждого из 4 различных патогенов (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa и Staphyloccocus aureaus), которые действуют на >95% клинических штаммов. Этот подход не требует культивирования изолята пациента и скрининга библиотеки нужных фагов, что может упростить процесс.   В отличие от антибиотиков, концентрация препарата в организме которых со временем снижается, фаги размножаются. Это означает, что доза фагового коктейля, которую вводят пациенту, не обязательно является той дозой, которую он получает. Как эта самовоспроизводящаяся особенность фаговых терапий влияет на эффективность лечения и возможность побочных эффектов, пока неизвестно. "[Нам нужны] фармакокинетические и фармакодинамические исследования, чтобы попытаться выяснить: окей, [если] вы доставите это количество фага, но этим конкретным путем, что дальше произойдет с фагом?"", - комментирует Стратди.    Аналогичным образом, исследователи должны подтвердить, "что [фаги] работают в той среде, в которой они должны работать", - говорит Ник Конли, вице-президент по технологиям компании Locus Biosciences. Например, если фаги используются для лечения инфекции мочевыводящих путей (ИМП), они должны быть активны в моче.   Существуют также важные аспекты с точки зрения производства. Например, для создания фаговых препаратов фаги усиливаются в бактериях-хозяевах - они заражают бактерии, бактерии лизируются и выделяют больше фагов для создания высококонцентрированного фагового бульона. Однако при лизисе "все внутренности бактерий выливаются наружу", - объясняет Конли. Это включает токсины и ДНК, а также другие компоненты клеток, которые должны быть удалены, прежде чем фаг можно будет, например, ввести в кровь человека.   Пациенты обычно получают смеси (коктейли) фагов, которые по-разному воздействуют на бактерии. Вероятность развития резистентности бактерий к нескольким фагам ниже, чем к одному фагу - ниже, но не исключается. Пациенты, получающие фаговую терапию, должны находиться под постоянным наблюдением, чтобы убедиться, что фаги по-прежнему эффективны против их инфекции. Если нет, исследователи должны найти новый набор фагов, способных бороться с патогеном.   Тем не менее, развитие резистентности не всегда плохо. В некоторых случаях модификации бактерий, способствующие развитию резистентности к фагам, повышают их восприимчивость к антибиотикам и, таким образом, работают синергетически с антибиотиками, повышая их эффективность.Будущее фаговой терапии   Несмотря на трудности, перспективы фаговой терапии многообещающие. Стратди подчеркнула, что FDA "в курсе" фаговой терапии и, по словам Конли, "очень вдумчиво и разумно" подходит к регулированию фаговых терапий. Национальные институты здравоохранения США (NIH) недавно выделили 2,5 миллиона долларов 12 институтам по всему миру на изучение фаговой терапии. Также проводятся клинические испытания, включая многоцентровое исследование фазы 1b/2, оценивающее микробиологическую активность одной дозы фаговой терапии у пациентов с муковисцидозом, хронически колонизированных P. aeruginosa. Кроме того, в июле 2022 года компания Locus начала исследование фазы 2/3, оценивающее безопасность, переносимость, фармакокинетику и эффективность фагового препарата для лечения острых неосложненных ИМП, вызванных MDR E. coli.   Ученые также изучают возможность оптимизации фаговых препаратов для создания более эффективных методов лечения. Компания Locus, например, разрабатывает фаговые терапевтические препараты, в которых используется технология CRISPR-Cas3. Фаги доставляют CRISPR-Cas3 своему бактериальному хозяину, который необратимо разрушает бактериальную ДНК. По сравнению с обычными фагами это обеспечивает более надежное уничтожение. Конли подчеркивает, что способность модифицировать фаги, в том числе с помощью многих других не-Cas полезных нагрузок, укрепляет их потенциал в качестве ключевого инструмента для борьбы с AMR в будущем.   По мнению Стратди, будущее фаговой терапии находится в руках следующего поколения ученых. Существует растущее сообщество молодых исследователей, "которые действительно взволнованы перспективами фаговой терапии". Именно это рвение в сочетании с сотрудничеством, увеличением финансирования и продвижением клинических испытаний станет ключом к тому, чтобы вывести фаговую терапию из тени. "Где есть желание, там есть и возможность".
Имеющиеся в настоящее время данные о паркинсонизме, индуцированном вирусами
#нейродегенеративные заболевания #вирусные инфекции #болезнь паркинсона #covid-19
В то время как опасения по поводу COVID-19 в значительной части мира ослабевают, возникают новые опасения по поводу его долгосрочных последствий.     Среди них - опасения, что может увеличиться распространенность двигательных расстройств, в частности паркинсонизма. Новый обзор, опубликованный в Journal of Neural Transmission, пытается обобщить все известное о связи между вирусными заболеваниями и паркинсоническими расстройствами, чтобы облегчить дальнейшие исследования.    Двигательные расстройства после вирусного заболевания являются одним из наиболее распространенных типов вторичных двигательных расстройств, проявляющихся чаще всего в виде дистонии у детей и паркинсонизма у взрослых. Например, летаргический энцефалит и постэнцефалитный паркинсонизм возникли после пандемии испанского гриппа (грипп A H1N1) сто лет назад.   Болезнь Паркинсона (БП) также наблюдалась после заражения гриппом, простым герпесом, гепатитами В и С. Патофизиология вторичной БП неизвестна, но она может быть вызвана немедленным или отсроченным повреждением нейронов. В первом случае параинфекционный паркинсонизм развивается в течение 15 дней после заражения. Это может быть вызвано вторжением нейротропного вируса в нигростриатные пути, который внедряется и реплицируется в нейронах, вызывая их разрушение. Такие вирусы могут попасть в центральную нервную систему (ЦНС) по нервам, преодолев гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) или через барьер кровь-цереброспинальная жидкость.   Альтернативно, косвенное повреждение может быть вызвано воспалением с активацией микроглии. Это приводит к выработке воспалительных химических веществ и активации Т-клеток. В результате повышения уровня цитокинов происходит повреждение сосудов, что снижает поступление кислорода к нейронной ткани, вызывая гипоксическое повреждение мозга.   Отсроченный или постинфекционный паркинсонизм может возникнуть в результате аутоиммунитета, вызванного генерализованной иммунной активацией или аберрантным нацеливанием иммунной системы хозяина на конкретный антиген. Такие реакции могут быть результатом молекулярной мимикрии, как при простом герпесе, когда антигены хозяина и вируса имеют сходные структуры, что приводит к активации Т- и В-клеток против обоих.   Другим возможным механизмом является активация сторонних клеток. В этом случае активированные вирусом Т-клетки атакуют инфицированные клетки, экспрессирующие вирусные пептиды, вызывая высвобождение цитокинов, таких как оксид азота (NO), фактор некроза опухоли (TNF) или лимфотоксин (LT). Они убивают не только инфицированную клетку, но и близлежащие здоровые клетки - этот процесс называется "убийством сторонних наблюдателей".    Наряду с этим иммунный ответ начинает нацеливаться не только на исходные пептиды (эпитопы) антигенной мишени, но и на соседние пептиды или даже эпитопы других антигенов. Такое "расширение эпитопов" приводит к более широкому воспалительному ответу. Наконец, хроническая инфекция в организме хозяина приводит как к расширению эпитопов, так и к независимому запуску В- и Т-клеток, вызывая аутоиммунитет, длительную иммунную активацию и хроническое воспаление. Неврологическое повреждение более вероятно при таком сценарии.ВИЧ и БП   По оценкам, ВИЧ инфицировано почти 40 миллионов человек, склонных к опасным для жизни оппортунистическим инфекциям, если их не лечить должным образом и не поддерживать на высокоактивной антиретровирусной терапии. Заболевание характеризуется разрушением именно Т-клеток CD4, причем уровень этих лимфоцитов пропорционален вирусной нагрузке. Сообщается о раннем поражении ЦНС, при этом вирус проникает в мозг через инфицированные лейкоциты ("троянский конь") или в виде свободных вирусных частиц в инфицированных эндотелиальных клетках. Затем вирус поражает нейроны, а также поддерживающие их глиальные клетки.   При ВИЧ паркинсонизм проявляется рано, не реагирует на стандартное лечение и имеет необычные особенности, особенно ранний выраженный постуральный тремор. Заметное повреждение базальных ганглиев может вызвать паркинсонизм и другие признаки энцефалопатии, обусловленной ВИЧ. Акинетическая ригидность часто провоцируется антагонистами дофамина.   При развернутом синдроме приобретенного иммунодефицита у пациента с паркинсонизмом часто также наблюдаются признаки деменции, судороги и поражение белого вещества, а также периферических нервов. Прогноз плохой из-за характерной и тяжелой дегенерации нигральной области.Вирус Западного Нила (WNV) и БП   За последние 20 лет WNV вызвал многочисленные вспышки заболевания, вызывая легкую лихорадку после инкубационного периода продолжительностью от 2 дней до 2 недель. У 1% пациентов проявляются острые неврологические симптомы, такие как менингит или энцефалит, подострый вялый паралич и множественные двигательные нарушения. Такие пациенты часто бывают пожилыми, злоупотребляют алкоголем или имеют в анамнезе трансплантацию органов.   Путь, по которому вирус попадает в мозг человека, неизвестен, но, возможно, через нарушенный ГЭБ в ответ на вызванные вирусом воспалительные цитокины, вырабатываемые на периферии. Также возможен ретроградный аксональный транспорт или перенос вируса эндотелиальными клетками.   Вирусная инфекция приводит к гибели нейронов. Двустороннее разрушение глубоких ядер серого вещества, особенно substantia nigra, для которых вирус является специфически нейротропным, вероятно, является причиной паркинсонизма у некоторых пациентов. Хотя большинство симптомов обычно проходят спонтанно, тремор может сохраняться в одном из десяти случаев, приводя к инвалидности.Вирус японского энцефалита В (JEV) и БП   В отличие от других флавивирусов, JEV вызывает неврологические повреждения, включая двигательные нарушения, вялый паралич или судороги, во многих случаях приводящие к пожизненной инвалидности. После укуса ребенка комаром-переносчиком Culex вирус попадает в кровоток и инфицирует ЦНС через эндотелиальные клетки сосудистой сети ЦНС или через нарушенный воспаленный ГЭБ.   Прямое и воспалительное повреждение вызывает нейрональный апоптоз в дофаминергических нейронах многочисленных областей мозга, включая таламус, базальные ганглии, средний мозг и мозжечок. Трансмиссия дофамина и норадреналина нарушается, что вызывает характерные двигательные нарушения, вызванные JEV, примерно через 2-6 недель после острой энцефалитической фазы. Паркинсонизм, обусловленный JEV, включает брадикинезию, ригидность, маскообразное лицо и гипотонию, большинство из которых проходят в течение 3 недель, за исключением некоторых пациентов, у которых наблюдается постоянная утрата силы голоса.Грипп и БП   Постэнцефалитный паркинсонизм (ПЭП) или летаргический энцефалит (ЛЭ) - это загадочный постинфекционный феномен. Первоначально он представлялся как совокупность неврологических нарушений с различными проявлениями, включая гриппоподобные симптомы, сонливость, проблемы с движениями глаз и двигательные нарушения в большинстве случаев. Вместе с тем, может возникнуть практически любой вид неврологических симптомов. В основе заболевания лежит диффузная атрофия мозга, выраженная потеря нейронов и глиоз, затрагивающий substantia nigra, с нейрофибриллярными слияниями.   Многие типы вируса гриппа А после системной инфекции проникают в нервную систему и поражают субстанцию нигра и гиппокамп. Это приводит к воспалению ЦНС с образованием белковых агрегатов и дегенерации в дофаминергическом pars compacta substantia nigra. Как правило, все это проходит, но постоянная микроглиальная активация и нейровоспаление, по-видимому, сохраняются, что позволяет предположить аутоиммунный процесс.   Интервал от заболевания до ПЭП растягивается от нескольких месяцев до нескольких лет, при этом наиболее распространенным проявлением является акинетическая ригидность. В некоторых случаях наблюдался положительный ответ на терапию леводопой.Другие поствирусные паркинсонизмы и БП   Коксаки, западный лошадиный энцефалит, вирус Эбштейн-Барра (EBV), цитомегаловирус (CMV), полиовирус и простой герпес также ассоциируются с паркинсонизмом. Между тем, и другие вирусы связаны с повышенным риском развития симптомов паркинсонизма.   Помимо ПЭП, H1N1 может вызывать образование агрегатов α-синуклеина, подавляя образование аутофагосом, что способствует формированию белков неправильной формы. Эпитоп α-синуклеина, по-видимому, вовлечен в большинство поствирусных энцефалопатий, вероятно, через подавление аутофагических механизмов, которые обычно очищают организм от токсичных белковых остатков и предотвращают нейродегенерацию.   Несколько исследований показали более высокий риск развития идиопатической БП после диагностирования гриппа, что подтверждает роль вируса.   Инфицирование вирусом гепатита С (HCV) также связано с повышенным риском развития БП, хотя эта связь остается неясной, и риск развития БП может быть обусловлен скорее заболеванием печени, чем вирусным поражением. Это подтверждается тем, что неалкогольный стеатогепатит также является фактором риска БП. Другие исследования показали серьезное воспалительное повреждение после заражения HCV, которое, возможно, провоцирует БП. Еще одна возможность - нарушение дофаминергической функции из-за изменения работы транспортеров.   В случае с EBV также предполагается вирусная репликация, нарушение BBB, воспаление и повреждение нейронов, а некоторые исследователи считают, что патофизиологическим механизмом является аутоиммунитет.Паркинсонизм и COVID-19   Пациенты с БП часто имеют респираторные проблемы из-за ригидности мускулатуры грудной стенки, препятствующей свободному дыханию, а также из-за аномальной позы и ослабленного кашлевого рефлекса. Это делает их более уязвимыми к тяжелому заболеванию в случае инфицирования SARS-CoV-2. Фактически, до 40% пожилых пациентов с БП умирают от этого заболевания, особенно те, у кого более длительная история болезни, и те, кому во время лечения требуется ИВЛ или другие аппаратные средства.   COVID-19 также связан с ухудшением мышечных функций у пациентов с БП в дополнение к вышеописанному острому ухудшению. Им может потребоваться увеличение дозы анти-ПД препаратов, и они сообщают о затуманенности сознания, усталости, ухудшении функции памяти и нарушении сна.   Было зарегистрировано несколько случаев паркинсонизма, возникшего после инфекции SARS-CoV-2, без предшествующего семейного анамнеза. В большинстве случаев этому признаку предшествовала энцефалопатия, и лишь некоторые из них реагировали на агонисты дофамина. В других случаях были выявлены гипоксия, осмотическая демиелинизация, вызванная гипергликемией, и инсульт базальных ганглиев, а несколько случаев произошли на фоне приема нейролептиков. Это, возможно, объясняет вторичный паркинсонизм.
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up