microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Новости
Аннотация
Последние достижения в области изучения свойств и применения экзосом, продуцируемых Lactobacillus (аннотация)
#пробиотики #внеклеточные везикулы #экзосомы #новые антимикробные препараты #лактобациллы #лактобактерии #lactobacillus
Лактобациллы - это группа грамположительных бактерий, широко распространенных как в организме человека, так и за его пределами, которые вырабатывают молочную кислоту, ферментируя лактозу и другие углеводы.     Они широко изучаются и применяются в качестве важнейшего пробиотика в пищевой промышленности, животноводстве и здравоохранении. Их пробиотические эффекты включают укрепление здоровья кишечника, повышение иммунитета и регулирование баланса кишечной флоры. Более того, экзосомы, выделяемые молочнокислыми бактериями, привлекают все большее внимание как новый тип биологических агентов.    Экзосомы вырабатываются различными организмами, такими как бактерии, грибы, растения и животные, и участвуют во множестве биологических процессов, включая клеточную сигнализацию, заражение патогенными микроорганизмами и иммунную регуляцию. По мере того как постепенно признается их важность, все большее внимание привлекает их применение в медицине, сельском хозяйстве и других областях. В настоящее время изучение экзосом стало одной из горячих точек в области биологии. В данном обзоре мы рассмотрим последние достижения в области свойств и функций экзосом Lactobacilli, методы их выделения и получения, инженерные модификации, а также их применение.    Подобно структуре экзосом из других источников, экзосомы, продуцируемые Lactobacillus, представляют собой внеклеточные везикулы, которые секретируются Lactobacillus и имеют диаметр от 20 до 400 нм, обычно состоят из одного или нескольких липидных слоев, обернутых в структуру, сходную с клеточной мембраной. Эти экзосомы содержат разнообразные биологически активные компоненты, такие как белки, полисахариды и липиды. Белки экзосом являются важными компонентами и состоят из различных ферментов и структурных белков. Ферменты играют важную роль в расщеплении пищи и регулировании флоры в кишечнике. Полисахариды в экзосомах также являются важнейшими компонентами, способствующими пролиферации и дифференцировке клеток слизистой оболочки кишечника и укрепляющими кишечный иммунитет. Нуклеиновые кислоты в экзосомах выполняют важные биологические функции как носители РНК, способные передавать информацию и влиять на экспрессию генов в организме хозяина.    Экзосомы, выделяемые молочнокислыми бактериями, вызывают значительный интерес благодаря своим потенциальным иммуномодулирующим эффектам. В частности, было обнаружено, что экзосомы молочнокислых бактерий оказывают противовоспалительное, антибактериальное, противовирусное и иммуноукрепляющее действие. Эти биоактивные молекулы вовлечены в несколько механизмов, которые модулируют иммунную систему хозяина. Экзосомы в первую очередь активируют такие клетки, как макрофаги, дендритные клетки, Т-клетки и В-клетки.    Некоторые экзосомы, производимые Lactobacillus, показали многообещающие противоопухолевые и антивирусные свойства, потенциально снижающие возникновение опухолей и вирусных инфекций. Lactobacillus gasseri и Lactobacillus jensenii были идентифицированы как особенно эффективные в стимулировании выработки IFN-γ мононуклеарными клетками периферической крови человека. Таким образом, экзосомы молочнокислых бактерий обладают широким спектром иммуномодулирующих эффектов, усиливая иммунные реакции кишечника и уменьшая воспалительные и аллергические реакции в кишечнике. Будущие исследования должны изучить механизм действия экзосом, производимых Lactobacillus, на иммуномодуляцию и разработать их применение для профилактики и лечения заболеваний, связанных с иммунитетом. Защита кишечника и микроэкологический баланс    Экзосомы лактобацилл являются важным пробиотическим метаболитом, который играет ключевую роль в поддержании защиты кишечника и микроэкологического баланса. Экзосомы действуют через различные механизмы, поддерживая микроэкологический баланс в кишечнике, регулируя микробный состав кишечника и поддерживая стабильность кишечной микросреды. Например, некоторые белки в экзосомах, произведенных Lacticaseibacillus rhamnosus GG, могут конкурентно связываться с поверхностью кишечника, уменьшая адгезию патогенных бактерий и ослабляя воспалительный ответ в кишечнике.     Экзосомы содержат биологически активные вещества, регулирующие микробиом кишечника, такие как внеклеточные ферменты, антибиотики, противомикробные препараты, антибиотические ферменты, белки-переносчики железа, β-глюкан, siRNA и полисахариды, которые могут влиять на тип и количество кишечной флоры, улучшать рост и метаболизм пробиотиков в кишечнике, а также поддерживать здоровье кишечника.    Исследования показали, что экзосомы, произведенные Lacticaseibacillus rhamnosus GG, могут повышать целостность слизистого барьера кишечника, регулировать активность иммунных клеток в кишечнике, улучшать иммунную функцию кишечника и сопротивляемость заболеваниям. Кроме того, специфические компоненты экзосом, произведенных Lacticaseibacillus rhamnosus GG (такие как белки, полисахариды и т.д.), могут взаимодействовать с эпителиальными клетками кишечника и регулировать их пути передачи сигналов, тем самым влияя на целостность слизистого барьера кишечника и баланс иммунного ответа. Некоторые белки экзосом индуцируют пролиферацию и дифференцировку иммунных клеток, а молекулы нуклеиновых кислот усиливают функцию кишечного барьера, связываясь с Toll-подобными рецепторами на эпителиальных клетках кишечника.    Недавние исследования на мышах показали, что внеклеточные везикулы Lactobacillus plantarum Q7 усиливают барьерные функции слизистой оболочки кишечника и уменьшают воспаление и аллергические реакции. Они эффективно облегчали симптомы колита, снижали уровень провоспалительных цитокинов и корректировали дисбиоз микробиоты кишечника, увеличивая количество противовоспалительных Bifidobacteria и Muribaculaceae и уменьшая количество Proteobacteria, что демонстрирует их потенциал в поддержании здоровья кишечника.     Другие эксперименты показали, что экзосомы нескольких штаммов Limosiactobacillus reuteri способствуют пролиферации и дифференцировке Т-клеток и стимулируют мононуклеарные клетки периферической крови и кишечные макрофаги к высвобождению воспалительных цитокинов, в частности IL-6 и IL-1β. Они также оказывают модулирующее действие, подавляя секрецию IFN-γ и снижая секрецию TNF-α, которые обычно индуцируются Staphylococcus aureus. Применение экзосом, вырабатываемых лактобактериями    Экзосомы, произведенные лактобациллами, были исследованы на предмет их терапевтического применения при целом ряде заболеваний. Например, было показано, что они обладают противовоспалительным и иммуномодулирующим действием, что делает их привлекательными кандидатами для лечения аутоиммунных и воспалительных заболеваний. Благодаря потенциальному присутствию гетерологичных белков в экзосомах, произведенных Lactobacillus, их пероральное применение является идеальным способом доставки.     В исследовании на мышиной модели колита было обнаружено, что экзосомы при пероральном введении значительно облегчают воспаление толстой кишки, способствуют восстановлению тканей и улучшают функцию кишечного барьера, что полезно при с целом ряде заболеваний, таких как синдром раздраженного кишечника и воспалительные заболевания кишечника. Эти данные позволяют предположить, что экзосомы, продуцируемые Lactobacillus, могут иметь потенциальное терапевтическое применение. Кроме того, было установлено, что экзосомы, выделяемые лактобактериями, регулируют ось "кишечник-мозг", которая представляет собой двунаправленную систему связи между кишечником и центральной нервной системой и участвует в регуляции ряда физиологических функций, таких как настроение и аппетит у человека.    Несмотря на потенциал экзосом, производимых Lactobacillus, все еще существует ряд проблем, которые необходимо решить. Например, выделение и очистка экзосом, еще не полностью оптимизированы. Кроме того, механизмы действия экзосом in vivo не до конца понятны, и их долгосрочная безопасность нуждается в дальнейшем изучении.    Инженерия экзосом Lactobacilli подразумевает создание экзосом с определенными функциями с помощью методов редактирования генов и их трансформации. Существует два основных аспекта инженерии экзосом Lactobacilli: модификация бактерий для получения большего количества или более эффективных экзосом и генетическая или химическая модификация уже выделенных экзосом для придания им новых или улучшенных функций. Исследователи использовали методы рекомбинантной генной инженерии для вставки генов, связанных с экзосомами, в геном клеток, чтобы улучшить производство экзосом. Кроме того, они оптимизировали условия культивирования молочнокислых бактерий для улучшения производства экзосом. Для модификации экзосом использовались методы редактирования генов для имплантации специфических пептидных последовательностей на поверхность экзосом, чтобы придать им специфическую способность к распознаванию и связыванию. Химические методы модификации также используются для добавления молекул, таких как полисахариды и пептиды, чтобы усилить их биологическую активность.    Инженерия экзосом может быть также применена для создания новых вакцин. Например, исследователи интегрировали ген белка вируса папилломы человека E7 в последовательность ДНК L. lactis, что привело к улучшению иммунопротекторного эффекта в экспериментах на мышах, что подразумевает перспективность экзосом Lactobacilli в качестве носителя вакцин.    Несмотря на все преимущества, исследования и применение экзосом лактобацилл по-прежнему остаются сложными. Во-первых, методы выделения и очистки этих экзосом еще не совершенны и требуют оптимизации для повышения их выхода и чистоты. Во-вторых, сложная и гетерогенная структура и состав экзосом, производимых Lactobacillus, требуют более полного анализа их структурных и функциональных взаимосвязей для раскрытия механизма их действия в живых организмах. Кроме того, необходимы дополнительные исследования для оценки механизмов доставки лекарств, распределения в естественных условиях, метаболизма и долгосрочной безопасности экзосом.     В заключение следует отметить, что исследования экзосом лактобацилл представляют собой многообещающее направление, однако для реализации их потенциала необходимо провести значительное количество фундаментальных и клинических исследований. Кроме того, необходимо укрепить стандартизированные протоколы производства и контроля качества экзосом, производимых лактобациллами, чтобы обеспечить их безопасное и эффективное применение.
Исследуя микробную "темную материю"
#новые технологии #микробные метаболиты #микробиом #метаболомика
Поисковая система с открытым исходным кодом помогает ученым определить сотни микробных метаболитов за считанные секунды.    Микроорганизмы, составляющие более 15% биомассы Земли, колонизировали планету от полюса до полюса, воздействуя на экологию с помощью производимых ими метаболитов. В связи с их повсеместным распространением и важностью для окружающей среды, исследователи пытаются точно идентифицировать микробные метаболиты в полевых и лабораторных условиях. Публичные базы данных могут помочь ученым расшифровать некоторые микробные молекулы, но они часто ограничены хорошо изученными видами.    Чтобы высветить "темную материю" микробов, исследователи разработали инструмент для поиска микробных масс-спектров (microbeMASST), который позволяет обнаружить сотни микробных метаболитов за один раз, сравнивая образцы с общедоступными записями более чем 60 000 микробных культур. Первоначально разработанный для изучения микробов океанов, microbeMASST применяется сейчас для изучения микробиома человека, чтобы изучить его влияние на заболевания. О своих результатах исследователи сообщили в журнале Nature Microbiology.    "Это новое исследование дает возможность рассматривать молекулы в экологическом контексте", - комментирует Роджер Линингтон, химик-аналитик из Университета Саймона Фрейзера, который не участвовал в исследовании, но в прошлом сотрудничал с некоторыми из авторов. "Традиционно ученые занимались изучением микроорганизмов по отдельности и выделяли отдельные молекулы". Линингтон отметил, что это затрудняло идентификацию микробов, производящих тот или иной метаболит.    Ученые редко получают полное представление о микробном метаболоме. Например, исследователи подозревают, что кишечные бактерии производят большую часть метаболитов в пищеварительном тракте, поскольку они обладают примерно в 100 раз большим количеством генов, чем геном человека. Когда ученые собирают образцы кала они обычно могут определить только 10% метаболитов. "Процент действительно микробных молекул из этих 10% составляет менее 1%", - поясняет Симона Зуффа, специалист по вычислительной биологии из Калифорнийского университета и соавтор исследования.    В некоторых экосистемах расшифровка микробной активности становится еще сложнее. Анелиз Бауэрмейстер, морской микробиолог из Калифорнийского университета и также соавтор исследования, изучает морские микроорганизмы, в том числе те, которые колонизируют коралловые рифы. "Найти метаболиты в морских микробах очень сложно, потому что их трудно собрать и культивировать в лаборатории", - говорит она.    Когда Бауэрмейстер научилась культивировать этих обитающих в океане существ, ей было трудно не просто определить, кто производит метаболиты - микробы, кораллы или другие подводные источники. Стремясь решить эту проблему, она и ее коллеги начали разработку microbeMASST, инструмента для определения того, какие метаболиты были получены от микробов в образцах, взятых из различных сред. Надеясь охватить разнообразных микробов в своем поисковом методе, группа собрала данные метаболомики, полученные от микробов, обнаруженных в организме животных, людей, озер, океанов, растений и почв.     Они решили протестировать microbeMASST на лабораторных мышах. В организме мышей клетки и обитающие в них микробы производят метаболиты, но microbeMASST обнаруживает те, которые производятся исключительно микробами. Ученые проанализировали массив данных, содержащий метаболиты из целого ряда органов и биологических жидкостей, включая мозг, сердце, печень, кровь и фекалии как нормальных, так и безмикробных мышей. Поскольку у безмикробных мышей отсутствуют микробы, Зуффа предположила, что любые метаболиты, обнаруженные у нормальных мышей, но отсутствующие у безмикробных, должны быть созданы микробами. Используя этот подход, они выявили 1 673 метаболита, производимых исключительно бактериями и грибками, живущими в организме мыши.    "Если они действительно являются производными микроорганизмов, то должны наблюдаться и в других исследованиях", - рассказывает ход своих мыслей Зуффа. Чтобы проверить достоверность своих выводов, исследователи сравнили нормальных мышей с мышами, получавшими антибиотики. В новом анализе был обнаружен 621 аналогичный метаболит, из которых 512 были характерны только для мышей, не получавших антибиотики. Этот метод служит отправной точкой для поиска микробных метаболитов, но для подтверждения того, что эти молекулы действительно происходят от микробов, необходимы дальнейшие биохимические анализы микроорганизмов, культивируемых в лаборатории.    microbeMASST может оказаться ценным для исследований микробиома человека, изучающих роль, которую микробы и их метаболиты играют в здоровье и заболеваниях. Используя человеческие данные, Зуффа и ее коллеги сравнили образцы здоровых людей и людей с различными заболеваниями, включая воспалительные заболевания кишечника, которые часто связаны с нарушениями в микробиоме. В этих образцах они обнаружили 455 из тех же 512 микробных соединений, которые были выявлены в данных по мышам, что позволяет предположить, что этот поисковый инструмент также может отслеживать сотни микробных молекул в человеческом организме.    Как и в случае с мышами, они исследовали целый ряд органов и биологических жидкостей, но полученные результаты не обязательно указывали на то, что микробы присутствуют во всех этих местах. Скорее, они указывали на то, что микробные метаболиты, вырабатываемые в кишечнике, могут распространяться по всему организму и вызывать системные эффекты.    Несмотря на этот прорыв в изучении микробных метаболитов, многие молекулы пока остаются темной материей. Инструмент поиска ограничен общедоступными данными метаболомики, что создает узкое место в поиске микробов и метаболитов. Однако Линингтон надеется, что этот метод подтолкнет научное сообщество к открытому доступу к своим данным.    Еще одно ограничение связано с тем, как ученые собирают данные метаболомики. Как правило, они используют масс-спектрометр для ионизации метаболитов в заряженные фрагменты, а затем измеряют их массу и заряд, чтобы разгадать код их химической структуры. "Не все молекулы одинаково легко обнаружить с помощью масс-спектрометрии, потому что различные структуры соединений имеют разную склонность к ионизации в приборе", - пояснил Линингтон, поэтому некоторые метаболиты остаются незамеченными.    Выйдя за рамки микробов, исследователи планируют создать другие поисковые инструменты, которые облегчат поиск метаболитов в других формах жизни. "Мы разрабатываем версию для растений под названием plantMASST, которая подскажет вам, действительно ли определенные молекулы производятся конкретными растениями", - рассказала Зуффа.
Картинка 1
Виртуальные вирусы раскрывают сложную геномную динамику
#структурная вирусология #новые технологии #компьютерное моделирование #вирусология
Картинка 1
Микробы в разлагающихся телах помогают в проведении судебно-медицинских расследований
#судебно-медицинская микробиология #микробная криминалистика
Картинка 1
Аннотация
Резистентность Pseudomonas aeruginosa к антимикробным препаратам: клинические последствия, современные тенденции резистентности и инновации в терапии (аннотация)
#наночастицы #моноклональные антитела #многоцелевые антигены #нановакцины #адьюванты #эндолизин #фаговая терапия #вакцина #антимикробные пептиды #природные антимикробные вещества #факторы вирулентности #противомикробные препараты #новые антимикробные препараты #механизмы резистентности #колонизация больничных поверхностей #колонизация #биопленко-ассоциированные инфекции #биопленки #бактериальная резистентность #антибиопленочная активность #pseudomonas aeruginosa #mdr
Картинка 1
Анализ социальных сетей выявляет объекты, подверженные риску передачи KPC-CRE
#социальные сети #эпидемиологический анализ #полногеномное секвенирование #klebsiella pneumoniae
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up