microbius
РОССИЙСКИЙ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
Поиск
rss

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2Vtzqx7tLnC

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqwzYS9e

Реклама

ООО "АЛИФАКС"

ИНН 7718314415

ID 2VtzqvtsLHv

Реклама

Новости

Новости
Аннотация
Детекция SARS-CoV-2 с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией: анализ ложноположительных результатов и рекомендации по мерам контроля качества (аннотация)
#ложноположительные результаты #тестирование #рт-пцр #sars-cov-2
Тестирование на SARS-CoV-2 стало важнейшим компонентом управления пандемией COVID-19.     В настоящее время преобладающим методом тестирования является полимеразная цепная реакция с обратной транскриптазой (RT-PCR). Меры контроля качества используют известные положительные и известные отрицательные контроли для обеспечения адекватности этапов экстракции и RT-PCR, но не оценивают все компоненты тестирования. Мы провели анализ обеспечения качества нашего RT-PCR тестирования на COVID-19, чтобы определить частоту ложноположительных результатов у бессимптомных пациентов и причины этих ошибок. Дизайн   Мы разработали процедуру контроля качества, в рамках которой все образцы от бессимптомных лиц с положительной реакцией на SARS-CoV-2 тестировались повторно. Если второй тест был отрицательным, проводился третий тест и проводился анализ первопричины ошибочного результата. Результаты   За исследуемый период было протестировано 24 717 образцов, 6251 образец был получен от бессимптомных пациентов. Из 288 первоначально положительных тестов 20 (6,9%) были отрицательными при повторном тестировании. Был проведен анализ кривых порога цикла, записей технологов, расположения образцов на планшетах для тестирования и взаимосвязи с образцами с высокой вирусной нагрузкой. Анализ показал, что ошибки технологов (неправильное расположение образца в тест-планшете или контаминация) и перекрестная контаминация от образцов с высокой вирусной нагрузкой в соседних лунках тест-планшетов были распространенными причинами ложноположительных результатов. Обсуждение   Тестирование SARS-CoV-2 RT-PCR связано с небольшим количеством ложноположительных результатов, которые легче всего распознать у бессимптомных пациентов. Внедрение ограниченного протокола повторного тестирования выявляет клинически значимые ошибки тестирования и позволяет пересмотреть и улучшить лабораторные процедуры.
Когда внутренняя экосистема кишечника нарушается, может ли древнее, хотя и грубо звучащее лечение исправить ситуацию?
#фекальная трансплантация #фекальная микробиота #c. difficile
Исследователи лемуров приводят доводы в пользу фекальной трансплантации для снижения побочных эффектов антибиотиков.    После поездки на Мадагаскар в 2014 году ветеринар Кэти Уильям несколько недель чувствовала себя не в своей тарелке. Сначала она просто чувствовала вздутие живота и дискомфорт и почти не хотела есть. Но в конце концов у нее поднялась температура и начался озноб, что привело ее в отделение неотложной помощи. Когда она прошла обследование, врачи обнаружили, что у нее не просто желудочная инфекция. Она страдала от инфекции Clostridium difficile, бактерии, которая вызывает сильную диарею и боли в животе и может быстро стать опасной для жизни, если не начать своевременное лечение.   Это состояние часто возникает, когда антибиотики нарушают нормальный баланс бактерий, населяющих кишечник, позволяя "плохим" бактериям, таким как C. difficile, бесконтрольно размножаться и сеять хаос в кишечнике. Чтобы взять инфекцию под контроль, Уильямс обратилась к своим врачам с просьбой попробовать метод, который она и другие ветеринары десятилетиями использовали для лечения лемуров с проблемами пищеварения в Центре лемуров Дьюка. Эта процедура, известная как пересадка фекальной микробиоты, предполагает забор кала у здорового донора и введение его пациенту, чтобы вернуть "хорошие" микробы и восстановить работу кишечника.    В то время метод считался слишком экспериментальным для клинического применения в таких случаях, как у Уильямс. Ей назначили стандартное лечение и отправили домой из больницы, хотя еще месяц она не чувствовала себя достаточно хорошо, чтобы вернуться на работу. Но теперь новое исследование на лемурах подтверждает то, о чем Уильямс и другие давно подозревали: этот древний, хотя и грубо звучащий метод лечения может помочь нарушенному микробиому кишечника прийти в норму.   В недавнем исследовании, опубликованном в журнале Animal Microbiome, исследовательская группа изучила микробиом кишечника 11 здоровых кольцехвостых лемуров в течение четырех месяцев после семидневного курса приема антибиотика широкого спектра действия амоксициллина. Лемуры были разделены на две экспериментальные группы. Одна группа была наблюдательной, за ней продолжалось наблюдение, но никакого лечения после приема антибиотиков не проводилось. Другой группе давали суспензию из собственных фекалий, собранных до начала лечения антибиотиками, а затем смешанных с физраствором и скормленных тем же животным после окончания курса антибиотиков.    "Это звучит безумно", - говорит Уильямс. Но она использует подобную процедуру с 1990-х годов для лечения заболеваний у лемуров, чьи младенцы, как известно, едят какашки своей матери во время отлучения от груди - предположительно, чтобы получить микроорганизмы, необходимые им для перехода к твердой пище.   Исследователи использовали методы генетического секвенирования для отслеживания изменений в микробиоме кишечника лемуров до, во время и после лечения. Как и ожидалось, даже один курс антибиотиков привел к резкому снижению количества бактерий в их кишечнике по сравнению с контрольной группой, на короткое время уничтожив видовое разнообразие в обеих экспериментальных группах, а затем вернув его к исходному уровню. "Антибиотики оказывали драматическое воздействие даже на здоровых животных, - говорит соавтор работы Кристин Дреа.    Но с точки зрения того, какие типы бактерий и когда возвращались обратно, модели восстановления в двух группах были разными. Лемуры, получившие "суп из какашек", начали стабилизироваться и возвращаться к своему микробиому до антибиотика примерно через две недели. В отличие от них, состав бактерий в группе выжидания продолжал колебаться, и даже после четырех месяцев наблюдений он все еще не пришел в норму.    Подобная терапия не нова. Сообщения об использовании пересадки кала для лечения людей, страдающих пищевым отравлением или диареей, появились еще в Китае в четвертом веке. Доказательства его эффективности в неволе заставили Дреа выступить за замораживание образцов кала в Смитсоновском национальном зоопарке, где она сейчас работает постдокторантом. "Если мы сможем хранить фекалии животных, когда они здоровы, это может принести огромную пользу в будущем", - говорит Дреа. "Это может помочь животным быстрее выздороветь". И теперь, если кто-то из ее пациентов-лемуров заболеет C. difficile, как она, говорит Уильямс, "я бы обязательно сделала пересадку микробиоты кала".   "Людей это отталкивает, - говорит Дреа, - но отвращение к этому подходу, возможно, на самом деле препятствует созданию довольно дешевого и полезного лекарства".
Узнайте о новостях и событиях микробиологии
Первыми получайте новости и информацию о событиях
up